More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2902 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2902  mercuric transport protein periplasmic component  100 
 
 
98 aa  196  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0798  heavy metal transport/detoxification protein  86.73 
 
 
98 aa  172  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.885696 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3158  heavy metal transport/detoxification protein  84.21 
 
 
97 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.299489  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0484  mercuric transport protein periplasmic component  52.13 
 
 
92 aa  86.3  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4417  mercuric transport protein periplasmic protein  41.49 
 
 
94 aa  85.5  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192588  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2511  mercuric transport protein periplasmic protein  59.72 
 
 
99 aa  84.3  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.356859 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1299  mercuric transport protein periplasmic component  52.86 
 
 
95 aa  80.1  0.000000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2314  mercuric transport protein periplasmic protein  52.86 
 
 
95 aa  80.1  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118185  hitchhiker  0.0000281671 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0240  mercuric transport protein periplasmic component  45.83 
 
 
98 aa  78.6  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4313  mercuric transport protein periplasmic component  50 
 
 
91 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0113  mercuric transport protein periplasmic component  48.19 
 
 
91 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.827734  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2230  mercuric transport protein periplasmic protein  44.44 
 
 
91 aa  75.5  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0092  mercuric transport protein periplasmic component  48.65 
 
 
91 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4012  mercuric transport protein periplasmic component  38.46 
 
 
100 aa  73.9  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1215  periplasmic mecuric binding protein, MerP  46.67 
 
 
91 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4343  mercuric transport protein periplasmic component  50 
 
 
91 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01410  periplasmic mercuric ion binding protein MerP  47.95 
 
 
94 aa  72.4  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.610183  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4796  mercuric transport protein periplasmic protein  44.19 
 
 
94 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0169  mercuric transport protein periplasmic component  46.48 
 
 
91 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2271  mercuric transport protein periplasmic component  43.42 
 
 
94 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.618304  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3490  mercuric transport protein periplasmic component  43.33 
 
 
95 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6496  mercuric transport protein periplasmic protein  45.71 
 
 
91 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43034  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0103  mercuric transport protein periplasmic component  45.71 
 
 
91 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6173  Hg(II) resistance protein MerP  45.71 
 
 
91 aa  70.5  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000203357  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6346  Hg(II) resistance protein MerP  45.71 
 
 
91 aa  70.5  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000621364  unclonable  0.0000000448474 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15470  periplasmic mercuric ion binding protein, MerP  45.71 
 
 
91 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000149366  unclonable  3.5058299999999997e-22 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2339  mercuric transport protein periplasmic component  45.71 
 
 
91 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832464  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0166  mercuric transport protein periplasmic component MerP  46.97 
 
 
91 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.695125  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1785  mercuric transport protein periplasmic component  46.97 
 
 
90 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37235  normal  0.942363 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0081  mercuric transport protein periplasmic component  47.14 
 
 
91 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.675229 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1476  mercuric transport protein periplasmic component  42.86 
 
 
94 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.241266  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2328  heavy metal transport/detoxification protein  47.22 
 
 
125 aa  70.1  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2131  mercuric transport protein periplasmic component  47.14 
 
 
91 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1663  PBP/HMA domain-containing protein  44.44 
 
 
94 aa  68.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140862  normal  0.759256 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1211  mercuric transport protein periplasmic component  47.14 
 
 
91 aa  69.3  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154152  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1393  mercuric transport protein periplasmic component  36.9 
 
 
98 aa  68.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2684  heavy metal transport/detoxification protein  59.42 
 
 
109 aa  67.8  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1340  mercuric transport protein periplasmic protein  46.97 
 
 
108 aa  67.8  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.023175  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02043  Mercury scavenger protein:Heavy-metal-associated domain  39.74 
 
 
85 aa  66.2  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525841  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0239  periplasmic mercuric ion binding protein MerP  39.18 
 
 
94 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4777  heavy metal translocating P-type ATPase  46.05 
 
 
1013 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.701128 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5366  heavy metal translocating P-type ATPase  46.05 
 
 
1021 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5494  heavy metal translocating P-type ATPase  46.05 
 
 
1021 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0117323  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4827  heavy metal translocating P-type ATPase  44.74 
 
 
946 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3586  heavy metal translocating P-type ATPase  43.94 
 
