More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04851 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_3937  glycogen branching enzyme  48.65 
 
 		 768 aa  679    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.353505 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03284  glycogen branching enzyme  48.47 
 
 		 728 aa  662    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0237204  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0282  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.47 
 
 		 728 aa  662    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.890555  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1785  glycogen branching enzyme  48.87 
 
 		 736 aa  704    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146996  normal  0.282857 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4058  glycogen branching enzyme  49.4 
 
 		 736 aa  711    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3911  glycogen branching enzyme  48.47 
 
 		 728 aa  662    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1475  glycogen branching enzyme  47.19 
 
 		 740 aa  640    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0239  glycogen branching enzyme  47.57 
 
 		 775 aa  672    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0137851  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4647  glycogen branching enzyme  46.57 
 
 		 728 aa  656    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.616835 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3840  glycogen branching enzyme  49.03 
 
 		 728 aa  667    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.933712 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2046  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.18 
 
 		 730 aa  652    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.026483  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2762  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.42 
 
 		 741 aa  684    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2293  glycogen branching enzyme  48.55 
 
 		 712 aa  659    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.467117  hitchhiker  0.000028583 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6323  glycogen branching enzyme  48.18 
 
 		 712 aa  657    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0125562  normal  0.86015 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2936  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.4 
 
 		 721 aa  646    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3348  glycogen branching enzyme  45.63 
 
 		 735 aa  641    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2491  glycogen branching enzyme  47.42 
 
 		 741 aa  687    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00781855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3632  glycogen branching enzyme  48.47 
 
 		 728 aa  662    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3739  glycogen branching enzyme  47.91 
 
 		 728 aa  654    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0020  glycogen branching enzyme  44.19 
 
 		 755 aa  644    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.663134  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4229  glycogen branching enzyme  47.39 
 
 		 750 aa  668    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1566  glycogen branching enzyme  45.95 
 
 		 738 aa  641    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2058  glycogen branching enzyme  46.93 
 
 		 740 aa  649    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0222807  normal  0.370562 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1207  glycogen branching enzyme  49.1 
 
 		 716 aa  680    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1543  glycogen branching enzyme  45.95 
 
 		 738 aa  639    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.408672  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0147  glycogen branching enzyme  48.15 
 
 		 727 aa  651    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1737  glycogen branching enzyme  45.95 
 
 		 738 aa  641    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.304043  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0904  glycogen branching enzyme  47.38 
 
 		 749 aa  654    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2536  glycogen branching enzyme  48.07 
 
 		 743 aa  682    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2448  glycogen branching enzyme  48.27 
 
 		 728 aa  668    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7032  glycogen branching enzyme  46.69 
 
 		 735 aa  651    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3892  glycogen branching enzyme  48.47 
 
 		 728 aa  663    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3847  glycogen branching enzyme  48.05 
 
 		 728 aa  655    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.579586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5384  glycogen branching enzyme  49.16 
 
 		 737 aa  697    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.475893  normal  0.712549 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0511  glycogen branching enzyme  46.63 
 
 		 726 aa  636    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.971764  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2941  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.14 
 
 		 784 aa  721    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595342  hitchhiker  0.00590873 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6086  glycogen branching enzyme  46.72 
 
 		 736 aa  646    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.133555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1085  glycogen branching enzyme  45.38 
 
 		 774 aa  640    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217496 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2091  glycogen branching enzyme  53.1 
 
 		 677 aa  652    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0542  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.58 
 
 		 732 aa  662    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0117  glycogen branching enzyme  78.12 
 
 		 729 aa  1214    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2576  glycogen branching enzyme  48.77 
 
 		 740 aa  686    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894399  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06401  glycogen branching enzyme  44.06 
 
 		 755 aa  642    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.636304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2714  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.14 
 
 		 784 aa  720    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18371  glycogen branching enzyme  45.37 
 
 		 756 aa  639    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3681  glycogen branching enzyme  47.3 
 
 		 812 aa  644    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.024212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3805  glycogen branching enzyme  48.05 
 
 		 728 aa  655    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1882  glycogen branching enzyme  49.72 
 
 		 716 aa  679    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0215  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.41 
 
 		 739 aa  654    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01252  glycogen branching enzyme  54.66 
 
