More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1656 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1378  threonyl-tRNA synthetase  65.29 
 
 		 673 aa  907    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0410171  normal  0.0241813 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1783  threonyl-tRNA synthetase  67.5 
 
 		 671 aa  872    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.491934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2392  threonyl-tRNA synthetase  62.07 
 
 		 668 aa  831    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451072  hitchhiker  0.00797277 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1979  threonyl-tRNA synthetase  68.7 
 
 		 671 aa  897    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000566637 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2287  threonyl-tRNA synthetase  61.29 
 
 		 691 aa  775    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12385  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2095  threonyl-tRNA synthetase  56.23 
 
 		 684 aa  752    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00031634  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3066  threonyl-tRNA synthetase  69.47 
 
 		 656 aa  920    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.408536  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3188  threonyl-tRNA synthetase  61.29 
 
 		 690 aa  777    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2108  threonyl-tRNA synthetase  60.91 
 
 		 659 aa  811    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249058  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10670  threonyl-tRNA synthetase  66.31 
 
 		 672 aa  888    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0000327769  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2089  threonyl-tRNA synthetase  58.43 
 
 		 682 aa  786    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0448  threonyl-tRNA synthetase  58.99 
 
 		 677 aa  788    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.145335  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1919  threonyl-tRNA synthetase  63.17 
 
 		 677 aa  811    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.615568  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2043  threonyl-tRNA synthetase  66.26 
 
 		 669 aa  904    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000086336 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3442  threonyl-tRNA synthetase  60.15 
 
 		 699 aa  787    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000446012  hitchhiker  0.0000744788 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0841  threonine--tRNA ligase  59.82 
 
 		 676 aa  805    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3147  threonyl-tRNA synthetase  60.27 
 
 		 701 aa  800    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1764  threonyl-tRNA synthetase  60.79 
 
 		 658 aa  797    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.279145  hitchhiker  0.00103927 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17410  threonyl-tRNA synthetase /Ser-tRNA(Thr) hydrolase  68.81 
 
 		 676 aa  924    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.595758  normal  0.0835389 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13900  threonyl-tRNA synthetase  63.97 
 
 		 666 aa  855    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0274631  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15440  threonyl-tRNA synthetase  69.45 
 
 		 660 aa  943    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.374739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1770  threonyl-tRNA synthetase  67.62 
 
 		 671 aa  858    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0365193  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12633  threonyl-tRNA synthetase  59.79 
 
 		 692 aa  774    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000167606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14910  threonyl-tRNA synthetase  61.28 
 
 		 692 aa  779    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1783  threonyl-tRNA synthetase  70.09 
 
 		 670 aa  934    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.534298  normal  0.0885436 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2242  threonyl-tRNA synthetase  62.07 
 
 		 684 aa  792    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2281  threonyl-tRNA synthetase  62.07 
 
 		 684 aa  792    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3838  threonyl-tRNA synthetase  62.7 
 
 		 695 aa  802    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.400381  normal  0.082381 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1656  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 672 aa  1378    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.291225  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6132  threonyl-tRNA synthetase  62.73 
 
 		 659 aa  828    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158599  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2230  threonyl-tRNA synthetase  62.31 
 
 		 666 aa  830    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883238  hitchhiker  0.00000834751 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2317  threonyl-tRNA synthetase  66.57 
 
 		 669 aa  901    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.104069  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2078  threonyl-tRNA synthetase  62.82 
 
 		 657 aa  840    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1358  threonyl-tRNA synthetase  60.06 
 
 		 685 aa  800    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.462189 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3269  threonyl-tRNA synthetase  62.1 
 
 		 657 aa  820    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2370  threonyl-tRNA synthetase  66.27 
 
 		 668 aa  917    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2289  threonyl-tRNA synthetase  62.07 
 
 		 684 aa  792    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.45784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2558  threonyl-tRNA synthetase  62.19 
 
 		 691 aa  790    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 648 aa  563  1.0000000000000001e-159  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  46.18 
 
 		 644 aa  545  1e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2850  threonyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 		 604 aa  543  1e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0185982  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  46.18 
 
 		 644 aa  545  1e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 		 643 aa  536  1e-151  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  43.72 
 
 		 659 aa  532  1e-150  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2787  threonyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 		 615 aa  530  1e-149  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1300  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  44.2 
 
 		 639 aa  529  1e-149  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  43.82 
 
 		 638 aa  526  1e-148  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 		 644 aa  528  1e-148  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1457  threonyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 		 608 aa  526  1e-148  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 636 aa  526  1e-148  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0566  threonyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 		 583 aa  524  1e-147  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 644 aa  525  1e-147  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1383  threonyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 		 608 aa  524  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.520119 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0387  threonyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 610 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.677095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 645 aa  521  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0226  threonyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 		 614 aa  514  1e-144  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2841  threonyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 		 606 aa  513  1e-144  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0043  threonyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 649 aa  512  1e-144  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 		 646 aa  510  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2606  threonyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 		 604 aa  509  1e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0580419 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 		 662 aa  509  1e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0349  threonyl-tRNA synthetase  46.29 
 
 		 595 aa  510  1e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.129605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1643  threonyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 645 aa  509  1e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193799  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 		 636 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 		 636 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0110  threonyl-tRNA synthetase  46.28 
 
 		 595 aa  506  9.999999999999999e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  39.94 
 
 		 636 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2997  threonyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 644 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2511  threonyl-tRNA synthetase  45 
 
 		 594 aa  503  1e-141  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0678043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1007  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 		 637 aa  504  1e-141  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.245371  normal  0.0129716 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 633 aa  503  1e-141  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2219  threonyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 		 647 aa  499  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0771332 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0731  threonyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 		 607 aa  501  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0935  threonyl-tRNA synthetase  43.77 
 
 		 611 aa  501  1e-140  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0867221  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 645 aa  501  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0760  threonyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 		 607 aa  501  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.281808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2175  threonyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 		 648 aa  497  1e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  40.31 
 
 		 643 aa  498  1e-139  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1034  threonyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 		 611 aa  496  1e-139  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 635 aa  495  1e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 		 639 aa  497  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2368  threonyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 		 644 aa  493  9.999999999999999e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.642893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1025  threonyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 638 aa  494  9.999999999999999e-139  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.572663  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 638 aa  495  9.999999999999999e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 635 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0984  threonyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 		 644 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.234013 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0121  threonyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 		 596 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0744  threonyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 		 581 aa  495  9.999999999999999e-139  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0359075  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0427  threonyl-tRNA synthetase  41.52 
 
 		 640 aa  494  9.999999999999999e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0436469  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2136  threonyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 		 644 aa  493  9.999999999999999e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000263348  hitchhiker  0.00165189 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 		 644 aa  493  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0982  threonyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 652 aa  491  1e-137  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0768948  normal  0.105086 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1192  threonyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 		 652 aa  490  1e-137  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0723  threonyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 		 631 aa  491  1e-137  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000476694  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33493  predicted protein  43.29 
 
 		 684 aa  490  1e-137  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 634 aa  489  1e-137  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 644 aa  490  1e-137  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1715  threonyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 657 aa  485  1e-136  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 		 635 aa  486  1e-136  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1507  threonyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 649 aa  487  1e-136  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.266157  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>