More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0651 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0651  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 206 aa  394  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00089207  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  43.14 
 
 		 205 aa  138  6e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  36.27 
 
 		 213 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  38.61 
 
 		 214 aa  123  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  34.15 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  38.12 
 
 		 202 aa  120  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  33.99 
 
 		 209 aa  115  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.51 
 
 		 212 aa  111  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  30.96 
 
 		 196 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  39.32 
 
 		 235 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  36.45 
 
 		 209 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  34.45 
 
 		 223 aa  108  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  38.68 
 
 		 224 aa  108  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  35.38 
 
 		 223 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  35.64 
 
 		 209 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  32.68 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  35.47 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  35.42 
 
 		 227 aa  105  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  30.69 
 
 		 209 aa  105  6e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  35.41 
 
 		 223 aa  105  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  32.35 
 
 		 200 aa  104  8e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  37.75 
 
 		 237 aa  103  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  33.01 
 
 		 448 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  37.02 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  35.89 
 
 		 220 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  41 
 
 		 378 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  39.41 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  41.79 
 
 		 440 aa  102  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  35.27 
 
 		 213 aa  102  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  32.84 
 
 		 212 aa  101  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  32.84 
 
 		 212 aa  101  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  35.03 
 
 		 217 aa  101  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 217 aa  101  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 		 207 aa  101  7e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  38.2 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.59 
 
 		 378 aa  100  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2646  Phosphoglycerate mutase  31.86 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.451935 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  36.6 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  30.2 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3084  alpha-ribazole phosphatase  35.35 
 
 		 200 aa  99.8  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237454  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  35.41 
 
 		 220 aa  99.8  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  36.27 
 
 		 214 aa  99.8  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  36.27 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  32.54 
 
 		 448 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  31.86 
 
 		 200 aa  99.8  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  31.86 
 
 		 200 aa  99.8  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  36.6 
 
 		 226 aa  99.4  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  32.69 
 
 		 201 aa  99.4  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  34.78 
 
 		 213 aa  99.8  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  32.69 
 
 		 201 aa  99.4  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  34.65 
 
 		 411 aa  98.6  5e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  32.51 
 
 		 212 aa  98.6  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  34.93 
 
 		 220 aa  98.6  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  35.41 
 
 		 221 aa  98.6  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.5 
 
 		 378 aa  98.6  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  34.95 
 
 		 214 aa  98.2  7e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  35.41 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  35.41 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  34.13 
 
 		 208 aa  95.9  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  32.02 
 
 		 213 aa  96.3  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.95 
 
 		 442 aa  95.9  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  31.75 
 
 		 447 aa  95.5  6e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.47 
 
 		 442 aa  94.7  7e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  34.88 
 
 		 240 aa  94.7  9e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  39.41 
 
 		 452 aa  94  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  32.2 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3311  Phosphoglycerate mutase  32.2 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16526  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  28.92 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.49 
 
 		 203 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  33.5 
 
 		 203 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  33.99 
 
 		 214 aa  93.6  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 		 445 aa  93.6  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  32.49 
 
 		 203 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  33.81 
 
 		 213 aa  93.6  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  43.86 
 
 		 243 aa  93.2  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  32.49 
 
 		 203 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  28.88 
 
 		 188 aa  92.8  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.33 
 
 		 449 aa  93.2  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.16 
 
 		 201 aa  92.8  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  32.99 
 
 		 205 aa  92.8  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.33 
 
 		 442 aa  92.4  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  32.49 
 
 		 203 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  32.49 
 
 		 203 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.29 
 
 		 443 aa  92.4  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  32.99 
 
 		 203 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  32.49 
 
 		 203 aa  92.4  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 200 aa  92  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  32.35 
 
 		 213 aa  92  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  33.8 
 
 		 229 aa  92.4  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  35.94 
 
 		 222 aa  91.7  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  38.24 
 
 		 391 aa  91.3  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  32.56 
 
 		 202 aa  91.3  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  32.35 
 
 		 213 aa  91.3  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  35.94 
 
 		 222 aa  91.7  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  34.65 
 
 		 223 aa  91.3  9e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.99 
 
 		 442 aa  91.3  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07531  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.69 
 
 		 547 aa  90.9  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  36.49 
 
 		 229 aa  90.1  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  24.2 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>