More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1693 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_1693  Exodeoxyribonuclease V  100 
 
 
1125 aa  2276    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1997  UvrD/REP helicase  27.01 
 
 
1110 aa  162  5e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.469294  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0372  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.75 
 
 
1168 aa  159  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0389874  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0551  UvrD/REP helicase  25.35 
 
 
1149 aa  152  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0345301  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0037  UvrD/REP helicase  26.88 
 
 
1115 aa  140  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1498  UvrD/REP helicase  26.36 
 
 
1080 aa  138  6.0000000000000005e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1322  hypothetical protein  30.54 
 
 
1057 aa  138  6.0000000000000005e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1893  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.06 
 
 
1200 aa  134  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000174869 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1357  UvrD/REP helicase  27.43 
 
 
1196 aa  132  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1061  ATP-dependent nuclease subunit A  24.87 
 
 
1241 aa  125  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1142  ATP-dependent nuclease subunit A  24.87 
 
 
1241 aa  125  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0629  UvrD/REP helicase  23.76 
 
 
854 aa  124  9.999999999999999e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1297  ATP-dependent nuclease, subunit A  24.92 
 
 
1241 aa  123  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1220  ATP-dependent nuclease, subunit A  24.79 
 
 
1240 aa  123  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1193  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.08 
 
 
1241 aa  123  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1245  ATP-dependent nuclease, subunit A  24.29 
 
 
1241 aa  121  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1041  ATP-dependent nuclease, subunit A  24.71 
 
 
1241 aa  121  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4148  ATP-dependent nuclease, subunit A  24.76 
 
 
1241 aa  121  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1041  recombination helicase AddA  24.35 
 
 
1241 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.552246  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1126  UvrD/REP helicase  26.1 
 
 
1173 aa  120  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.443367 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1157  hypothetical protein  24.97 
 
 
1061 aa  120  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1039  ATP-dependent nuclease, subunit A  24.76 
 
 
1241 aa  119  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5412  UvrD/REP helicase  26.42 
 
 
1117 aa  119  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0860  recombination helicase AddA  24.37 
 
 
1242 aa  117  8.999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2985  UvrD/REP helicase  28.52 
 
 
1131 aa  117  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.105436  normal  0.309308 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4408  UvrD/REP helicase  29.55 
 
 
1123 aa  115  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471337  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1805  UvrD/REP helicase  28.95 
 
 
1184 aa  115  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0359  UvrD/Rep/AddA family helicase  23.22 
 
 
1089 aa  115  6e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1571  UvrD/REP helicase  31.12 
 
 
1110 aa  114  9e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3105  UvrD/REP helicase  28.79 
 
 
1047 aa  114  9e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.224612  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0579  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  28.63 
 
 
1085 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0929  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.53 
 
 
1216 aa  114  1.0000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1681  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  25 
 
 
1217 aa  112  5e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1190  hypothetical protein  27.06 
 
 
1177 aa  111  7.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1031  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  24.42 
 
 
1204 aa  110  1e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.655323  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0691  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  30.06 
 
 
1200 aa  110  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2951  UvrD-like DNA helicase, C terminal  25.67 
 
 
1119 aa  110  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0785704  normal  0.12863 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2124  UvrD/REP helicase  27.34 
 
 
1147 aa  110  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0033  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  25.31 
 
 
1089 aa  108  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.115384 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1055  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.14 
 
 
1203 aa  106  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2131  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit A  27.24 
 
 
1187 aa  106  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.564437  normal  0.516906 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1101  UvrD/REP helicase  23.09 
 
 
1065 aa  105  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1034  UvrD/REP helicase  25.96 
 
 
1173 aa  105  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0891257  normal  0.693052 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2076  UvrD/REP helicase  27.44 
 
 
1240 aa  105  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.692604  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0086  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  26.19 
 
 
1183 aa  104  8e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1534  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  29.29 
 
 
1204 aa  103  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4066  UvrD/REP helicase  25.89 
 
 
1120 aa  103  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.160711 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0868  UvrD/REP helicase  24.42 
 
