206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2353 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2075  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  85.35 
 
 
437 aa  738    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2353  chemiosmotic efflux system C protein C  100 
 
 
437 aa  894    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2065  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  86.47 
 
 
441 aa  745    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  30.53 
 
 
428 aa  150  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3507  Outer membrane efflux protein  29.48 
 
 
435 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  29.9 
 
 
431 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  27.96 
 
 
437 aa  137  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  28.3 
 
 
432 aa  134  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  26.68 
 
 
432 aa  134  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2276  outer membrane efflux protein  28.85 
 
 
432 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0693511 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  28.67 
 
 
434 aa  126  9e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2628  Outer membrane efflux protein  26.55 
 
 
432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  27.82 
 
 
416 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  29 
 
 
415 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  25.81 
 
 
423 aa  104  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  25.81 
 
 
423 aa  104  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  25.81 
 
 
423 aa  104  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2254  Outer membrane efflux protein  26.96 
 
 
436 aa  102  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  26.63 
 
 
394 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  27.84 
 
 
440 aa  96.7  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  26.21 
 
 
472 aa  95.5  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  26.59 
 
 
458 aa  95.1  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  27.65 
 
 
439 aa  94.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  27.42 
 
 
437 aa  94.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  27.65 
 
 
439 aa  94.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  28.43 
 
 
435 aa  94.4  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  25.69 
 
 
428 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  25.55 
 
 
408 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0399  heavy metal resistance protein CzcC  25.65 
 
 
461 aa  88.2  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132876  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1031  heavy metal resistance protein CzcC  25.65 
 
 
443 aa  87.8  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1527  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC  25.65 
 
 
452 aa  88.2  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1442  cobalt-zinc-cadmium resistance efflux protein  25.65 
 
 
461 aa  88.2  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0705718  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0013  heavy metal resistance protein CzcC  25.65 
 
 
461 aa  88.2  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.238799  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1183  heavy metal resistance protein CzcC  25.65 
 
 
461 aa  88.2  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.84848  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  25.98 
 
 
443 aa  87.4  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  24.8 
 
 
451 aa  87.4  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0033  heavy metal resistance protein CzcC  25.65 
 
 
443 aa  86.7  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  25.19 
 
 
428 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0087  outer membrane efflux protein  23.17 
 
 
424 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1549  Outer membrane efflux protein  24.22 
 
 
426 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.069846  normal  0.874867 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0377  metal ion efflux outer membrane protein, putative  24.94 
 
 
408 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3287  outer membrane efflux protein  26.8 
 
 
464 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2408  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC, putative  26.8 
 
 
425 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00195815  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0447  outer membrane efflux protein  24.14 
 
 
438 aa  80.5  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2553  outer membrane efflux protein  25.32 
 
 
421 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1330  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  23.94 
 
 
493 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2042  outer membrane efflux protein  28.13 
 
 
417 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367282  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1716  outer membrane protein  22.22 
 
 
440 aa  77.4  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000584875  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2056  outer membrane efflux protein  23.16 
 
 
423 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000544389 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5982  cation proton antiporter efflux protein CzcC  24.07 
 
 
418 aa  77.4  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000196082  normal  0.0745476 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3648  outer membrane efflux protein  22.71 
 
 
446 aa  77  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2373  HelC protein  23.08 
 
 
414 aa  76.6  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1764  outer membrane efflux protein  23.83 
 
 
418 aa  76.6  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715826  normal  0.306921 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1044  HelC protein  22.22 
 
 
416 aa  75.5  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  25.38 
 
 
443 aa  75.5  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1089  outer membrane efflux protein  28.5 
 
 
444 aa  74.3  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3077  outer membrane efflux protein  23.06 
 
 
426 aa  72  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767775  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2733  outer membrane efflux protein  24.11 
 
 
415 aa  72  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0378376  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2166  outer membrane efflux protein  21.88 
 
 
423 aa  72  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3728  outer membrane efflux protein  25.28 
 
 
433 aa  72  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0602217  normal  0.0956817 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2435  outer membrane efflux protein  22.49 
 
 
438 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2893  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.96 
 
 
516 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4596  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin  25.19 
 
 
431 aa  71.2  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0688687  hitchhiker  0.005842 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3557  outer membrane efflux protein  26.3 
 
 
442 aa  70.5  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  23.38 
 
 
426 aa  70.5  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2209  outer membrane efflux protein  26.19 
 
 
433 aa  70.1  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.798472  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2504  outer membrane efflux protein  24.34 
 
 
436 aa  69.3  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10477  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0491  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  24.81 
 
 
441 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1582  outer membrane efflux protein  24.76 
 
 
418 aa  68.2  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0904474  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  24.01 
 
 
438 aa  67  0.0000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1582  outer membrane efflux protein  25.81 
 
 
523 aa  65.1  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1537  Outer membrane efflux protein  24.6 
 
 
445 aa  64.3  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3371  outer membrane efflux protein  24.54 
 
 
407 aa  63.5  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.252246  normal  0.409086 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2110  outer membrane efflux protein  23.06 
 
 
437 aa  63.2  0.000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313002  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7201  outer membrane efflux protein  24.82 
 
 
418 aa  63.5  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2929  outer membrane efflux protein  24.43 
 
 
443 aa  63.5  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1551  outer membrane efflux protein  25.33 
 
 
443 aa  63.2  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1941  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.08 
 
 
497 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.211357  normal  0.0401761 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1848  outer membrane efflux protein  22.39 
 
 
423 aa  61.6  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2162  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  22.22 
 
 
475 aa  61.6  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0722212  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0169  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.24 
 
 
493 aa  61.2  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000204876 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4293  outer membrane efflux protein  24.4 
 
 
412 aa  61.6  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.730588  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2096  outer membrane efflux protein  23.61 
 
 
419 aa  60.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3981  outer membrane efflux protein  27.16 
 
 
423 aa  60.5  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3802  Outer membrane efflux protein  22.96 
 
 
465 aa  60.1  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2262  outer membrane heavy metal efflux protein  24.5 
 
 
426 aa  59.3  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1329  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  25.46 
 
 
425 aa  59.3  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2106  Outer membrane efflux protein  23.1 
 
 
471 aa  58.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.343125  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4103  outer membrane efflux protein  23.52 
 
 
500 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.733493  normal  0.726802 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2142  outer membrane efflux protein  25.88 
 
 
423 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.143725 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4530  outer membrane efflux protein  24.88 
 
 
425 aa  57  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4754  outer membrane efflux protein  23.28 
 
 
500 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.203593  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3413  outer membrane efflux protein  23.28 
 
 
500 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0147  heavy metal efflux pump, CzcA family  23.38 
 
 
1443 aa  55.8  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0185  outer membrane efflux protein  24.33 
 
 
485 aa  55.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1641  Outer membrane efflux protein  21.41 
 
 
479 aa  55.5  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1994  outer membrane efflux protein  22.14 
 
 
495 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.184092  normal  0.0261874 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2577  outer membrane efflux protein  28.27 
 
 
435 aa  54.7  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.996623 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2659  outer membrane efflux protein  23.16 
 
 
436 aa  54.7  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4301  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.74 
 
 
472 aa  54.3  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>