More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0301 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0336  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.24 
 
 		 989 aa  947    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0301  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  100 
 
 		 977 aa  1961    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1209  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.13 
 
 		 955 aa  512  1e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00300001  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1246  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.23 
 
 		 955 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000605261  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0731  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.19 
 
 		 885 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000934537  n/a   
 
 
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NC_010320  Teth514_1465  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.81 
 
 		 811 aa  373  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0172153  n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_12210  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.78 
 
 		 814 aa  375  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000495428  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_0937  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.91 
 
 		 788 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010003  Pmob_0338  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.72 
 
 		 1035 aa  367  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.191067  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2289  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.62 
 
 		 907 aa  365  2e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.322971  hitchhiker  0.00000129081 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1346  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.43 
 
 		 827 aa  365  2e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000597878  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2614  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.62 
 
 		 578 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2006  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.37 
 
 		 586 aa  357  7.999999999999999e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0689  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.47 
 
 		 798 aa  356  1e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.944207  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.84 
 
 		 573 aa  353  1e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2512  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.22 
 
 		 785 aa  351  5e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000579618  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1287  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.97 
 
 		 831 aa  349  2e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0964  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.12 
 
 		 566 aa  348  3e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.010732  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3611  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.62 
 
 		 801 aa  348  3e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000975309  n/a   
 
 
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NC_008576  Mmc1_1758  exonuclease RecJ  35.75 
 
 		 592 aa  348  3e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.150743  normal  0.165864 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.66 
 
 		 568 aa  347  8e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008531  LEUM_1474  single-stranded DNA-specific exonuclease  35.94 
 
 		 655 aa  347  8.999999999999999e-94  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0855  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.12 
 
 		 566 aa  339  1.9999999999999998e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000731526  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_837  single-stranded-DNA-specific exonuclease  36.61 
 
 		 566 aa  338  2.9999999999999997e-91  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0560286  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2036  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.97 
 
 		 592 aa  337  3.9999999999999995e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008261  CPF_2322  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.78 
 
 		 592 aa  336  1e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
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NC_007514  Cag_0603  RecJ exonuclease  33.93 
 
 		 568 aa  334  4e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_0857  RecJ exonuclease  36.85 
 
 		 578 aa  334  5e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009972  Haur_4833  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.52 
 
 		 573 aa  334  6e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00133424  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_1327  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.95 
 
 		 599 aa  333  1e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.168372 
 
 
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NC_009674  Bcer98_3125  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.09 
 
 		 779 aa  331  4e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
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NC_008527  LACR_0656  exonuclease RecJ  36.51 
 
 		 742 aa  329  2.0000000000000001e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008346  Swol_0805  single-stranded DNA-specific exonuclease-like protein  36.53 
 
 		 932 aa  327  8.000000000000001e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00139649  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0687  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.95 
 
 		 574 aa  326  1e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0449163  n/a   
 
 
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NC_011059  Paes_1673  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.2 
 
 		 570 aa  325  3e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000218302  normal  0.669002 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0080  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.43 
 
 		 883 aa  325  3e-87  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010803  Clim_0558  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.71 
 
 		 571 aa  325  3e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175836  n/a   
 
 
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NC_004116  SAG1208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.01 
 
 		 732 aa  324  6e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_1890  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.65 
 
 		 574 aa  324  6e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000386066  n/a   
 
 
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NC_009523  RoseRS_2008  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.58 
 
 		 572 aa  323  9.000000000000001e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00291083  decreased coverage  0.00122076 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_4256  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.51 
 
 		 773 aa  323  9.999999999999999e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease  33.22 
 
 		 779 aa  321  5e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007643  Rru_A2408  RecJ exonuclease  33.63 
 
 		 606 aa  320  6e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014230  CA2559_02825  single-stranded-DNA-specific exonuclease recJ  35.46 
 
 		 568 aa  320  6e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.274504  n/a   
 
 
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NC_008009  Acid345_4172  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.23 
 
 		 579 aa  320  7e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.698282  normal  0.703771 
 
 
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NC_006274  BCZK4153  single-stranded-DNA-specific exonuclease  33.04 
 
 		 779 aa  320  9e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_4493  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.33 
 
 		 779 aa  320  1e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_4489  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.04 
 
 		 779 aa  319  1e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000134083 
 
 
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NC_011891  A2cp1_1415  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.05 
 
 		 573 aa  320  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_1313  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.26 
 
 		 573 aa  319  2e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0707  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.33 
 
