More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2098 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1649  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  43.62 
 
 		 1039 aa  787    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.880571  normal  0.706094 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18570  heavy metal efflux pump, CzcA family  44.23 
 
 		 1039 aa  784    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219423  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3400  CzcA family heavy metal efflux protein  49.9 
 
 		 1023 aa  936    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0110  heavy metal efflux pump, CzcA family  44.75 
 
 		 1049 aa  755    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.705785 
 
 
-
 
NC_002950  PG0064  CzcA family heavy metal efflux protein  46.03 
 
 		 1039 aa  890    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0949  heavy metal efflux pump, CzcA family  42.13 
 
 		 1053 aa  770    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2095  heavy metal efflux pump, CzcA family  44.61 
 
 		 1039 aa  791    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4569  CzcA family heavy metal efflux protein  44.19 
 
 		 1039 aa  775    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1329  CzcA family heavy metal efflux protein  43.62 
 
 		 1039 aa  782    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.039425  normal  0.381421 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1059  acriflavin resistance protein  35.59 
 
 		 1052 aa  637    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2073  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  40.58 
 
 		 1066 aa  736    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2351  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  39.87 
 
 		 1071 aa  753    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3058  acriflavin resistance protein  43.5 
 
 		 1066 aa  726    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1542  heavy metal efflux pump, CzcA family  41.98 
 
 		 1054 aa  763    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2063  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  40.87 
 
 		 1066 aa  738    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3471  CzcA family heavy metal efflux protein  45.38 
 
 		 1043 aa  786    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00106273  normal  0.764993 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3406  CzcA family heavy metal efflux protein  43.85 
 
 		 1043 aa  745    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2617  heavy metal efflux pump CzcA  43.73 
 
 		 1039 aa  782    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.427313 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0902  heavy metal efflux pump CzcA  41.55 
 
 		 1036 aa  706    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.920503 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1746  heavy metal efflux pump CzcA  45.84 
 
 		 1034 aa  837    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0995  heavy metal efflux pump, CzcA family  44.51 
 
 		 1048 aa  786    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.998262  normal  0.0908924 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2098  heavy metal efflux pump, CzcA family  100 
 
 		 1026 aa  1989    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0294  heavy metal efflux pump  48.92 
 
 		 1041 aa  899    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.393519  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0183  acriflavin resistance protein  40.65 
 
 		 1032 aa  646    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1103  heavy metal efflux pump, CzcA family  44.36 
 
 		 1049 aa  759    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.442224  normal  0.0460054 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1142  heavy metal efflux pump, CzcA family  44.31 
 
 		 1048 aa  774    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0325102  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1428  heavy metal efflux pump CzcA  37.23 
 
 		 1065 aa  635    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.905049  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1584  heavy metal efflux pump, CzcA family  66.21 
 
 		 1034 aa  1247    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2674  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  43.91 
 
 		 1039 aa  774    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4731  heavy metal efflux pump, CzcA family  45.82 
 
 		 1037 aa  756    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.971345 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1887  heavy metal efflux pump, CzcA family  46.3 
 
 		 1037 aa  771    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0646993  normal  0.625428 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2831  acriflavin resistance protein  43.86 
 
 		 1058 aa  726    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.310418 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2949  acriflavin resistance protein  43.67 
 
 		 1058 aa  714    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.522411 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2534  CzcA family heavy metal efflux protein  44.65 
 
 		 1049 aa  740    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4089  acriflavin resistance protein  43.28 
 
 		 1075 aa  736    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0144  CzcA family heavy metal efflux protein  45.35 
 
 		 1047 aa  793    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1742  CzcA family heavy metal efflux protein  44.42 
 
 		 1043 aa  762    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415877 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2382  heavy metal efflux pump, CzcA family  44.61 
 
 		 1039 aa  791    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0207882  hitchhiker  0.000762741 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4387  acriflavin resistance protein  48.69 
 
 		 1030 aa  737    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.285885  normal  0.792526 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5616  acriflavin resistance protein  45.03 
 
 		 1031 aa  758    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4094  CzcA family heavy metal efflux protein  50.44 
 
 		 1045 aa  907    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.966069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4126  heavy metal efflux pump, CzcA family  44.95 
 
 		 1049 aa  744    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0181  CzcA family heavy metal efflux protein  43.96 
 
 		 1047 aa  727    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.543317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1783  acriflavin resistance protein  44.86 
 
 		 1040 aa  763    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1991  heavy metal efflux pump, CzcA family  44.37 
 
 		 1061 aa  781    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623146  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0669  heavy metal efflux pump, CzcA family  43.25 
 
 		 1092 aa  792    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.725798  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02034  Heavy metal efflux pump CzcA  36.23 
 
