More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3068 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_3068  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 506 aa  944    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1999  amino acid permease-associated region  32.26 
 
 		 490 aa  222  9.999999999999999e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.352019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2831  amino acid permease-associated region  31.2 
 
 		 497 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.820669 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  30 
 
 		 501 aa  183  7e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2839  amino acid permease-associated region  32.21 
 
 		 506 aa  179  9e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7711  amino acid permease-associated region  31.78 
 
 		 482 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2580  amino acid permease-associated region  33.1 
 
 		 464 aa  124  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.871952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  30.48 
 
 		 461 aa  111  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2919  amino acid permease-associated region  28.93 
 
 		 507 aa  105  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1968  amino acid permease-associated region  30.47 
 
 		 495 aa  99.8  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.196311  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2478  amino acid permease-associated region  26.39 
 
 		 459 aa  95.1  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.65738  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0605  amino acid permease-associated region  28.5 
 
 		 504 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.912711 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2659  amino acid permease family protein  27.25 
 
 		 468 aa  94.7  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.260834  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2285  amino acid permease-associated region  27.25 
 
 		 471 aa  94.4  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207466 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1630  amino acid permease-associated region  33.81 
 
 		 497 aa  92.8  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.100446 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0648  amino acid permease-associated region  25.61 
 
 		 469 aa  90.5  6e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0222  amino acid permease-associated region  27.64 
 
 		 502 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  28.71 
 
 		 465 aa  89.7  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0232  amino acid permease-associated region  27.64 
 
 		 511 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188638  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  30.12 
 
 		 463 aa  89  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0242  amino acid permease-associated region  27.64 
 
 		 502 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.990635 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  27.54 
 
 		 475 aa  88.2  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6016  amino acid permease-associated region  30.09 
 
 		 463 aa  87  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.838168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  30.37 
 
 		 462 aa  87  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  30.37 
 
 		 462 aa  87  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  29.33 
 
 		 462 aa  86.7  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0502  amino acid permease-associated region  27.25 
 
 		 492 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  26.95 
 
 		 489 aa  85.9  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5856  amino acid permease-associated region  30.53 
 
 		 463 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1312  amino acid permease-associated region  26.63 
 
 		 450 aa  85.9  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  27.49 
 
 		 465 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  27.2 
 
 		 460 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0357  amino acid permease-associated region  29.33 
 
 		 449 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.510995 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6094  amino acid permease-associated region  30.53 
 
 		 463 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0679218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0513  amino acid permease-associated region  27.05 
 
 		 492 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120819  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0524  amino acid permease-associated region  27.05 
 
 		 492 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  27.21 
 
 		 485 aa  84.3  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7499  amino acid permease-associated region  28.82 
 
 		 495 aa  84  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5364  amino acid permease-associated region  26.76 
 
 		 481 aa  83.6  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  25.68 
 
 		 447 aa  83.2  0.000000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  24.83 
 
 		 471 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0436  amino acid permease-associated region  26.02 
 
 		 467 aa  83.2  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  24.83 
 
 		 471 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  24.83 
 
 		 471 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0130  amino acid permease-associated region  28.17 
 
 		 515 aa  83.2  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.389745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0188  amino acid permease-associated region  26.33 
 
 		 510 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0199  amino acid permease-associated region  26.33 
 
 		 510 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0321  amino acid permease family protein  24.72 
 
 		 460 aa  82  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0838341  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1244  amino acid permease-associated region  26.75 
 
 		 513 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000000642825  decreased coverage  0.00000288489 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0208  amino acid permease-associated region  26.33 
 
 		 510 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2078  amino acid permease-associated region  29.63 
 
 		 527 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.491472  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1795  amino acid permease-associated region  26.77 
 
 		 516 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0667  amino acid permease-associated region  26.83 
 
 		 474 aa  80.9  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.819834  decreased coverage  0.000117019 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0651  amino acid permease-associated region  30.37 
 
 		 481 aa  80.9  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35860  amino acid permease  28.07 
 
 		 434 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332281  decreased coverage  9.326859999999999e-20 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2802  amino acid permease family protein  29.77 
 
 		 443 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  25.44 
 
 		 494 aa  80.5  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  26.7 
 
 		 495 aa  80.5  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  24.57 
 
 		 469 aa  80.1  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  28.21 
 
 		 462 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1170  amino acid permease family protein  28.83 
 
 		 497 aa  79.3  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381443  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1046  amino acid permease-associated region  27.36 
 
 		 492 aa  79  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20672  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2212  amino acid permease-associated region  24.8 
 
 		 453 aa  79  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  25.77 
 
 		 476 aa  78.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0590  amino acid permease-associated region  27.22 
 
 		 489 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.806794  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  24.85 
 
 		 490 aa  78.2  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2857  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 		 504 aa  78.2  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5564  amino acid permease-associated region  25.93 
 
 		 510 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  24.17 
 
 		 471 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  24.17 
 
 		 471 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  24.17 
 
 		 471 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1922  amino acid permease-associated region  29.65 
 
 		 485 aa  77.4  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.255466  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1037  amino acid permease-associated region  28.77 
 
 		 509 aa  77  0.0000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.809227  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  25 
 
 		 456 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2033  amino acid permease-associated region  24.36 
 
 		 459 aa  77  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  25.83 
 
 		 471 aa  77  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  24.5 
 
 		 471 aa  77  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0046  amino acid permease-associated region  26.45 
 
 		 481 aa  76.6  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  24.48 
 
 		 482 aa  76.6  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  28.11 
 
 		 473 aa  76.6  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1229  amino acid ABC transporter permease  23.84 
 
 		 450 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.674288 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  27.19 
 
 		 466 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3953  amino acid permease-associated region  26.4 
 
 		 485 aa  76.3  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2626  amino acid permease-associated region  27.68 
 
 		 521 aa  76.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0431  amino acid transporter  28.74 
 
 		 517 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0271358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  26.48 
 
 		 468 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  26.48 
 
 		 468 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  25.12 
 
 		 471 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  23.84 
 
 		 450 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4115  amino acid permease-associated region  24.57 
 
 		 516 aa  76.3  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  24.4 
 
 		 456 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  26.2 
 
 		 495 aa  76.3  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  25.12 
 
 		 471 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  26.48 
 
 		 468 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3527  amino acid permease-associated region  27.98 
 
 		 555 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238018  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06078  cationic amino acid transporter  25.4 
 
 		 476 aa  75.9  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0210338  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  23.84 
 
 		 450 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1838  amino acid permease-associated region  25.96 
 
 		 517 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  25.83 
 
 		 471 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00849  cationic amino acid transporter  25.4 
 
 		 476 aa  75.9  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000255765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>