More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0767 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0767  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 490 aa  944    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.184256 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1731  amino acid permease-associated region  59.13 
 
 		 509 aa  526  1e-148  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.177585  decreased coverage  0.00117638 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1747  amino acid permease-associated region  57.88 
 
 		 510 aa  507  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3178  amino acid permease-associated region  45.34 
 
 		 502 aa  375  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000963226  hitchhiker  0.000000000995055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7499  amino acid permease-associated region  42.8 
 
 		 495 aa  372  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1037  amino acid permease-associated region  41.12 
 
 		 509 aa  346  5e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.809227  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8962  amino acid permease-associated region  45.67 
 
 		 504 aa  333  6e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4018  amino acid permease-associated region  45.15 
 
 		 507 aa  306  6e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536093  hitchhiker  0.00116869 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1922  amino acid permease-associated region  39.57 
 
 		 485 aa  286  5e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.255466  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4433  amino acid permease-associated region  37.04 
 
 		 484 aa  277  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000491134  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6478  amino acid permease-associated region  36.31 
 
 		 479 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6713  amino acid permease-associated region  36.31 
 
 		 479 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1999  amino acid permease-associated region  34.69 
 
 		 483 aa  270  4e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1170  amino acid permease family protein  42.25 
 
 		 497 aa  264  4e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381443  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0436  amino acid permease-associated region  33.55 
 
 		 467 aa  259  9e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3239  amino acid permease-associated region  34.41 
 
 		 464 aa  254  3e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1105  amino acid permease-associated region  33.26 
 
 		 516 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.536968  normal  0.272162 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2557  amino acid permease-associated region  36.06 
 
 		 484 aa  243  5e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.058591 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0252  amino acid permease-associated region  35.28 
 
 		 485 aa  242  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4735  amino acid permease-associated region  36.13 
 
 		 488 aa  239  9e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0673378  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3953  amino acid permease-associated region  35.27 
 
 		 485 aa  234  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1630  amino acid permease-associated region  35.31 
 
 		 497 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.100446 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2722  amino acid permease-associated region  37 
 
 		 486 aa  221  3e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3507  amino acid permease-associated region  34.72 
 
 		 491 aa  215  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4853  amino acid permease-associated region  32.33 
 
 		 493 aa  209  7e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.983882  normal  0.590068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0605  amino acid permease-associated region  30.74 
 
 		 504 aa  208  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.912711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0199  amino acid permease-associated region  32.3 
 
 		 510 aa  206  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0208  amino acid permease-associated region  32.3 
 
 		 510 aa  206  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1795  amino acid permease-associated region  30.02 
 
 		 516 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0188  amino acid permease-associated region  32.22 
 
 		 510 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00320  amino acid transporter  35 
 
 		 483 aa  202  9.999999999999999e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1046  amino acid permease-associated region  35.66 
 
 		 492 aa  200  5e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20672  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5564  amino acid permease-associated region  30.46 
 
 		 510 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3579  amino acid permease-associated region  33.94 
 
 		 496 aa  196  6e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0153  amino acid permease-associated region  31.77 
 
 		 487 aa  196  7e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3754  amino acid permease-associated region  32.06 
 
 		 485 aa  196  9e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1244  amino acid permease-associated region  30.23 
 
 		 513 aa  195  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000000642825  decreased coverage  0.00000288489 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0145  amino acid permease-associated region  31.65 
 
 		 486 aa  186  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0955  amino acid transporter  27.8 
 
 		 481 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0667  amino acid permease-associated region  29.12 
 
 		 474 aa  174  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.819834  decreased coverage  0.000117019 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3067  amino acid permease-associated region  32.69 
 
 		 498 aa  169  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2078  amino acid permease-associated region  27.31 
 
 		 527 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.491472  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3299  amino acid permease-associated region  26.1 
 
 		 491 aa  92.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0648  amino acid permease-associated region  24.17 
 
 		 469 aa  85.9  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  28.15 
 
 		 461 aa  85.5  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35860  amino acid permease  29.38 
 
