115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0083 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0083  TrkA-C domain protein  100 
 
 
160 aa  317  3e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1753  TrkA-C domain-containing protein  73.12 
 
 
160 aa  217  4e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2648  TrkA-C domain-containing protein  65.62 
 
 
160 aa  204  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.508711  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1892  TrkA-like  63.75 
 
 
160 aa  202  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30896  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2224  TrkA domain-containing protein  63.75 
 
 
186 aa  199  1e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4656  TrkA domain-containing protein  62.5 
 
 
160 aa  192  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3881  Putative regulatory ligand-binding protein related to C-terminal domains of K+ channels-like protein  63.12 
 
 
160 aa  189  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.122887 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0917  TrkA-C domain protein  56.88 
 
 
166 aa  178  3e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0119  TrkA domain-containing protein  57.59 
 
 
166 aa  165  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  2.59945e-05 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0407  TrkA-C domain protein  52.53 
 
 
161 aa  165  3e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0120  TrkA domain-containing protein  56.96 
 
 
196 aa  162  2e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1613  TrkA-C domain protein  50.62 
 
 
160 aa  158  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.634302  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2863  TrkA-C  51.25 
 
 
177 aa  153  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2893  TrkA domain-containing protein  51.25 
 
 
177 aa  153  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192796  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2907  TrkA domain-containing protein  51.25 
 
 
177 aa  153  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2652  TrkA-C domain protein  51.33 
 
 
154 aa  152  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  5.69154e-05  decreased coverage  0.000146029 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13266  hypothetical protein  48.75 
 
 
160 aa  147  5e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.36892 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1157  TrkA-C  41.77 
 
 
195 aa  142  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3875  TrkA domain-containing protein  45 
 
 
160 aa  140  8e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19010  predicted regulatory ligand binding protein, C-terminal domain of K+ channels like protein  45.57 
 
 
159 aa  139  1e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.990404  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2801  TrkA-C domain protein  43.4 
 
 
161 aa  132  2e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3662  TrkA-C domain protein  43.12 
 
 
160 aa  132  2e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1554  TrkA-C domain protein  31.65 
 
 
165 aa  87.8  5e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  6.86318e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1517  TrkA domain-containing protein  28.93 
 
 
164 aa  84.7  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2066  TrkA-C  28.57 
 
 
163 aa  82.8  2e-15  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3238  TrkA-C domain protein  29.86 
 
 
164 aa  81.3  5e-15  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.574158 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4776  potassium channel, C-terminus  28.67 
 
 
165 aa  69.3  2e-11  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0093582  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4757  hypothetical protein  28.67 
 
 
165 aa  68.2  4e-11  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.572942  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5157  trkA domain protein  28.67 
 
 
165 aa  68.6  4e-11  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09944e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4872  TrkA domain-containing protein  28.67 
 
 
165 aa  68.6  4e-11  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5188  TrkA domain-containing protein  28 
 
 
165 aa  66.6  1e-10  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4493  potasium uptake protein  28.19 
 
 
165 aa  66.2  2e-10  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4994  TrkA domain-containing protein  28.19 
 
 
165 aa  66.2  2e-10  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0407  TrkA-C domain protein  31.29 
 
 
158 aa  65.9  2e-10  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4640  TrkA domain-containing protein  28.19 
 
 
165 aa  66.2  2e-10  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4573  TrkA domain-containing protein  28.19 
 
 
165 aa  66.2  2e-10  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5287  TrkA domain-containing protein  28 
 
 
169 aa  65.9  2e-10  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4912  TrkA domain-containing protein  28 
 
 
169 aa  65.9  2e-10  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4854  trkA domain protein  28.86 
 
 
165 aa  65.9  2e-10  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5194  trkA domain protein  28 
 
 
164 aa  65.9  2e-10  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134848  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4475  potasium uptake protein  28.19 
 
 
165 aa  66.2  2e-10  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5202  trkA domain protein  28 
 
 
165 aa  65.9  2e-10  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4864  trkA domain protein  28.19 
 
 
165 aa  66.2  2e-10  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0383  trkA domain protein  28.19 
 
 
165 aa  65.9  2e-10  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0055  trkA domain protein  28 
 
 
164 aa  65.9  2e-10  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0095258  hitchhiker  8.99247e-09 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4878  trkA domain protein  28.19 
 
 
165 aa  65.9  2e-10  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4885  TrkA domain-containing protein  27.52 
 
