More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0362 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0362  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 426 aa  850    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  78.51 
 
 		 398 aa  611  9.999999999999999e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  78.78 
 
 		 426 aa  609  1e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  78.51 
 
 		 426 aa  607  9.999999999999999e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  74.87 
 
 		 406 aa  578  1e-164  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  69.43 
 
 		 450 aa  550  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  69.88 
 
 		 420 aa  548  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  73.08 
 
 		 406 aa  549  1e-155  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0745  putative transcriptional regulator, GntR family  71.69 
 
 		 416 aa  533  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3539  GntR family transcriptional regulator  64.36 
 
 		 407 aa  456  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00400893 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0186  valine-pyruvate aminotransferase  63.52 
 
 		 402 aa  429  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.39776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  54.99 
 
 		 404 aa  423  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  56.3 
 
 		 394 aa  420  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  56.67 
 
 		 417 aa  415  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  55.06 
 
 		 396 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  54.55 
 
 		 406 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  54.81 
 
 		 396 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  53.42 
 
 		 393 aa  395  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  53.92 
 
 		 393 aa  395  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  53.98 
 
 		 398 aa  396  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  53.16 
 
 		 393 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  53.21 
 
 		 398 aa  393  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  53.67 
 
 		 393 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  53.73 
 
 		 398 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  53.16 
 
 		 393 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  53.16 
 
 		 393 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  53.16 
 
 		 393 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  53.16 
 
 		 393 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  52.91 
 
 		 393 aa  391  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  53.67 
 
 		 393 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  53.67 
 
 		 393 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  53.67 
 
 		 393 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  53.67 
 
 		 393 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  53.67 
 
 		 393 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  53.67 
 
 		 393 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  45.57 
 
 		 397 aa  317  4e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  47.29 
 
 		 383 aa  315  9.999999999999999e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 405 aa  314  1.9999999999999998e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  46.13 
 
 		 394 aa  307  3e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  45.66 
 
 		 406 aa  301  1e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  43.54 
 
 		 402 aa  300  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  43.29 
 
 		 402 aa  299  6e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0898  GntR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 388 aa  297  2e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0721886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  40.71 
 
 		 401 aa  295  8e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0229  putative AMINNO transferase protein  44.44 
 
 		 402 aa  295  1e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 403 aa  293  5e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  39.95 
 
 		 400 aa  293  5e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  39.59 
 
 		 400 aa  291  1e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  39.75 
 
 		 394 aa  290  2e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  38.07 
 
 		 396 aa  290  4e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2514  aminotransferase, class I and II  38.32 
 
 		 397 aa  289  6e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.483717  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2588  aminotransferase, class I and II  44.09 
 
 		 404 aa  289  8e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724339 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 414 aa  286  4e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 395 aa  286  5e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  40.15 
 
 		 433 aa  285  8e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 398 aa  285  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 395 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  39.4 
 
 		 433 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 395 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 395 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  40.45 
 
 		 400 aa  284  3.0000000000000004e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 393 aa  282  6.000000000000001e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  36.92 
 
 		 446 aa  281  1e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5405  putative transcriptional regulator, GntR family  39.69 
 
 		 446 aa  281  2e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  39.07 
 
 		 440 aa  279  7e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  37.95 
 
 		 441 aa  278  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2741  putative transcriptional regulator, GntR family  42.36 
 
 		 405 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  40.26 
 
 		 438 aa  277  2e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 		 437 aa  278  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 441 aa  277  3e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  36.57 
 
 		 438 aa  276  3e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  39.03 
 
 		 430 aa  276  5e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3812  putative transcriptional regulator, GntR family  39.69 
 
 		 435 aa  276  6e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  37.68 
 
 		 439 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 395 aa  274  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  38.38 
 
 		 395 aa  273  5.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  38.89 
 
 		 395 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  39.29 
 
 		 463 aa  272  8.000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0902  GntR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 399 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.215501  normal  0.458926 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2486  putative transcriptional regulator, GntR family  42.54 
 
 		 406 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.232429 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 395 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3369  putative transcriptional regulator, GntR family  46.94 
 
 		 402 aa  270  4e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0184281  normal  0.0139033 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  37.28 
 
 		 611 aa  270  5e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 398 aa  270  5e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2152  aminotransferase, class I and II  39.64 
 
 		 416 aa  269  8e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0068  putative transcriptional regulator, GntR family  38.99 
 
 		 397 aa  269  8.999999999999999e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 393 aa  269  8.999999999999999e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 409 aa  268  1e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  42.48 
 
 		 377 aa  267  2.9999999999999995e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1972  GntR family transcriptional regulator  38.48 
 
 		 397 aa  266  5.999999999999999e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 436 aa  266  7e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 413 aa  265  1e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  35.79 
 
 		 436 aa  265  1e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 399 aa  265  1e-69  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  38.38 
 
 		 397 aa  264  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4323  GntR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 397 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  35.04 
 
 		 394 aa  264  3e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1336  aminotransferase, class I  41.58 
 
 		 410 aa  263  4e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102288  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3867  putative transcriptional regulator, GntR family  38.38 
 
 		 394 aa  263  4e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1378  aminotransferase, class I  41.58 
 
 		 410 aa  263  4.999999999999999e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>