92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0874 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0874  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  100 
 
 
205 aa  417  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1173  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  43.94 
 
 
180 aa  95.5  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2307  putative regulator  39.6 
 
 
181 aa  93.2  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5629  putative signal transduction histidine kinase  39.86 
 
 
167 aa  87.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7294  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40 
 
 
161 aa  87.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0519  putative signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
165 aa  85.5  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0025  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  41.73 
 
 
226 aa  85.1  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2511  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.86 
 
 
130 aa  79.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4151  putative signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 
183 aa  79  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1228  putative signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 
169 aa  78.6  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.141602 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  35.88 
 
 
573 aa  76.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2536  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  38.46 
 
 
199 aa  75.9  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2480  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.41 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.252056 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1968  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.14 
 
 
216 aa  71.6  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.075139  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5311  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.53 
 
 
952 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.82 
 
 
1045 aa  68.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  34.03 
 
 
817 aa  67.8  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0164  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.25 
 
 
174 aa  64.3  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  34.33 
 
 
713 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1009  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  31.94 
 
 
743 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1263  response regulator receiver  34.81 
 
 
282 aa  62.4  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0593741  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  32.59 
 
 
697 aa  62.4  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0400  putative signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 
203 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2641  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.83 
 
 
122 aa  59.3  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000159202  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0743  putative PAS/PAC sensor protein  30.53 
 
 
855 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2843  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.79 
 
 
356 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0250  PAS containing protein phosphatase 2C-like  28 
 
 
753 aa  59.3  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337993  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2744  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.59 
 
 
155 aa  59.3  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.813583  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0838  putative PAS/PAC sensor protein  25.79 
 
 
754 aa  58.9  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4668  ATP-binding region ATPase domain protein  31.72 
 
 
148 aa  58.9  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1503  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.12 
 
 
192 aa  58.9  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.941649 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2634  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
227 aa  58.2  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  29.71 
 
 
591 aa  57  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.61 
 
 
549 aa  57.4  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2700  putative signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 
207 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.738661  normal  0.546363 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0109  putative PAS/PAC sensor protein  28.57 
 
 
776 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310164  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  33.08 
 
 
1039 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.08 
 
 
616 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.58 
 
 
738 aa  55.8  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3782  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.66 
 
 
146 aa  55.8  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0892  hypothetical protein  33.59 
 
 
195 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7826  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.72 
 
 
152 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1833  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  33.33 
 
 
234 aa  55.1  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0524  putative PAS/PAC sensor protein  30.82 
 
 
744 aa  54.3  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695402 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4166  putative PAS/PAC sensor protein  27.95 
 
 
765 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.299427  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0346  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.8 
 
 
122 aa  53.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.108962  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2800  putative signal transduction histidine kinase  27.89 
 
 
135 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.366639  normal  0.788147 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4531  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.84 
 
 
135 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  0.468222 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5266  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.94 
 
 
204 aa  51.2  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1779  putative signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 
214 aa  51.6  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.144417 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1570  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.61 
 
 
135 aa  50.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.196284  normal  0.153025 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2643  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.89 
 
 
688 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000425716  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0192  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.3 
 
 
177 aa  49.7  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.513716 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4104  stage II sporulation E family protein  29.93 
 
 
694 aa  49.3  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0104  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.45 
 
 
141 aa  48.9  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.141556  normal  0.0323603 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1989  putative PAS/PAC sensor protein  30.53 
 
 
722 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965966  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3501  putative PAS/PAC sensor protein  33.03 
 
 
1225 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.480314  normal  0.404449 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0489  putative signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 
145 aa  48.9  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2138  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  31.86 
 
 
155 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0220396  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4515  hypothetical protein  27.85 
 
 
176 aa  47  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6480  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.25 
 
 
134 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.903724  normal  0.217215 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1297  hypothetical protein  32.71 
 
 
187 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0095  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.2 
 
 
174 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2892  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  28.23 
 
 
202 aa  47  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1945  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.91 
 
 
142 aa  46.2  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00291504  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2967  hypothetical protein  30.09 
 
 
166 aa  46.2  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4524  protein serine/threonine phosphatase  28.78 
 
 
693 aa  46.2  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0305  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.31 
 
 
184 aa  46.6  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12283  normal  0.285434 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0287  protein phosphatase 2C-like protein  26.06 
 
 
743 aa  45.4  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.575817  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1416  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.71 
 
 
151 aa  45.4  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.034656  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0918  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  29.66 
 
 
142 aa  45.4  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.283269  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6631  putative signal transduction histidine kinase  26.4 
 
 
135 aa  45.1  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0674873 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0374  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.82 
 
 
248 aa  45.1  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4348  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.63 
 
 
119 aa  44.7  0.0009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00391365  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1327  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.88 
 
 
211 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.07 
 
 
579 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0238  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.67 
 
 
295 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.112494 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4525  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.55 
 
 
130 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1448  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.37 
 
 
164 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0047791  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3499  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.11 
 
 
187 aa  43.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7320  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.15 
 
 
288 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000252308  decreased coverage  0.00000000279842 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4370  putative signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 
134 aa  42.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0106  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 
461 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00764508  normal  0.232997 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0586  signal transduction histidine kinase, LytS  27.78 
 
 
123 aa  42.7  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0183303  hitchhiker  0.00998812 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1052  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  56.41 
 
 
655 aa  42.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620454  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1241  putative PAS/PAC sensor protein  45.1 
 
 
1432 aa  42  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402812 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3056  putative regulatory protein  30.22 
 
 
160 aa  42  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4051  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  29.08 
 
 
281 aa  41.6  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.932154  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1233  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.29 
 
 
151 aa  41.6  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.226283  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1655  hypothetical protein  33.08 
 
 
162 aa  41.2  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32040  histidine kinase  31.13 
 
 
156 aa  41.2  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3856  normal  0.302354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8367  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.97 
 
 
251 aa  41.2  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>