 		 779 aa  319  2e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A4528  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.16 
 
 		 779 aa  318  2e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4543  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.33 
 
 		 779 aa  319  2e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011831  Cagg_1887  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.74 
 
 		 570 aa  318  3e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2536  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.81 
 
 		 564 aa  318  3e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.962109  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4304  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.04 
 
 		 779 aa  318  4e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4639  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.04 
 
 		 779 aa  318  4e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3931  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.59 
 
 		 572 aa  317  6e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.420242  normal  0.0571898 
 
 
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NC_013501  Rmar_2564  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.58 
 
 		 587 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1953  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.48 
 
 		 576 aa  313  7.999999999999999e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2314  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.56 
 
 		 560 aa  313  9e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.843202  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0590  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.28 
 
 		 568 aa  313  1e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50334  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.31 
 
 		 763 aa  313  1e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.904497  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6989  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.15 
 
 		 568 aa  312  2e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550153 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4073  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.01 
 
 		 864 aa  312  2e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00138727  n/a   
 
 
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NC_008530  LGAS_0826  single-stranded DNA-specific exonuclease  33.05 
 
 		 756 aa  310  8e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00114457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.58 
 
 		 568 aa  308  3e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.76607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0876  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.08 
 
 		 592 aa  307  7e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0250964  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1787  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.23 
 
 		 569 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0490686 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3683  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.42 
 
 		 567 aa  306  2.0000000000000002e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2106  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.88 
 
 		 573 aa  305  3.0000000000000004e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00306237  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1191  single strand DNA-specific exonuclease  36.14 
 
 		 736 aa  304  5.000000000000001e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0900  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.28 
 
 		 857 aa  303  7.000000000000001e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000643224  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4050  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.08 
 
 		 570 aa  303  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178442 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1195  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.54 
 
 		 584 aa  303  1e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0312  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.92 
 
 		 579 aa  301  4e-80  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3592  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.28 
 
 		 696 aa  301  5e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.800679  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0054  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.2 
 
 		 584 aa  299  1e-79  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0378  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.22 
 
 		 865 aa  300  1e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2398  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.61 
 
 		 577 aa  298  3e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.924128  normal  0.955687 
 
 
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NC_010830  Aasi_1422  hypothetical protein  30.87 
 
 		 566 aa  297  8e-79  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432451 
 
 
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NC_007512  Plut_0462  RecJ exonuclease  33.52 
 
 		 571 aa  296  1e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010571  Oter_3463  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.47 
 
 		 573 aa  296  1e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0980529  normal  0.938738 
 
 
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NC_011661  Dtur_1602  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.51 
 
 		 823 aa  295  3e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0450793  n/a   
 
 
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NC_013162  Coch_0347  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.59 
 
 		 564 aa  295  3e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002620  TC0732  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.92 
 
 		 582 aa  294  6e-78  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.213373  n/a   
 
 
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NC_014148  Plim_0674  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.62 
 
 		 583 aa  293  8e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013173  Dbac_2743  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.28 
 
 		 574 aa  292  2e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00277097  n/a   
 
 
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NC_013171  Apre_0909  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.91 
 
 		 576 aa  289  1e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007799  ECH_1115  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.21 
 
 		 589 aa  289  2e-76  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007354  Ecaj_0891  RecJ exonuclease  33.46 
 
 		 584 aa  288  4e-76  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013165  Shel_21910  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.35 
 
 		 1102 aa  287  5e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0138959 
 
 
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NC_013170  Ccur_04000  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.85 
 
 		 1134 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.20857  normal  0.544211 
 
 
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NC_013739  Cwoe_3186  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.42 
 
 		 846 aa  286  2.0000000000000002e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.28913  normal  1 
 
 
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NC_007413  Ava_2372  exonuclease RecJ  30.96 
 
 		 730 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.945407  normal  0.30551 
 
 
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NC_013223  Dret_0292  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.47 
 
 		 577 aa  286  2.0000000000000002e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011060  Ppha_2206  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.58 
 
 		 573 aa  285  4.0000000000000003e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.133994  n/a   
 
 
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NC_007604  Synpcc7942_1886  exonuclease RecJ  33.01 
 
 		 684 aa  284  5.000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011884  Cyan7425_4538  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.16 
 
 		 813 aa  284  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.954569 
 
 
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NC_007644  Moth_1681  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.24 
 
 		 911 aa  284  6.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.674318  normal  0.0670138 
 
 
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