More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004021 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1852  acriflavin resistance protein  48.35 
 
 		 1042 aa  962    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0174296  hitchhiker  0.000605557 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3736  acriflavin resistance protein  36.97 
 
 		 1036 aa  642    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.504437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1797  acriflavin resistance protein  46.9 
 
 		 1031 aa  939    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0223723  hitchhiker  0.000000350495 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2815  acriflavin resistance protein  36.5 
 
 		 1051 aa  665    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.874616  normal  0.995091 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  42.2 
 
 		 1048 aa  830    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  41.01 
 
 		 1024 aa  737    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1705  acriflavin resistance protein  47 
 
 		 1031 aa  939    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0236776  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1178  acriflavin resistance protein  74.81 
 
 		 1042 aa  1546    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3926  AcrB/AcrD/AcrF family protein  46.76 
 
 		 1029 aa  904    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.831264  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0277  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  36.13 
 
 		 1043 aa  638    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0517386  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  46.51 
 
 		 1031 aa  934    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3484  AcrB/AcrD/AcrF family protein  76.22 
 
 		 1046 aa  1575    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2549  acriflavin resistance protein  47 
 
 		 1031 aa  941    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0932297  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004021  RND multidrug efflux transporter  100 
 
 		 1037 aa  2089    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0276647  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2321  acriflavin resistance protein  46.33 
 
 		 1052 aa  861    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0273304 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2787  acriflavin resistance protein  76.32 
 
 		 1046 aa  1580    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000304862  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1738  acriflavin resistance protein  43.38 
 
 		 1038 aa  781    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  47.58 
 
 		 1034 aa  945    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0365  acriflavin resistance protein  39.26 
 
 		 1037 aa  701    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3314  acriflavin resistance protein  76.02 
 
 		 1047 aa  1573    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.378933 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2664  acriflavin resistance protein  46.9 
 
 		 1031 aa  938    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0778  acriflavin resistance protein  38.16 
 
 		 1040 aa  636    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.21707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1020  acriflavin resistance protein  37.59 
 
 		 1037 aa  685    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000109455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0439  putative multidrug resistance protein  85.33 
 
 		 1036 aa  1786    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00223634  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0175  acriflavin resistance protein  44.52 
 
 		 1046 aa  875    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481543 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2000  acriflavin resistance protein  42.62 
 
 		 1028 aa  812    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2094  acriflavin resistance protein  42.57 
 
 		 1037 aa  799    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  38.63 
 
 		 1029 aa  711    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01735  RND family efflux transporter  46.45 
 
 		 1035 aa  936    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1366  acriflavin resistance protein  76.14 
 
 		 1035 aa  1607    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0602713  hitchhiker  0.00132005 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1200  acriflavin resistance protein  76.12 
 
 		 1047 aa  1575    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.994972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3080  acriflavin resistance protein  41.46 
 
 		 1045 aa  740    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.907454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01921  acriflavin resistance protein  43.52 
 
 		 1041 aa  793    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413816  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3207  acriflavin resistance protein  37.57 
 
 		 1037 aa  671    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0543905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0291  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  36.03 
 
 		 1043 aa  636    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.601595  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2033  acriflavin resistance protein  36.21 
 
 		 1044 aa  644    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2587  acriflavin resistance protein  47 
 
 		 1031 aa  940    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000412735  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2283  acriflavin resistance protein  37.36 
 
 		 1051 aa  694    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1738  acriflavin resistance protein  47.19 
 
 		 1031 aa  920    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0173564  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2556  acriflavin resistance protein  35.93 
 
 		 1051 aa  653    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3203  acriflavin resistance protein  41.9 
 
 		 1041 aa  770    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1439  acriflavin resistance protein  44.09 
 
 		 1035 aa  854    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.100841  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1968  acriflavin resistance protein  38.42 
 
 		 1025 aa  689    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.904496 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2000  acriflavin resistance protein  38.27 
 
 		 1024 aa  679    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.195138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1816  acriflavin resistance protein  39.78 
 
 		 1023 aa  708    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.742902  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01445  hypothetical protein  94.5 
 
 		 1037 aa  1978    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1037  acriflavin resistance protein  46.64 
 
 		 1036 aa  891    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2796  acriflavin resistance protein  35.94 
 
 		 1040 aa  646    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1146  acriflavine resistance protein  36.73 
 
 		 1026 aa  679    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  39.12 
 
 		 1022 aa  718    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  37.52 
 
 		 1068 aa  692    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1083  acriflavin resistance protein  75.93 
 
 		 1051 aa  1573    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.126768  normal  0.966269 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  46.8 
 