 
741 aa  103  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0085  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.66 
 
 
1139 aa  103  3e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0324  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.92 
 
 
1129 aa  102  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.904758 
 
 
-
 
NC_004310  BR2103  UvrD/Rep family helicase  26.44 
 
 
1180 aa  102  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.664576  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  23 
 
 
724 aa  102  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2149  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.02 
 
 
1203 aa  102  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.277093  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  23.42 
 
 
749 aa  102  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1146  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  26.19 
 
 
1236 aa  102  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  25.29 
 
 
705 aa  101  7e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1403  UvrD/REP helicase  29.07 
 
 
900 aa  101  9e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.405797  normal  0.0281555 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1433  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.64 
 
 
1199 aa  100  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2794  UvrD-like DNA helicase domain-containing protein  26.68 
 
 
1124 aa  100  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.370193 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.57 
 
 
759 aa  99.4  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1669  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.26 
 
 
805 aa  99.4  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2020  double-strand break repair helicase AddA  26.77 
 
 
1180 aa  99.4  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.411715  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1719  UvrD/REP helicase  27.69 
 
 
646 aa  99  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.571128  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3206  exonuclease V subunit beta  26.85 
 
 
1181 aa  99  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.146819  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0817  double-strand break repair helicase AddA  25.4 
 
 
1180 aa  98.6  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1235  UvrD/REP helicase  23.89 
 
 
680 aa  99  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1357  double-strand break repair helicase AddA  26.89 
 
 
1155 aa  99  5e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0782  UvrD/REP helicase  27.32 
 
 
1107 aa  98.6  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.685172  normal  0.12668 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0986  recombination helicase AddA  23.61 
 
 
1217 aa  98.6  6e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0857621  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0967  recombination helicase AddA  23.61 
 
 
1217 aa  98.6  6e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0419  UvrD/REP helicase  24.1 
 
 
1003 aa  98.2  7e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03831  UvrD/REP helicase  23.26 
 
 
805 aa  98.2  7e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.209332  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3376  UvrD/REP helicase  28.07 
 
 
659 aa  98.6  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2295  Exodeoxyribonuclease V  26.75 
 
 
1110 aa  98.2  8e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1666  UvrD/REP helicase  24.67 
 
 
921 aa  98.2  8e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.921097  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3157  exonuclease V subunit beta  26.85 
 
 
1181 aa  97.8  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0344  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.87 
 
 
1130 aa  97.8  9e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3140  exonuclease V subunit beta  26.85 
 
 
1181 aa  97.8  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1375  UvrD/REP helicase family protein  24.92 
 
 
1110 aa  97.8  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.134048  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3320  exonuclease V subunit beta  26.85 
 
 
1181 aa  97.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.602721 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3220  exonuclease V subunit beta  26.65 
 
 
1181 aa  97.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2768  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.24 
 
 
1286 aa  97.1  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4011  UvrD/REP helicase  26.57 
 
 
1083 aa  97.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.69 
 
 
753 aa  97.1  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2171  Exodeoxyribonuclease V  21.95 
 
 
1152 aa  96.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1286  UvrD/REP helicase  23.29 
 
 
1074 aa  96.3  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.17 
 
 
747 aa  96.7  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1315  ATP-dependent nuclease subunit A  24.75 
 
 
1110 aa  96.3  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2025  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.03 
 
 
1224 aa  96.7  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0453  DNA helicase II  24.32 
 
 
735 aa  96.3  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.723252  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.26 
 
 
753 aa  96.3  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  23.49 
 
 
753 aa  95.9  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  23.49 
 
 
751 aa  95.9  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0769  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  29.29 
 
 
1207 aa  95.9  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.49 
 
 
747 aa  95.9  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.49 
 
 
751 aa  95.9  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.49 
 
 
751 aa  95.5  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0993  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27 
 
 
1125 aa  95.5  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00861563  normal  0.126412 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1459  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.48 
 
 
1226 aa  95.5  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1775  hypothetical protein  25.62 
 
 
1076 aa  95.1  7e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>