188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4194 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4194  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 199 aa  398  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6039  PadR-like family transcriptional regulator  74.16 
 
 		 181 aa  228  4e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0868  PadR-like family transcriptional regulator  73.99 
 
 		 181 aa  226  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525718  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10046  hypothetical protein  73.26 
 
 		 180 aa  225  3e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  70.65 
 
 		 252 aa  220  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5375  PadR family transcriptional regulator  74.69 
 
 		 181 aa  200  9e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.658005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5464  PadR family transcriptional regulator  74.69 
 
 		 181 aa  200  9e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0280313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5751  PadR family transcriptional regulator  74.69 
 
 		 181 aa  200  9e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  0.410016 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  66.47 
 
 		 181 aa  193  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39320  transcriptional regulator, PadR family  66.47 
 
 		 184 aa  192  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.700238 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4957  transcriptional regulator, PadR-like family  51.76 
 
 		 212 aa  187  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9364  transcriptional regulator protein-like protein  53.48 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3567  PadR-like family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 213 aa  181  8.000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal  0.850546 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5383  transcriptional regulator, PadR-like family  56.85 
 
 		 249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7317  PadR-like family transcriptional regulator  53.76 
 
 		 229 aa  172  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0346  transcriptional regulator, PadR-like family  53.18 
 
 		 201 aa  172  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824785  normal  0.03301 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5073  transcriptional regulator, PadR-like family  51.6 
 
 		 205 aa  167  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3702  transcriptional regulator, PadR-like family  50.87 
 
 		 212 aa  159  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5920  transcriptional regulator, PadR-like family  53.96 
 
 		 198 aa  159  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2137  PadR family transcriptional regulator  49.69 
 
 		 199 aa  159  4e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4562  transcriptional regulator PadR family protein  56.42 
 
 		 211 aa  155  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.605184  normal  0.596762 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37830  transcriptional regulator, PadR family  47.18 
 
 		 227 aa  155  4e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4677  PadR family transcriptional regulator  48.04 
 
 		 203 aa  154  6e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3358  transcriptional regulator, PadR-like family  47.12 
 
 		 213 aa  152  4e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5080  PadR-like family transcriptional regulator  55.87 
 
 		 212 aa  152  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.6626  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2527  transcriptional regulator, PadR-like family  46.11 
 
 		 202 aa  150  8e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4528  PadR family transcriptional regulator  55.43 
 
 		 272 aa  150  8.999999999999999e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4200  transcriptional regulator, PadR-like family  45.36 
 
 		 209 aa  143  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3098  PadR family transcriptional regulator  46.89 
 
 		 187 aa  141  7e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3510  transcriptional regulator, PadR-like family  45.68 
 
 		 198 aa  141  7e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  31.34 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3181  transcriptional regulator, PadR-like family  30 
 
 		 177 aa  75.9  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000117068  hitchhiker  0.000000000506359 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4407  transcriptional regulator protein-like protein  30.16 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0291759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1535  transcriptional regulator, PadR-like family  29.14 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918183  normal  0.0405313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  32.57 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0038  transcriptional regulator, PadR-like family  38.78 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.698447  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2658  hypothetical protein  25.44 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287076  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2669  hypothetical protein  25.44 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.010535 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2526  PadR-like family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0713427  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2509  PadR-like family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2655  hypothetical protein  24.85 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2204  PadR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4689  transcriptional regulator  39.77 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284032  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2376  hypothetical protein  24.26 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247862  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2223  PadR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 372 aa  55.5  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0957891  hitchhiker  0.0000188934 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  31.96 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2451  hypothetical protein  24.26 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.073124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2413  hypothetical protein  24.26 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000015361  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2631  hypothetical protein  24.26 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2649  hypothetical protein  24.26 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115894 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4159  transcriptional regulator, PadR-like family  32.35 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25120  predicted transcriptional regulator  37.93 
 
 		 132 aa  51.6  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  50.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 109 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  28.24 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0813  PadR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.403384 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2808  PadR-like family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 180 aa  50.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0529  PadR-like family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 215 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85519  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1487  transcriptional regulator, PadR-like family  31.64 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.241527  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  37.8 
 
 		 116 aa  49.3  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  40.26 
 
 		 107 aa  49.3  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  38.16 
 
 		 118 aa  48.9  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06690  predicted transcriptional regulator  27.46 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000111873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0876  PadR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 179 aa  48.9  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.184962  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3551  transcriptional regulator, PadR-like family  26.49 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  33.57 
 
 		 180 aa  48.5  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2496  transcriptional regulator, PadR-like family  28 
 
 		 177 aa  48.5  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0617263  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0172  PadR-like family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 242 aa  48.1  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0144  transcriptional regulator, PadR-like family  25.18 
 
 		 179 aa  48.1  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0154267  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2059  PadR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 127 aa  48.1  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1578  PadR-like family transcriptional regulator  30 
 
 		 185 aa  48.1  0.00009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59882  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3730  hypothetical protein  32.61 
 
 		 107 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1365  transcriptional regulator, PadR-like family  36.78 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1513  hypothetical protein  33.7 
 
 		 107 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0927138 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0881  PadR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656788  normal  0.721066 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2347  PadR-like family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 103 aa  47.4  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.68087  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2305  transcriptional regulator, PadR-like family  32.97 
 
 		 250 aa  47.4  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3802  hypothetical protein  33.7 
 
 		 107 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.991383  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1858  PadR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 104 aa  47  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000789415  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1910  PadR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 174 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3483  hypothetical protein  32.61 
 
 		 109 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.134487  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00550  predicted transcriptional regulator  38.67 
 
 		 271 aa  47  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3448  transcriptional regulator  32.61 
 
 		 109 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3399  transcriptional regulator  32.61 
 
 		 109 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.314118  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3512  transcriptional repressor PadR  31.65 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3757  hypothetical protein  32.61 
 
 		 109 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3711  hypothetical protein  32.61 
 
 		 107 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0645400000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3753  hypothetical protein  32.61 
 
 		 107 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.722643  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3031  transcriptional regulator, PadR-like family  35.16 
 
 		 150 aa  47  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3486  PadR family transcriptional regulator  35 
 
 		 155 aa  46.2  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.179924 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3441  PadR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.690369  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  28.47 
 
 		 203 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1330  PadR-like family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 240 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.855689  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3380  PadR-like family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 107 aa  45.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.114558  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  33.73 
 
 		 112 aa  45.8  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1141  transcriptional regulator, PadR-like family  33.75 
 
 		 151 aa  45.4  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3142  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 121 aa  45.4  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1727  PadR-like family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 179 aa  45.4  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.765397 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1309  PadR-like family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 189 aa  45.8  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.123604 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1946  transcriptional regulator, PadR family  25.45 
 
 		 179 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>