More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2783 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2783  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  637    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0226  hypothetical protein  53.75 
 
 
327 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  48.34 
 
 
324 aa  280  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  43.51 
 
 
328 aa  273  4.0000000000000004e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  44.07 
 
 
325 aa  272  5.000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  44.94 
 
 
339 aa  272  6e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  47.52 
 
 
323 aa  271  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  44.51 
 
 
356 aa  270  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  42.72 
 
 
325 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  43.48 
 
 
327 aa  266  4e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  43.48 
 
 
325 aa  266  4e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  43.05 
 
 
325 aa  266  5e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  43.85 
 
 
331 aa  266  5e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  44.81 
 
 
336 aa  266  5e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  42.23 
 
 
330 aa  264  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  43.67 
 
 
335 aa  264  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  44.52 
 
 
328 aa  263  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  42.32 
 
 
330 aa  264  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  42.3 
 
 
304 aa  263  3e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  44.52 
 
 
328 aa  263  3e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  45 
 
 
328 aa  262  4.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  43.46 
 
 
333 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  44.33 
 
 
330 aa  261  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  44.33 
 
 
330 aa  261  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2752  hypothetical protein  40 
 
 
325 aa  259  6e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.299516 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  44.33 
 
 
328 aa  259  6e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  44.44 
 
 
336 aa  258  7e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  44.15 
 
 
331 aa  258  8e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  43.73 
 
 
334 aa  258  1e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1840  hypothetical protein  46.25 
 
 
326 aa  258  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0526902  normal  0.401977 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  42.28 
 
 
327 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  44.11 
 
 
328 aa  257  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  42.9 
 
 
344 aa  257  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0847  hypothetical protein  44.67 
 
 
331 aa  256  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.318374  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  44.44 
 
 
358 aa  256  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  42.14 
 
 
324 aa  256  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  43.18 
 
 
335 aa  254  9e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  44.44 
 
 
326 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  44.75 
 
 
330 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  43.81 
 
 
330 aa  253  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  45 
 
 
335 aa  254  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3785  hypothetical protein  44.15 
 
 
362 aa  254  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141562  normal  0.251227 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1818  hypothetical protein  44.67 
 
 
326 aa  253  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00429449 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  40.13 
 
 
330 aa  252  5.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  44.52 
 
 
349 aa  252  6e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  42.47 
 
 
325 aa  252  7e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  42.47 
 
 
327 aa  252  8.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  43.58 
 
 
349 aa  251  9.000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  40.94 
 
 
330 aa  251  9.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  41.12 
 
 
332 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  42.43 
 
 
335 aa  251  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  41.72 
 
 
329 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  44.26 
 
 
325 aa  251  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  41.08 
 
 
328 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  40.94 
 
 
346 aa  250  2e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  41 
 
 
328 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  45.48 
 
 
337 aa  250  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  41.81 
 
 
332 aa  250  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  44.33 
 
 
339 aa  250  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  42.62 
 
 
335 aa  249  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  40.97 
 
 
336 aa  249  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  44.67 
 
 
335 aa  249  4e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  43.33 
 
 
327 aa  249  5e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  45.55 
 
 
323 aa  249  6e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1326  hypothetical protein  41.8 
 
 
312 aa  249  6e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.12583  hitchhiker  7.14872e-17 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  44.22 
 
 
331 aa  248  7e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  43.38 
 
 
310 aa  248  8e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2907  hypothetical protein  39.14 
 
 
327 aa  248  9e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  43.18 
 
 
334 aa  248  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  43.47 
 
 
328 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  43.22 
 
 
326 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  42.77 
 
 
333 aa  247  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  41.14 
 
 
322 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  42.81 
 
 
329 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  44.37 
 
 
339 aa  246  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  40.53 
 
 
321 aa  246  4e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  40.83 
 
 
323 aa  245  6e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  43.28 
 
 
341 aa  245  6.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  42.47 
 
 
339 aa  245  8e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  41.47 
 
 
323 aa  245  9e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  42.81 
 
 
352 aa  245  9e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  43.1 
 
 
328 aa  245  9e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  43.39 
 
 
322 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  40.2 
 
 
326 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3827  hypothetical protein  45.39 
 
 
330 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  43.19 
 
 
334 aa  244  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  41.04 
 
 
333 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4611  hypothetical protein  44.49 
 
 
349 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0560  twin-arginine translocation pathway signal  41.36 
 
 
325 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  41.94 
 
 
324 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  41.8 
 
 
320 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2909  hypothetical protein  39.32 
 
 
323 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  43.05 
 
 
333 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4970  hypothetical protein  43.18 
 
 
321 aa  243  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5058  extra-cytoplasmic solute receptor  45.57 
 
 
328 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0827045  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  44.18 
 
 
334 aa  242  6e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  39.87 
 
 
327 aa  241  7.999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  41.82 
 
 
331 aa  241  7.999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  45.27 
 
 
322 aa  241  9e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  38.63 
 
 
323 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>