252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2397 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2397  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 332 aa  672    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2908  glycosyl transferase family protein  60.56 
 
 		 325 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.928359 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2718  glycosyl transferase family protein  60.75 
 
 		 325 aa  364  1e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.543733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2577  glycosyl transferase family protein  59.19 
 
 		 325 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3137  glycosyl transferase, group 2 family protein  59.5 
 
 		 325 aa  362  4e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46761  normal  0.406504 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4255  glycosyl transferase family protein  59.81 
 
 		 330 aa  358  6e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1005  putative glycosyl transferase, group 2 family protein  58.33 
 
 		 328 aa  350  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5290  glycosyl transferase family 2  53.07 
 
 		 334 aa  346  4e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2550  glycosyl transferase family 2  46.79 
 
 		 340 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.324951 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3565  glycosyl transferase family 2  47.09 
 
 		 340 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0316  glycosyl transferase family protein  45.57 
 
 		 320 aa  258  8e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2373  glycosyl transferase family protein  41.4 
 
 		 329 aa  188  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.20536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1850  glycosyl transferase family 2  34.91 
 
 		 362 aa  179  4.999999999999999e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1427  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.65 
 
 		 338 aa  176  6e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1813  glycosyl transferase family protein  34.14 
 
 		 362 aa  168  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2969  glycosyl transferase family 2  41.18 
 
 		 327 aa  162  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2877  glycosyl transferase family 2  40.76 
 
 		 327 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1376  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.84 
 
 		 369 aa  158  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1703  glycosyl transferase family 2  36.07 
 
 		 353 aa  150  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2880  glycosyl transferase family protein  28.27 
 
 		 331 aa  82  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.764984  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0149  glycosyl transferase family 2  31.99 
 
 		 357 aa  79  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.473763 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4359  glycosyl transferase family protein  28.52 
 
 		 332 aa  78.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.947946 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0383  glycosyl transferase family protein  26.22 
 
 		 331 aa  77.8  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0452  putative glycosyl transferase  27.31 
 
 		 332 aa  73.2  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1887  glycosyl transferase family protein  29.71 
 
 		 360 aa  72.8  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.95114  normal  0.84589 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3178  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 		 329 aa  72.8  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0248  glycosyl transferase family 2  29.7 
 
 		 348 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.617572 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0484  glycosyl transferase family 2  27.96 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  26.12 
 
 		 328 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3594  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4160  glycosyl transferase family 2  27.01 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0140  glycosyl transferase family protein  29.89 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2046  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 		 341 aa  64.3  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0590  glycosyl transferase family 2  29.78 
 
 		 329 aa  62  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3554  glycosyl transferase family 2  26.86 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.200701  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2471  glycosyl transferase family 2  24.79 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  22.95 
 
 		 528 aa  60.5  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3812  glycosyl transferase family 2  30.58 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4889  glycosyl transferase family 2  30.58 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0764718 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  29.05 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26171  TPR repeat-containing glycosyl transferase  37.31 
 
 		 427 aa  59.7  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.599832 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1776  glycosyl transferase family 2  24.68 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3595  glycosyl transferase family 2  31.53 
 
 		 331 aa  58.9  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1299  glycosyl transferase family protein  32 
 
 		 470 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0628268 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5057  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 		 470 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.67 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  25.85 
 
 		 337 aa  57  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 		 477 aa  57  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  30.26 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0466  glycosyl transferase family protein  27.37 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0600433  unclonable  0.0000113237 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0288  glycosyl transferase family protein  28.25 
 
 		 329 aa  55.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 333 aa  55.1  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0508  glycosyl transferase family protein  25.68 
 
 		 351 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.239818  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  28.71 
 
 		 1120 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3077  glycosyl transferase family protein  21.03 
 
 		 313 aa  54.3  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.243281 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  26.37 
 
 		 361 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  29.5 
 
 		 345 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  25.77 
 
 		 304 aa  53.9  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0082  O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase, putative  28.86 
 
 		 308 aa  53.5  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19572  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0085  glycosyl transferase family 2  28.86 
 
 		 308 aa  53.5  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0285695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3738  glycosyl transferase family 2  27.11 
 
 		 279 aa  53.1  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5500  glycosyl transferase family 2  29.95 
 
 		 308 aa  53.1  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  26.91 
 
 		 337 aa  53.1  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2154  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 		 466 aa  52.8  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.119958 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0353  glycosyl transferase family 2  22.06 
 
 		 312 aa  52.8  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000439981  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4770  glycosyl transferase family protein  47.3 
 
 		 324 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  29.53 
 
 		 345 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  25.55 
 
 		 317 aa  52.8  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2190  glycosyl transferase family 2  26.27 
 
 		 450 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1959  glycosyl transferase family protein  29.61 
 
 		 329 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.465626 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4523  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 		 336 aa  52  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131272  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00815  hypothetical protein  47.76 
 
 		 362 aa  51.6  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.491334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  25.59 
 
 		 333 aa  51.2  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1366  glycosyl transferase family protein  28 
 
 		 247 aa  50.8  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 		 1162 aa  50.8  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  26.73 
 
 		 313 aa  50.4  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0339  TPR repeat-containing protein  37.9 
 
 		 400 aa  50.8  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.698701  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  24.54 
 
 		 347 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11300  predicted glycosyltransferase  28.87 
 
 		 264 aa  50.4  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.438529  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1003  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.47 
 
 		 315 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1292  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.47 
 
 		 315 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3162  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.47 
 
 		 315 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3033  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.47 
 
 		 315 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2267  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.47 
 
 		 315 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.58247  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3136  glycosyl transferase family 2  27.98 
 
 		 320 aa  50.1  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3641  glycosyl transferase family protein  26.85 
 
 		 423 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1981  glycosyl transferase family 2  29.46 
 
 		 391 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.804142 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  26.76 
 
 		 323 aa  50.4  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1385  glycosyl transferase family protein  37.93 
 
 		 377 aa  50.1  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1248  glycosyl transferase family protein  46.15 
 
 		 249 aa  49.7  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.480822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3933  glycosyl transferase family 2  26.5 
 
 		 423 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1381  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.5 
 
 		 302 aa  49.7  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.247424  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2333  glycosyl transferase family protein  28.34 
 
 		 327 aa  49.7  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.012677  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0503  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 		 290 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0779995  normal  0.962073 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 924 aa  49.7  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2352  hypothetical protein  37.4 
 
 		 400 aa  49.3  0.00009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.831558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  23.81 
 
 		 309 aa  49.3  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2111  glycosyl transferase family 2  30.53 
 
 		 236 aa  49.3  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  25.75 
 
 		 311 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>