More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1673 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 
378 aa  751  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  61.97 
 
 
382 aa  426  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  61.83 
 
 
378 aa  409  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  59.68 
 
 
378 aa  396  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  54.64 
 
 
356 aa  367  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  55.65 
 
 
369 aa  366  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  49.88 
 
 
411 aa  364  1e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  54.86 
 
 
383 aa  364  1e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  54.64 
 
 
365 aa  349  4e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  54.64 
 
 
365 aa  349  4e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  54.64 
 
 
365 aa  349  4e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  53.08 
 
 
391 aa  340  4e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  52.56 
 
 
363 aa  337  2e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12257  bifunctional RNase H/acid phosphatase  53.39 
 
 
364 aa  322  5e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000101677  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  49.87 
 
 
401 aa  322  8e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  52.36 
 
 
402 aa  317  2e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  50 
 
 
412 aa  315  1e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  49.73 
 
 
370 aa  311  1e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  2.75954e-05  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  53.44 
 
 
366 aa  304  1e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  43.32 
 
 
412 aa  245  8e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  59.8 
 
 
440 aa  226  4e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  56.13 
 
 
427 aa  219  4e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  54.82 
 
 
452 aa  214  2e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  50 
 
 
215 aa  187  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  48.15 
 
 
218 aa  176  5e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09490  ribonuclease HI  60.49 
 
 
322 aa  171  1e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4815  ribonuclease H  63.16 
 
 
137 aa  152  8e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.084828  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  38.5 
 
 
214 aa  132  1e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  35.18 
 
 
213 aa  130  4e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.63977e-06  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  42.65 
 
 
205 aa  130  5e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  40.19 
 
 
235 aa  125  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  38.5 
 
 
205 aa  125  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  39.09 
 
 
253 aa  123  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 
208 aa  123  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  40.78 
 
 
214 aa  121  2e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  37.57 
 
 
201 aa  119  9e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  34.5 
 
 
213 aa  117  2e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  36.55 
 
 
202 aa  116  8e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  5.9372e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3084  alpha-ribazole phosphatase  33.67 
 
 
200 aa  114  2e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237454  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  36.32 
 
 
209 aa  112  7e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  32.66 
 
 
202 aa  112  9e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  32.32 
 
 
211 aa  112  9e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  36.84 
 
 
200 aa  111  2e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  39.18 
 
 
227 aa  111  2e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  35.5 
 
 
227 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  32.83 
 
 
213 aa  110  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2177  Phosphoglycerate mutase  34.52 
 
 
203 aa  109  8e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  36.41 
 
 
224 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  33.67 
 
 
200 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  37.29 
 
 
209 aa  108  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  32.77 
 
 
243 aa  108  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  31.77 
 
 
206 aa  108  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  38.14 
 
 
226 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  35.86 
 
 
212 aa  108  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  41.92 
 
 
210 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  37.63 
 
 
226 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  34 
 
 
240 aa  107  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  34.34 
 
 
213 aa  107  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  34.65 
 
 
209 aa  106  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  33.84 
 
 
201 aa  106  7e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  33.84 
 
 
201 aa  106  7e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  37.24 
 
 
222 aa  106  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  41.52 
 
 
208 aa  106  8e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  37.24 
 
 
222 aa  106  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1173  ribonuclease H  40 
 
 
194 aa  105  9e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  31.98 
 
 
200 aa  105  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  6.81703e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  34.34 
 
 
213 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  34.21 
 
 
256 aa  103  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 
212 aa  103  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3660  ribonuclease H  48.12 
 
 
133 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270083  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  32 
 
 
212 aa  103  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  31.34 
 
 
214 aa  103  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  31.34 
 
 
214 aa  103  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  32.85 
 
 
223 aa  102  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0330  phosphoglycerate mutase  34.48 
 
 
233 aa  102  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13280  fructose-2,6-bisphosphatase  38.58 
 
 
208 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.3 
 
 
212 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.17 
 
 
449 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  29.58 
 
 
217 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  32.85 
 
 
223 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  31.47 
 
 
200 aa  101  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  31.47 
 
 
200 aa  101  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  34.45 
 
 
220 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  49.23 
 
 
228 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  38.86 
 
 
203 aa  101  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1696  Phosphoglycerate mutase  34.83 
 
 
201 aa  100  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  41.57 
 
 
234 aa  100  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1136  phosphoglycerate mutase  32.52 
 
 
235 aa  100  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  40.61 
 
 
233 aa  100  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.5 
 
 
201 aa  100  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3383  phosphoglycerate mutase  35.58 
 
 
204 aa  100  6e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  31.47 
 
 
200 aa  99.8  7e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  2.1297e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0088  ribonuclease H  42.03 
 
 
211 aa  99.4  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  35.29 
 
 
213 aa  99  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  29.56 
 
 
203 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  29.56 
 
 
203 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  32.49 
 
 
212 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  29.56 
 
 
203 aa  99  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0651  phosphoglycerate mutase  41 
 
 
206 aa  99  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00089207  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  30.05 
 
 
203 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>