 
165 aa  64.3  6e-10  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0233  TrkA-C domain protein  26.53 
 
 
164 aa  64.3  6e-10  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0860  TrkA domain-containing protein  30.13 
 
 
163 aa  64.3  7e-10  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3109  TrkA-C domain protein  28.4 
 
 
162 aa  62.8  2e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.196911  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0085  Putative regulatory ligand-binding protein related to C-terminal domains of K+ channels-like protein  39.24 
 
 
90 aa  61.6  4e-09  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0579  hypothetical protein  35.96 
 
 
90 aa  58.5  3e-08  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  38.89 
 
 
673 aa  58.9  3e-08  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0601  hypothetical protein  35.96 
 
 
90 aa  58.5  3e-08  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  40.24 
 
 
671 aa  57.4  8e-08  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0362  TrkA-C domain protein  29.88 
 
 
159 aa  56.6  1e-07  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.541071 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6030  hypothetical protein  36.36 
 
 
90 aa  55.8  2e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176794  normal  0.984792 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2191  TrkA-C domain protein  30.54 
 
 
162 aa  56.2  2e-07  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0206  TrkA domain-containing protein  26.45 
 
 
164 aa  55.5  3e-07  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  35 
 
 
674 aa  53.9  8e-07  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  42.5 
 
 
662 aa  53.5  1e-06  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  37.21 
 
 
667 aa  52.4  2e-06  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1208  TrkA-C domain protein  25 
 
 
166 aa  52.8  2e-06  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0323117  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2691  hypothetical protein  23.93 
 
 
163 aa  52  3e-06  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.392596  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0799  TrkA-C domain protein  28.76 
 
 
162 aa  50.4  9e-06  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.6922  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1301  sodium/hydrogen exchanger  35.62 
 
 
693 aa  49.7  2e-05  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  37.88 
 
 
672 aa  49.7  2e-05  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  45.28 
 
 
652 aa  48.5  3e-05  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  36 
 
 
668 aa  48.5  3e-05  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0968  TrkA-N domain protein  41.67 
 
 
544 aa  48.5  4e-05  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.153037 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1781  TrkA domain-containing protein  36.84 
 
 
222 aa  47.4  8e-05  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08127  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.85 
 
 
697 aa  47.4  9e-05  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1963  sodium/hydrogen exchanger  34.62 
 
 
684 aa  47.4  9e-05  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000770592  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2087  TrkA domain-containing protein  35.53 
 
 
222 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1338  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
201 aa  45.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0988  sodium/hydrogen exchanger  34.38 
 
 
676 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0062  putative potassium/proton antiporter  32.84 
 
 
720 aa  44.7  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000657168  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0356  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 
204 aa  44.7  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1081  hypothetical protein  33.93 
 
 
233 aa  44.3  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425328 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4027  TrkA family potassium uptake protein  39.29 
 
 
221 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.426006  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3720  Trk family potassium uptake protein  39.29 
 
 
221 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.430715  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3888  TrkA family potassium uptake protein  39.29 
 
 
221 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4191  TrkA family potassium uptake protein  39.29 
 
 
221 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3736  Trk family potassium uptake protein  39.29 
 
 
221 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  30.83 
 
 
227 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  34.92 
 
 
666 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1159  potassium uptake protein, TrkA family  39.29 
 
 
221 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10257  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1691  TrkA-C domain protein  24.6 
 
 
401 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4081  potassium uptake protein, TrkA family  39.29 
 
 
221 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4098  potassium uptake protein, TrkA family  39.29 
 
 
221 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00103413  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3993  potassium uptake protein, TrkA family  39.29 
 
 
221 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1810  sodium/hydrogen exchanger  32.79 
 
 
771 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2680  TrkA domain-containing protein  37.5 
 
 
221 aa  42.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  3.38081e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  29.73 
 
 
682 aa  42.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  29.58 
 
 
335 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4574  sodium/hydrogen exchanger  32.56 
 
 
764 aa  43.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.520226 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1134  GntR family transcriptional regulator  31.08 
 
 
213 aa  42.7  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  1.05089e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1522  TrkA-C domain protein  25.4 
 
 
405 aa  42.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.551094  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3805  TrkA domain-containing protein  39.29 
 
 
221 aa  43.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0251033  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1826  TrkA-N domain protein  41.07 
 
 
220 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>