 
824 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845066  hitchhiker  0.000954776 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  38.89 
 
 
753 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2080  heavy metal translocating P-type ATPase  35.62 
 
 
814 aa  55.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0351429  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1536  heavy metal translocating P-type ATPase  43.28 
 
 
813 aa  55.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.627747 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  42.86 
 
 
759 aa  55.5  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2938  copper-translocating P-type ATPase  41.33 
 
 
795 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  37.68 
 
 
954 aa  54.7  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  37.1 
 
 
68 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0162  copper-translocating P-type ATPase  50 
 
 
1040 aa  52.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1259  heavy metal translocating P-type ATPase  41.18 
 
 
834 aa  52.8  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.499676  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2185  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 
754 aa  53.5  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1110  heavy metal translocating P-type ATPase  41.54 
 
 
938 aa  52  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0214095  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0447  copper-translocating P-type ATPase  39.73 
 
 
762 aa  52  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  5.93532e-16 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1638  putative MerP, periplasmic heavy metal binding/chaperone protein  38.24 
 
 
74 aa  52  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.240185  hitchhiker  0.000119681 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1872  heavy metal transport/detoxification protein  36.11 
 
 
74 aa  52  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.230412  unclonable  0.0000667879 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  39.73 
 
 
762 aa  52  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  0.0000000000000025433 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0119  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 
816 aa  52  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0384  copper-translocating P-type ATPase  39.73 
 
 
767 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000272293 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0387  copper-translocating P-type ATPase  39.73 
 
 
762 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5373  heavy metal translocating P-type ATPase  40.79 
 
 
937 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.698068 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3299  heavy metal translocating P-type ATPase  39.08 
 
 
1182 aa  51.6  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741237  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  44.62 
 
 
833 aa  51.2  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  41.27 
 
 
752 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1882  mercury ion binding protein  34.43 
 
 
68 aa  51.2  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.174635  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2308  heavy metal translocating P-type ATPase  41.46 
 
 
841 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  39.39 
 
 
849 aa  50.8  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 
885 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  40.79 
 
 
835 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6893  heavy metal translocating P-type ATPase  39.19 
 
 
872 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.172746  normal  0.265411 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3888  heavy metal translocating P-type ATPase  39.71 
 
 
1087 aa  50.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.840701  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0406  copper-translocating P-type ATPase  38.36 
 
 
762 aa  50.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369581 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2679  heavy metal translocating P-type ATPase  35.14 
 
 
857 aa  50.4  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.444851  normal  0.668216 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0385  copper-transporter ATPase CopA  32.89 
 
 
744 aa  50.1  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  36.99 
 
 
836 aa  50.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02958  putative mercuric transport protein periplasmic binding protein  38.6 
 
 
61 aa  50.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000221082  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  39.39 
 
 
68 aa  49.7  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4316  heavy metal translocating P-type ATPase  41.79 
 
 
835 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2388  heavy-metal transporting P-type ATPase  39.44 
 
 
819 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168329  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10610  copper chaperone  41.54 
 
 
69 aa  48.5  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.201144  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3789  heavy metal translocating P-type ATPase  43.86 
 
 
836 aa  48.5  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0366996  normal  0.767636 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4065  heavy metal translocating P-type ATPase  43.86 
 
 
836 aa  48.5  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  35.48 
 
 
67 aa  48.5  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1195  heavy metal translocating P-type ATPase  29.41 
 
 
847 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1541  heavy metal transport/detoxification protein  38.03 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.45566  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  37.5 
 
 
833 aa  48.5  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 
840 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  31.82 
 
 
68 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  38.24 
 
 
750 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 
790 aa  48.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4090  heavy metal translocating P-type ATPase  38.16 
 
 
813 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.670864 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  39.34 
 
 
1071 aa  48.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3046  heavy metal translocating P-type ATPase  34.85 
 
 
806 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1546  cation transport ATPase  37.5 
 
 
742 aa  47.8  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1102  heavy metal translocating P-type ATPase  30.88 
 
 
847 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.165186  normal  0.905045 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0921  heavy metal translocating P-type ATPase  39.39 
 
 
844 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2021  copper-translocating P-type ATPase  32.26 
 
 
811 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>