 		 730 aa  811    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.369495  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4391  glycogen branching enzyme  47.8 
 
 		 741 aa  667    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.470909 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0987  glycogen branching enzyme  48.75 
 
 		 729 aa  705    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0160232 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1111  glycogen branching enzyme  48.13 
 
 		 728 aa  668    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.827586  normal  0.454122 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3680  glycogen branching enzyme  48.19 
 
 		 716 aa  659    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1367  glycogen branching enzyme  46.35 
 
 		 725 aa  637    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2863  glycogen branching enzyme  47.72 
 
 		 736 aa  669    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3484  glycogen branching enzyme  48.54 
 
 		 716 aa  663    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03669  glycogen branching enzyme  48.65 
 
 		 727 aa  671    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1464  glycogen branching enzyme  49.02 
 
 		 716 aa  677    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2191  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.65 
 
 		 737 aa  676    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1105  glycogen branching enzyme  46.09 
 
 		 748 aa  647    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04851  glycogen branching enzyme  100 
 
 		 742 aa  1540    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1332  glycogen branching enzyme  46.63 
 
 		 736 aa  641    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.802487  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1463  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.93 
 
 		 731 aa  723    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.433405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0316  glycogen branching enzyme  52 
 
 		 722 aa  741    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1636  glycogen branching enzyme  53.7 
 
 		 729 aa  797    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.310271  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5489  glycogen branching enzyme  46.57 
 
 		 732 aa  659    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461102  decreased coverage  0.0000652942 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1783  glycogen branching enzyme  48.71 
 
 		 728 aa  659    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2677  glycogen branching enzyme  49.02 
 
 		 738 aa  686    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810703  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1133  glycogen branching enzyme  49.09 
 
 		 725 aa  673    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3153  glycogen branching enzyme  49.16 
 
 		 732 aa  671    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252202  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6806  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.83 
 
 		 770 aa  729    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.606577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2740  glycogen branching enzyme  46.58 
 
 		 736 aa  635    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.296268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0889  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.78 
 
 		 807 aa  667    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3714  glycogen branching enzyme  48.47 
 
 		 728 aa  664    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.470927  normal  0.781278 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.45 
 
 		 785 aa  710    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.573096  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3728  glycogen branching enzyme  47.91 
 
 		 728 aa  655    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.636396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3321  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.25 
 
 		 728 aa  674    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1817  glycogen branching enzyme  48.16 
 
 		 736 aa  701    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.297047 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5592  glycogen branching enzyme  46.56 
 
 		 733 aa  658    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36710  glycogen branching enzyme  49.3 
 
 		 732 aa  679    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.633943 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0280  glycogen branching enzyme  48.47 
 
 		 728 aa  662    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.388281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4744  glycogen branching enzyme  48.61 
 
 		 728 aa  662    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6497  glycogen branching enzyme  46.63 
 
 		 736 aa  641    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4118  glycogen branching enzyme  48.15 
 
 		 727 aa  650    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.595644 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1597  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.14 
 
 		 760 aa  707    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14436 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1464  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.82 
 
 		 742 aa  641    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4165  glycogen branching enzyme  48.31 
 
 		 716 aa  664    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0676  glycogen branching enzyme  46.23 
 
 		 727 aa  650    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214818  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4428  glycogen branching enzyme  46.81 
 
 		 731 aa  653    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1806  glycogen branching enzyme  46.41 
 
 		 749 aa  640    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2453  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.41 
 
 		 841 aa  635    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6823  glycogen branching enzyme  47.73 
 
 		 736 aa  669    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.851597 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2364  glycogen branching enzyme  53.91 
 
 		 771 aa  790    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.056819 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4006  glycogen branching enzyme  48.15 
 
 		 727 aa  649    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3657  glycogen branching enzyme  48.79 
 
 		 736 aa  704    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0888692  normal  0.0129978 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3908  glycogen branching enzyme  48.19 
 
 		 728 aa  656    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.635495 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6322  glycogen branching enzyme  46.56 
 
 		 733 aa  652    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.529539  normal  0.166008 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1104  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.45 
 
 		 729 aa  690    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1316  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.1 
 
 		 728 aa  647    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>