 		 434 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332281  decreased coverage  9.326859999999999e-20 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  25.93 
 
 		 462 aa  82.4  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  25.56 
 
 		 463 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0502  amino acid permease-associated region  26.3 
 
 		 492 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2573  amino acid permease-associated region  28.14 
 
 		 457 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  26.35 
 
 		 462 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  26.35 
 
 		 462 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  26.22 
 
 		 462 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  25.62 
 
 		 468 aa  80.9  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2626  amino acid permease-associated region  25.9 
 
 		 521 aa  80.5  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1698  amino acid permease-associated region  28.75 
 
 		 463 aa  79  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.471872  normal  0.470522 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2802  amino acid permease family protein  27.46 
 
 		 443 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0513  amino acid permease-associated region  26.68 
 
 		 492 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120819  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0357  amino acid permease-associated region  28.01 
 
 		 449 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.510995 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0524  amino acid permease-associated region  26.68 
 
 		 492 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  27.59 
 
 		 475 aa  77.4  0.0000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4749  amino acid permease-associated region  28.61 
 
 		 457 aa  76.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4368  amino acid permease-associated region  28.61 
 
 		 457 aa  76.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4455  amino acid permease-associated region  28.61 
 
 		 457 aa  76.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.103538  normal  0.0381095 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1312  amino acid permease-associated region  25.28 
 
 		 450 aa  76.3  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1271  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 449 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.633139  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6016  amino acid permease-associated region  26.91 
 
 		 463 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.838168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6094  amino acid permease-associated region  25.86 
 
 		 463 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0679218  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2029  amino acid permease family protein  26.22 
 
 		 442 aa  72.4  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1529  amino acid permease-associated region  25.87 
 
 		 473 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327796  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6300  amino acid permease-associated region  25.87 
 
 		 473 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.819384 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  24.86 
 
 		 454 aa  71.2  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5856  amino acid permease-associated region  25.86 
 
 		 463 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4371  amino acid permease-associated region  26.55 
 
 		 446 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670873  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3995  amino acid permease-associated region  26.55 
 
 		 446 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140691  normal  0.543798 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17740  amino acid ABC transporter permease  26.38 
 
 		 440 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6959  amino acid permease-associated region  25.87 
 
 		 473 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0415  putative transporter  28.21 
 
 		 464 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.824759  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1639  amino acid permease-associated region  25.21 
 
 		 446 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00236467  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2478  amino acid permease-associated region  24.21 
 
 		 459 aa  67.4  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.65738  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23470  amino acid transporter  23.5 
 
 		 465 aa  67.8  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00108461  hitchhiker  0.00000906997 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  26.4 
 
 		 465 aa  67  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2919  amino acid permease-associated region  24.19 
 
 		 507 aa  66.6  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1963  amino acid permease-associated region  25.78 
 
 		 468 aa  66.6  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.281005 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  26.21 
 
 		 440 aa  66.6  0.0000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3528  amino acid permease-associated region  25.72 
 
 		 446 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.802107 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1969  amino acid permease-associated region  26.79 
 
 		 487 aa  66.2  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0135269  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2329  amino acid permease-associated region  24.71 
 
 		 461 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1826  amino acid permease  24.53 
 
 		 461 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1938  amino acid permease  24.48 
 
 		 461 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.173953 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7480  amino acid permease-associated region  28.47 
 
 		 454 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3252  amino acid permease-associated region  25.23 
 
 		 464 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.719385  normal  0.223004 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1505  amino acid permease  24.38 
 
 		 461 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1035  amino acid permease-associated region  27.24 
 
 		 477 aa  65.9  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1544  putative amino acid permease  26.07 
 
 		 440 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01273  putrescine importer  24.38 
 
 		 461 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01284  hypothetical protein  24.38 
 
 		 461 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 441 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1411  amino acid permease  24.38 
 
 		 461 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04210  putative transporter  26.97 
 
 		 464 aa  63.9  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>