203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0329 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0329  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 291 aa  597  1e-169  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000424657  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0311  beta-lactamase domain-containing protein  92.78 
 
 		 291 aa  565  1e-160  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000202771  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09640  beta-lactamase domain protein  38.64 
 
 		 298 aa  224  1e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0164  beta-lactamase domain-containing protein  39.73 
 
 		 293 aa  217  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3009  beta-lactamase domain-containing protein  37.04 
 
 		 301 aa  195  6e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.332764  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1210  metallo-beta-lactamase family protein  38.23 
 
 		 335 aa  188  9e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0422174  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2035  beta-lactamase domain-containing protein  36.3 
 
 		 301 aa  177  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0280  beta-lactamase-like protein  35.86 
 
 		 305 aa  172  5e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.888975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2191  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 308 aa  152  7e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.602262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0269  Beta-lactamase-like  31.53 
 
 		 297 aa  145  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120465  normal  0.961982 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1242  beta-lactamase domain-containing protein  29.04 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1007  beta-lactamase domain-containing protein  28.82 
 
 		 278 aa  77  0.0000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0161  beta-lactamase domain-containing protein  25.68 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0436  beta-lactamase domain protein  24.19 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0118  beta-lactamase domain protein  25.37 
 
 		 317 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.464415 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4226  beta-lactamase-like  24.3 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.733966  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0431  beta-lactamase domain-containing protein  24.79 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  26.69 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  26.35 
 
 		 313 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0258  putative beta lactamase protein  23.27 
 
 		 319 aa  62  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  27.57 
 
 		 214 aa  62  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0157  Beta-lactamase-like  26.55 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4274  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.29 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1264  beta-lactamase domain-containing protein  23.48 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2493  beta-lactamase-like  28.12 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  24.91 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0161  beta-lactamase domain-containing protein  25.52 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  28 
 
 		 198 aa  58.2  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0583  beta-lactamase domain-containing protein  26.07 
 
 		 307 aa  58.9  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.266418 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  24.91 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0123  beta-lactamase domain protein  28.5 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  25.28 
 
 		 325 aa  58.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1096  beta-lactamase domain-containing protein  23.33 
 
 		 309 aa  57  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  24.81 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4202  beta-lactamase domain-containing protein  25.45 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0111  beta-lactamase domain protein  23.88 
 
 		 317 aa  55.8  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.524145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0911  beta-lactamase domain protein  25.96 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  26.24 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4770  beta-lactamase domain protein  24.54 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2916  beta-lactamase-like protein  27.57 
 
 		 239 aa  55.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  27.59 
 
 		 215 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  27.59 
 
 		 215 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  28.57 
 
 		 329 aa  53.9  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  27.59 
 
 		 215 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  27.59 
 
 		 215 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0515  beta-lactamase domain-containing protein  26.89 
 
 		 308 aa  54.3  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  27.59 
 
 		 215 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  27.59 
 
 		 215 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1347  beta-lactamase domain protein  24.75 
 
 		 197 aa  53.9  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  27.59 
 
 		 215 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  27.94 
 
 		 215 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  24.65 
 
 		 206 aa  53.1  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  24.79 
 
 		 240 aa  52.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  27.59 
 
 		 215 aa  52.4  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2327  beta-lactamase domain protein  26.22 
 
 		 319 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  23.77 
 
 		 312 aa  51.2  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1178  beta-lactamase domain-containing protein  23.92 
 
 		 290 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0568  beta-lactamase domain protein  30.36 
 
 		 220 aa  51.2  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2483  putative Beta-lactamase  30.3 
 
 		 290 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  25.99 
 
 		 304 aa  50.8  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0035  beta-lactamase domain protein  25.26 
 
 		 210 aa  50.8  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1076  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 		 196 aa  50.1  0.00005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.253465  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0850  Beta-lactamase-like  21.76 
 
 		 197 aa  49.7  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0022  beta-lactamase domain protein  30.32 
 
 		 213 aa  49.7  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.887133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0809  hydroxyacylglutathione hydrolase  25.42 
 
 		 233 aa  49.3  0.00008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  23.3 
 
 		 241 aa  49.3  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2946  beta-lactamase domain protein  22.07 
 
 		 263 aa  48.5  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0171  beta-lactamase domain-containing protein  26.67 
 
 		 269 aa  48.1  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  22.58 
 
 		 310 aa  48.1  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0531  beta-lactamase domain protein  25.47 
 
 		 308 aa  47.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0019  beta-lactamase domain-containing protein  31.94 
 
 		 207 aa  47.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.751358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1345  beta-lactamase domain-containing protein  26.44 
 
 		 230 aa  47.8  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  21.25 
 
 		 312 aa  47.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0271  beta-lactamase domain protein  23.14 
 
 		 425 aa  47.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000349222  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  30.13 
 
 		 295 aa  47.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00755  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  34.85 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  29.37 
 
 		 209 aa  47.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1031  beta-lactamase domain protein  23.36 
 
 		 323 aa  47.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210455  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2351  beta-lactamase domain protein  26.09 
 
 		 297 aa  47  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.805454  normal  0.19339 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0397  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  26.49 
 
 		 250 aa  47.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0561  hydroxyacylglutathione hydrolase  26.49 
 
 		 250 aa  47.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0900  metallo-beta-lactamase family protein  24.36 
 
 		 198 aa  46.6  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3882  Zn-dependent hydrolase  25.27 
 
 		 317 aa  47  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0769  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 273 aa  46.6  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310253 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  22.22 
 
 		 314 aa  47  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3235  metallo-beta-lactamase family protein  24.12 
 
 		 213 aa  47  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  29.37 
 
 		 209 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  29.37 
 
 		 209 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0083  Beta-lactamase-like  23.39 
 
 		 304 aa  46.6  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0121  beta-lactamase-like protein  25.34 
 
 		 309 aa  46.6  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.381436  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  25.24 
 
 		 214 aa  46.6  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  24.34 
 
 		 214 aa  46.6  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  30.65 
 
 		 209 aa  46.6  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  29.84 
 
 		 209 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0462  beta-lactamase-like  33.33 
 
 		 292 aa  46.2  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3014  beta-lactamase domain protein  24.86 
 
 		 213 aa  46.2  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4206  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  24.91 
 
 		 317 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2832  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 317 aa  45.8  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.422682  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  25.24 
 
 		 214 aa  45.8  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3080  beta-lactamase-like  26.14 
 
 		 255 aa  45.8  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>