 		 1069 aa  632  1e-180  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1856  heavy metal efflux pump CzcA  35.45 
 
 		 1064 aa  618  1e-175  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2867  CzcA family heavy metal efflux protein  36.06 
 
 		 1066 aa  614  9.999999999999999e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.212232  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  36.47 
 
 		 1043 aa  613  9.999999999999999e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4081  CzcA family heavy metal efflux protein  37.17 
 
 		 1082 aa  610  1e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0556  CzcA family heavy metal efflux protein  37.13 
 
 		 1076 aa  612  1e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1955  cation efflux system protein  35.09 
 
 		 1043 aa  606  9.999999999999999e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.180895  normal  0.172462 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0147  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.14 
 
 		 1443 aa  600  1e-170  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1583  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.33 
 
 		 1049 aa  599  1e-170  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.840242  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1968  CzcA family heavy metal efflux protein  35.06 
 
 		 1040 aa  600  1e-170  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.126074  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  35.25 
 
 		 1034 aa  595  1e-169  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1297  multidrug ABC transporter  38.24 
 
 		 1052 aa  598  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3356  CzcA family heavy metal efflux protein  35.75 
 
 		 1076 aa  597  1e-169  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0717317  decreased coverage  0.000585076 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  35.66 
 
 		 1070 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2212  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.4 
 
 		 1052 aa  598  1e-169  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3843  CzcA family heavy metal efflux protein  35.66 
 
 		 1070 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.591686  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2274  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.02 
 
 		 1034 aa  597  1e-169  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.256296 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  35.66 
 
 		 1070 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6172  CzcA family heavy metal efflux protein  35.66 
 
 		 1070 aa  596  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.324532 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1762  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.89 
 
 		 1063 aa  594  1e-168  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.900927  normal  0.462536 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0541  CzcA family heavy metal efflux protein  35.72 
 
 		 1074 aa  595  1e-168  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.865334  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3360  CzcA family heavy metal efflux protein  34.45 
 
 		 1032 aa  595  1e-168  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1184  heavy metal efflux pump CzcA, putative  39.2 
 
 		 1039 aa  594  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5980  heavy metal resistance protein CzcA  35.8 
 
 		 1063 aa  593  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000345716  normal  0.120659 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  36.18 
 
 		 1064 aa  591  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0520  CzcA family heavy metal efflux protein  35.81 
 
 		 1075 aa  592  1e-167  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  35.65 
 
 		 1053 aa  592  1e-167  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3968  heavy metal efflux pump CzcA  35.94 
 
 		 1075 aa  592  1e-167  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  35.47 
 
 		 1070 aa  589  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3188  CzcA family heavy metal efflux protein  36.48 
 
 		 1066 aa  591  1e-167  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  35.02 
 
 		 1040 aa  589  1e-167  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3513  CzcA family heavy metal efflux protein  36.81 
 
 		 1070 aa  589  1e-167  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3791  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.14 
 
 		 1068 aa  589  1e-167  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3341  CzcA family heavy metal efflux protein  36.12 
 
 		 1075 aa  588  1e-166  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  36.36 
 
 		 1070 aa  587  1e-166  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  35.42 
 
 		 1054 aa  588  1e-166  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3973  CzcA family heavy metal efflux protein  35.96 
 
 		 1068 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2337  CzcA family heavy metal efflux protein  35.87 
 
 		 1046 aa  586  1e-166  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0037806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4315  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.27 
 
 		 1046 aa  586  1e-166  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3847  CzcA family heavy metal efflux protein  35.96 
 
 		 1068 aa  588  1e-166  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0536  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.9 
 
 		 1034 aa  588  1e-166  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  36.63 
 
 		 1070 aa  587  1e-166  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  34.47 
 
 		 1053 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2717  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  35.52 
 
 		 1051 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.300642  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1941  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.64 
 
 		 1034 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3586  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  36.23 
 
 		 1062 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0060  CzcA family heavy metal efflux protein  34.47 
 
 		 1053 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890967 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0478  CzcA family heavy metal efflux protein  35.68 
 
 		 1068 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009512  Pput_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  34.47 
 
 		 1053 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.899246  hitchhiker  0.00920883 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1632  acriflavin resistance protein  36.59 
 
 		 1046 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.951985  normal  0.0573923 
 
 
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NC_009439  Pmen_1177  CzcA family heavy metal efflux protein  36.82 
 
 		 1048 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008228  Patl_2031  CzcA family heavy metal efflux protein  34.9 
 
 		 1037 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_4763  CzcA family heavy metal efflux protein  35.7 
 
 		 1029 aa  581  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0261947  normal  0.80493 
 
 
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NC_007947  Mfla_2566  heavy metal efflux pump CzcA  35.93 
 
 		 1046 aa  581  1e-164  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.609364 
 
 
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