74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2064 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1900  hypothetical protein  92.69 
 
 
506 aa  818    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.236121  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2064  hypothetical protein  100 
 
 
504 aa  950    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.738392  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1979  hypothetical protein  96.84 
 
 
507 aa  840    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0380976  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1959  hypothetical protein  64.39 
 
 
488 aa  489  1e-137  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.159459  normal  0.917261 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3717  hypothetical protein  41.41 
 
 
559 aa  289  9e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.912056 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4392  tetratricopeptide TPR_4  43.09 
 
 
498 aa  266  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0572051  normal  0.357781 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3596  hypothetical protein  37.84 
 
 
498 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3662  hypothetical protein  37.88 
 
 
503 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3595  hypothetical protein  38.28 
 
 
529 aa  237  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3736  hypothetical protein  39.76 
 
 
505 aa  227  4e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0978251  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3737  hypothetical protein  43.63 
 
 
219 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.204673  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  41.67 
 
 
667 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2609  hypothetical protein  28.35 
 
 
265 aa  55.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 
505 aa  55.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  31.62 
 
 
448 aa  53.9  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1620  hypothetical protein  27.32 
 
 
265 aa  53.9  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0022  hypothetical protein  27.82 
 
 
529 aa  53.5  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.575522  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0618  hypothetical protein  26.58 
 
 
325 aa  52.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.13205  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  32.31 
 
 
550 aa  51.6  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  36.76 
 
 
1079 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  23.56 
 
 
583 aa  52  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.83 
 
 
810 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  29.03 
 
 
865 aa  51.2  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2356  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.41 
 
 
359 aa  50.4  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.337618  normal  0.0354802 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 
878 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.89 
 
 
632 aa  50.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  24.24 
 
 
543 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 
620 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  31.03 
 
 
620 aa  48.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  30.81 
 
 
639 aa  47.8  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0677  TPR repeat-containing protein  40.48 
 
 
616 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  29.68 
 
 
653 aa  47.4  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  29.68 
 
 
653 aa  47.4  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2572  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
288 aa  47.4  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  32.18 
 
 
789 aa  47  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  27.78 
 
 
816 aa  47  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  30.99 
 
 
611 aa  47  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  30.99 
 
 
635 aa  47  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  30.99 
 
 
635 aa  47  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  22.5 
 
 
780 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  36.44 
 
 
911 aa  46.2  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2553  TPR repeat-containing protein  32.89 
 
 
547 aa  46.6  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.852958 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 
637 aa  46.6  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  38.83 
 
 
937 aa  46.2  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 
681 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  28.83 
 
 
626 aa  45.8  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2862  hypothetical protein  22.84 
 
 
590 aa  45.8  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.247941  normal  0.201159 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  31.82 
 
 
725 aa  45.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2908  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 
203 aa  44.7  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  25.14 
 
 
1764 aa  44.7  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  29.21 
 
 
745 aa  44.7  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 
612 aa  44.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  32.74 
 
 
217 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 
776 aa  44.3  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25.74 
 
 
927 aa  44.3  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  26.55 
 
 
1415 aa  44.3  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4130  hypothetical protein  28.07 
 
 
613 aa  43.9  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.533551  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.65 
 
 
397 aa  43.9  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0588  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 
613 aa  44.3  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.498138  decreased coverage  0.00128079 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  28.1 
 
 
430 aa  43.9  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  25.17 
 
 
1979 aa  43.9  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 
708 aa  43.9  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  31.82 
 
 
821 aa  43.9  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00381  hypothetical protein  25 
 
 
437 aa  43.9  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  32.99 
 
 
776 aa  43.9  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 
776 aa  43.9  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  32.99 
 
 
776 aa  43.9  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  32.99 
 
 
776 aa  43.9  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  32.99 
 
 
821 aa  43.9  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 
750 aa  43.9  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  31.82 
 
 
864 aa  43.9  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  37.25 
 
 
1078 aa  43.9  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1382  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 
579 aa  43.5  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18968  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  25.64 
 
 
750 aa  43.5  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>