66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2412 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2412  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 266 aa  518  1e-146  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.62011  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2428  putative ABC-2 type transporter permease  60.74 
 
 		 270 aa  310  1e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4390  ABC-2 type transporter  60.23 
 
 		 260 aa  309  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0235971 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4024  ABC-2 type transporter  57.04 
 
 		 267 aa  289  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166425 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4231  putative ABC-2 type transport system permease protein  61.85 
 
 		 270 aa  288  6e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1018  ABC-2 type transporter  50.38 
 
 		 261 aa  277  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1047  ABC-2 type transporter  50 
 
 		 261 aa  275  4e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0215536  unclonable  0.00000000290694 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0067  ABC transporter permease  51.54 
 
 		 269 aa  203  2e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.421472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13000  ABC-2 type transporter  33.46 
 
 		 235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1754  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  30.77 
 
 		 256 aa  123  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2707  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  32.58 
 
 		 240 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000874491  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0982  ABC-2 type transporter  29.02 
 
 		 235 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2204  ABC-type transport system involved in multi- copper enzyme maturation, permease component  27.13 
 
 		 235 aa  103  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000479866  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3077  ABC transporter, permease protein, putative  30.94 
 
 		 251 aa  98.6  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0296  ABC-2 type transporter  28.52 
 
 		 234 aa  92.4  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16880  putative permease of ABC transporter  30.23 
 
 		 244 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1562  ABC transporter, permease protein  30.74 
 
 		 244 aa  89  8e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0917389  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3237  ABC-2 type transporter  29.53 
 
 		 242 aa  86.7  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0727284 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2722  hypothetical protein  26.19 
 
 		 241 aa  86.7  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.619181  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1468  ABC transporter permease  31.76 
 
 		 244 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3143  ABC-2 type transporter  31.4 
 
 		 244 aa  85.9  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08366  ABC transporter, permease protein  27.84 
 
 		 242 aa  85.9  7e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00446835  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0004  hypothetical protein  28.67 
 
 		 260 aa  85.1  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.750522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3072  hypothetical protein  31.76 
 
 		 243 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1398  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  26.47 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1769  ABC-2 type transporter  30.45 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.434129  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0584  putative ABC-2 type transport system permease protein  32.76 
 
 		 244 aa  83.2  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.757639  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0683  ABC transporter, permease protein, putative  29.39 
 
 		 248 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2367  hypothetical protein  24.92 
 
 		 287 aa  80.9  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00928576  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6627  gliding motility-associated ABC transporter permease protein GldF  26.36 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.11106 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39210  ABC-2 type transport system permease  29.8 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0705149  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4184  ABC-2 type transporter  26.05 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4470  ABC transporter permease; gliding motility- associated protein  29.39 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1067  hypothetical protein  30.92 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0231  ABC transporter, permease protein  30.34 
 
 		 244 aa  72  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11610  ABC transporter permease  30.15 
 
 		 244 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0375  ABC transporter, inner membrane protein  31.1 
 
 		 964 aa  70.1  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0792117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2645  ABC transporter, permease protein, putative  30.31 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.691836  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0780  putative membrane spanning protein  26.77 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2069  ABC-2 type transporter  28.22 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0088  hypothetical protein  28.8 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754127  normal  0.283193 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0221  hypothetical protein  28.74 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.478655 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1546  ABC transporter permease; gliding motility-associated protein  30.34 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000287593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5656  ABC-type uncharacterized transport system  29.92 
 
 		 770 aa  64.3  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.319473 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2203  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility, auxiliary component-like protein  26.48 
 
 		 891 aa  63.2  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.775873  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2646  ABC transporter, permease protein, putative  27.07 
 
 		 250 aa  62  0.000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2141  ABC transporter, inner membrane protein  27.34 
 
 		 972 aa  61.2  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0919791  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2944  hypothetical protein  30.57 
 
 		 736 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2811  putative ABC transporter, permease protein  23.62 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291382  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2908  putative ABC-2 type transport system permease protein  24.22 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2841  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like  25.81 
 
 		 977 aa  58.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00280772  normal  0.38274 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6080  ABC-2 type transporter  25.84 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2668  ABC-2 type transporter  29.83 
 
 		 768 aa  56.2  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1356  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  31.17 
 
 		 748 aa  54.7  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2113  hypothetical protein  24.32 
 
 		 248 aa  52.8  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1946  protein involved in gliding motility GldF  28.02 
 
 		 239 aa  49.3  0.00006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0112  ABC-2 type transporter  25.52 
 
 		 372 aa  47.8  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0225544  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06359  hypothetical protein  25.24 
 
 		 366 aa  46.6  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  26.4 
 
 		 381 aa  45.4  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2920  ABC-2 type transporter  25.17 
 
 		 371 aa  45.4  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0341  ABC-2 type transporter  29.46 
 
 		 394 aa  43.9  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3052  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  24.72 
 
 		 767 aa  42.7  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4528  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  35.71 
 
 		 322 aa  43.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208639  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0990  ABC transporter, permease protein, putative  30.1 
 
 		 231 aa  43.1  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  24.27 
 
 		 366 aa  42.7  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  24.76 
 
 		 365 aa  42.4  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>