 		 1031 aa  939    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1682  acriflavin resistance protein  36.85 
 
 		 1064 aa  686    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1149  acriflavin resistance protein  76.22 
 
 		 1051 aa  1575    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.460529  normal  0.362909 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  46.8 
 
 		 1031 aa  938    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3170  acriflavin resistance protein  76.12 
 
 		 1047 aa  1575    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130532  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1187  acriflavin resistance protein  42.93 
 
 		 1036 aa  796    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359485  normal  0.0265423 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1029  acriflavin resistance protein  75.07 
 
 		 1034 aa  1612    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.2741  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0267  acriflavin resistance protein  43.01 
 
 		 1040 aa  803    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.856769 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3171  acriflavin resistance protein  76.12 
 
 		 1047 aa  1575    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0148776  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  46.56 
 
 		 1030 aa  939    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1267  acriflavin resistance protein  76.41 
 
 		 1035 aa  1606    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368024  hitchhiker  0.0000615461 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1083  acriflavin resistance protein  76.02 
 
 		 1051 aa  1575    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  46.71 
 
 		 1031 aa  937    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0704  acriflavin resistance protein  47.57 
 
 		 1038 aa  904    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  47.23 
 
 		 1031 aa  945    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1905  AcrB/AcrD/AcrF family protein  46.52 
 
 		 1034 aa  926    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.209576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1155  acriflavin resistance protein  76.53 
 
 		 1036 aa  1611    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00884759  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0473  acriflavin resistance protein  72.31 
 
 		 1033 aa  1546    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.239628  normal  0.228728 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1234  RND efflux transporter  36.38 
 
 		 1019 aa  632  1e-180  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2940  acriflavin resistance protein  35.81 
 
 		 1032 aa  633  1e-180  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00284054  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0342  acriflavin resistance protein  36.56 
 
 		 1050 aa  634  1e-180  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.467499  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2658  multidrug efflux membrane fusion protein  36.85 
 
 		 1030 aa  632  1e-180  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4493  multidrug efflux protein  36.37 
 
 		 1009 aa  629  1e-179  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0361963 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0306  RND efflux transporter  35.72 
 
 		 1044 aa  630  1e-179  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1193  acriflavin resistance plasma membrane protein  36.28 
 
 		 1019 aa  631  1e-179  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3361  acriflavin resistance protein  36.58 
 
 		 1048 aa  629  1e-178  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629992 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5136  acriflavin resistance protein  37.25 
 
 		 1029 aa  625  1e-177  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1208  multidrug efflux protein  35.62 
 
 		 1017 aa  623  1e-177  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.584016  normal  0.669413 
 
 
-
 
NC_004310  BR1088  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  36.57 
 
 		 1029 aa  620  1e-176  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4944  multidrug efflux protein  36.05 
 
 		 1018 aa  620  1e-176  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.978867  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56890  multidrug efflux protein  35.96 
 
 		 1018 aa  620  1e-176  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3496  acriflavin resistance protein  36.55 
 
 		 1026 aa  615  9.999999999999999e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2618  acriflavin resistance protein  36.92 
 
 		 1024 aa  615  9.999999999999999e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0519656  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2173  acriflavin resistance protein  35.75 
 
 		 1029 aa  609  1e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.310659  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0906  multidrug efflux protein  36.38 
 
 		 1014 aa  611  1e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4481  multidrug efflux protein  36.51 
 
 		 1014 aa  611  1e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0750514  normal  0.872704 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2847  RND family multidrug efflux protein  34.97 
 
 		 1032 aa  610  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2270  acriflavin resistance protein  34.63 
 
 		 1049 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446759  normal  0.133949 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0945  acriflavin resistance protein  35.37 
 
 		 1040 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000402917 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0945  multidrug efflux protein  36.19 
 
 		 1014 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0974  multidrug efflux protein  36.36 
 
 		 1014 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.543426  normal  0.0386559 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2552  putative multidrug resistance protein  35.56 
 
 		 1036 aa  601  1e-170  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000475921  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1496  acriflavin resistance protein  36.68 
 
 		 1025 aa  599  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.431205 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0767  acriflavin resistance plasma membrane protein  33.99 
 
 		 1022 aa  596  1e-169  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.450822  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2803  RND family multidrug/cation transporter  36.58 
 
 		 1025 aa  597  1e-169  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4296  acriflavin resistance protein  36.24 
 
 		 1034 aa  598  1e-169  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0155758  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3476  acriflavin resistance protein  34.71 
 
 		 1028 aa  597  1e-169  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.247927 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0899  acriflavin resistance protein  35.29 
 
 		 1048 aa  593  1e-168  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>