More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0673 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0673  aminotransferase, class IV  100 
 
 		 247 aa  491  9.999999999999999e-139  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0968  aminotransferase class IV  50.42 
 
 		 249 aa  223  3e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0096  aminotransferase class IV  41.77 
 
 		 273 aa  165  8e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.609842  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0096  aminotransferase, class IV  40.49 
 
 		 273 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.198329  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0179  aminotransferase class IV  30.24 
 
 		 271 aa  111  9e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.613423  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0071  4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.91 
 
 		 290 aa  106  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  33.07 
 
 		 286 aa  102  5e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  33.2 
 
 		 290 aa  99  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2744  aminotransferase class IV  27.95 
 
 		 307 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0070  4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.52 
 
 		 290 aa  97.1  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.52 
 
 		 290 aa  97.1  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0079  4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.52 
 
 		 290 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000128474 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0070  4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.52 
 
 		 290 aa  97.1  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0069  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.71 
 
 		 290 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2654  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  28.11 
 
 		 307 aa  95.9  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2786  branched-chain amino acid aminotransferase  27.6 
 
 		 288 aa  95.5  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0082  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.89 
 
 		 290 aa  95.1  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2639  aminotransferase class IV  28.8 
 
 		 298 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  30.31 
 
 		 287 aa  95.1  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2223  branched-chain amino acid aminotransferase  28.45 
 
 		 303 aa  94.4  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  27.27 
 
 		 293 aa  94.4  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2140  branched-chain amino acid aminotransferase  26.77 
 
 		 322 aa  94.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0846884  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1464  aminotransferase, class IV  26.38 
 
 		 305 aa  94  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2839  aminotransferase class IV  27.56 
 
 		 307 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0464301  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2271  branched-chain amino acid aminotransferase  27.17 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0616  aminotransferase, class IV  31.14 
 
 		 252 aa  93.2  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.27072  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0078  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.45 
 
 		 290 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.199927  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  29.23 
 
 		 288 aa  93.2  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  29.21 
 
 		 295 aa  92.8  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2509  branched-chain amino acid aminotransferase  26.77 
 
 		 295 aa  93.2  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  30.96 
 
 		 299 aa  92.8  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0192  branched-chain amino acid aminotransferase  32.7 
 
 		 304 aa  92.8  5e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.749275 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2615  branched-chain amino acid aminotransferase  28.69 
 
 		 295 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.663717  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4079  branched-chain amino acid aminotransferase  24.02 
 
 		 294 aa  92.4  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  30.31 
 
 		 287 aa  92  7e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  30.4 
 
 		 287 aa  92  7e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2801  branched-chain amino acid aminotransferase  27.2 
 
 		 288 aa  92  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.581296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1140  branched-chain amino acid aminotransferase  27.2 
 
 		 288 aa  92  8e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.817897  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2810  branched-chain amino acid aminotransferase  28.27 
 
 		 295 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.92 
 
 		 290 aa  91.3  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2926  branched-chain amino acid aminotransferase  25.3 
 
 		 288 aa  91.3  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.458427  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  30.71 
 
 		 292 aa  90.9  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1646  branched-chain amino acid aminotransferase  26.36 
 
 		 296 aa  90.5  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0068  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.54 
 
 		 291 aa  90.9  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  30.74 
 
 		 292 aa  90.5  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  28.97 
 
 		 286 aa  90.9  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5238  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.63 
 
 		 290 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127403 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7270  branched-chain amino acid aminotransferase  27.46 
 
 		 295 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2587  branched-chain amino acid aminotransferase  27.97 
 
 		 295 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.53 
 
 		 285 aa  89.4  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6151  branched-chain amino acid aminotransferase  27.1 
 
 		 318 aa  88.6  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.285448 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  28.45 
 
 		 299 aa  87.4  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  26.64 
 
 		 293 aa  87.8  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3545  branched-chain amino acid aminotransferase  27.04 
 
 		 295 aa  86.7  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40526  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2216  aminotransferase class IV  29.82 
 
 		 250 aa  86.3  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.556361  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  29.74 
 
 		 298 aa  85.9  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2032  branched-chain-amino-acid transaminase  28.02 
 
 		 285 aa  85.9  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  29.74 
 
 		 298 aa  85.5  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  28.45 
 
 		 297 aa  85.9  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  29.74 
 
 		 298 aa  85.5  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  29.74 
 
 		 298 aa  85.5  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  29.74 
 
 		 298 aa  85.5  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  30.09 
 
 		 289 aa  85.5  7e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  29.31 
 
 		 298 aa  85.1  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2556  branched-chain amino acid aminotransferase  26.5 
 
 		 297 aa  85.5  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  29.31 
 
 		 298 aa  85.1  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2483  aminotransferase class IV  25.67 
 
 		 292 aa  85.1  9e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3604  branched-chain amino acid aminotransferase  38.1 
 
 		 311 aa  85.1  9e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  29.31 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0094  branched-chain amino acid aminotransferase  25.69 
 
 		 288 aa  85.1  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  29.31 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0461  aminotransferase class IV  27.82 
 
 		 311 aa  84.7  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.893728 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2602  branched-chain amino acid aminotransferase  25.4 
 
 		 289 aa  84.7  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0610  aminotransferase class IV  28.02 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0570431  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3301  branched-chain amino acid aminotransferase  24.51 
 
 		 289 aa  84.3  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1721  branched-chain amino acid aminotransferase  29.72 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0205647 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  29 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0316  branched-chain amino acid aminotransferase  37.27 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0549  branched-chain amino acid aminotransferase  34.84 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000680418  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1099  branched-chain amino acid aminotransferase  29.17 
 
 		 307 aa  83.2  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3362  branched-chain amino acid aminotransferase  30.52 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135741  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  27.48 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  27.85 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0177  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  26.83 
 
 		 286 aa  82.8  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  27.84 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  25 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.863889 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002039  branched-chain amino acid aminotransferase  32.87 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2490  branched-chain amino acid aminotransferase  34.65 
 
 		 319 aa  82.8  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1176  branched-chain amino acid aminotransferase  38.1 
 
 		 309 aa  82.8  0.000000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000401768 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2488  aminotransferase class IV  25.68 
 
 		 284 aa  82.8  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00412  branched-chain amino acid aminotransferase  31.17 
 
 		 312 aa  82.4  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1216  branched-chain amino acid aminotransferase  38.1 
 
 		 309 aa  82.4  0.000000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00270183 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  28.26 
 
 		 298 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3053  aminotransferase, class IV  28.12 
 
 		 496 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0981  branched-chain amino acid aminotransferase  39.29 
 
 		 309 aa  82  0.000000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000156201 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  26.82 
 
 		 295 aa  82  0.000000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  27.09 
 
 		 285 aa  82  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5314  aminotransferase, class IV  28.12 
 
 		 317 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.303303 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4955  aminotransferase class IV  29.79 
 
 		 496 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111871 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  25 
 
 		 299 aa  82  0.000000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>