267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11003 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11003  large-conductance mechanosensitive channel  100 
 
 		 151 aa  299  8.000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.00405e-34  normal  0.629119 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4672  large-conductance mechanosensitive channel  62.5 
 
 		 151 aa  160  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.419542  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4294  large-conductance mechanosensitive channel  61.84 
 
 		 151 aa  157  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.485783  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4380  large-conductance mechanosensitive channel  61.84 
 
 		 151 aa  157  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.443969  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4838  large-conductance mechanosensitive channel  53.85 
 
 		 144 aa  145  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619813 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1408  large conductance mechanosensitive channel protein  45.32 
 
 		 274 aa  115  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1892  large-conductance mechanosensitive channel  51.97 
 
 		 147 aa  112  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.211789 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0624  large conductance mechanosensitive channel protein  42.95 
 
 		 176 aa  108  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.29249  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30610  large conductance mechanosensitive channel protein  44.81 
 
 		 164 aa  107  5e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0156749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4648  large conductance mechanosensitive channel protein  40.38 
 
 		 146 aa  96.3  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.508499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0070  large conductance mechanosensitive channel protein  45.74 
 
 		 131 aa  94  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3277  large conductance mechanosensitive channel protein  47.55 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0090  large conductance mechanosensitive channel protein  42.48 
 
 		 151 aa  92.8  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.343086  normal  0.118693 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4049  large conductance mechanosensitive channel protein  38.96 
 
 		 152 aa  92.8  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0832  large conductance mechanosensitive channel protein  42.65 
 
 		 201 aa  91.7  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0900  large conductance mechanosensitive channel protein  42.22 
 
 		 166 aa  91.3  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8656  large conductance mechanosensitive channel protein  49 
 
 		 134 aa  90.1  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1924  Large-conductance mechanosensitive channel  39.55 
 
 		 168 aa  89.7  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.79206  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16810  mscL large conductance mechanosensitive channel protein  39.55 
 
 		 140 aa  89.7  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.230846  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13070  large conductance mechanosensitive channel protein  42.11 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00812185  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2817  large conductance mechanosensitive channel protein  48.44 
 
 		 130 aa  89  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234312  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2197  large conductance mechanosensitive channel protein  46.97 
 
 		 132 aa  87.8  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.270032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1843  large conductance mechanosensitive channel protein  39.39 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.130997  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2606  hypothetical protein  42.64 
 
 		 127 aa  85.5  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2461  hypothetical protein  42.97 
 
 		 127 aa  85.9  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1383  large conductance mechanosensitive channel protein  50.49 
 
 		 145 aa  85.9  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.190141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2291  large conductance mechanosensitive channel protein  46.09 
 
 		 131 aa  85.5  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0006  large conductance mechanosensitive channel protein  44.44 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404291  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2915  large conductance mechanosensitive channel protein  42.31 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2624  large conductance mechanosensitive channel protein  42.96 
 
 		 129 aa  85.1  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.462758 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1165  large conductance mechanosensitive channel protein  37.98 
 
 		 122 aa  85.5  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.221389  normal  0.423534 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0902  large conductance mechanosensitive channel protein  51.04 
 
 		 134 aa  84.7  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7238  large conductance mechanosensitive channel protein  45.31 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0390041  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0038  large conductance mechanosensitive channel protein  44.55 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1657  large-conductance mechanosensitive channel  42.52 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1750  large conductance mechanosensitive channel protein  40.15 
 
 		 133 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6488  large conductance mechanosensitive channel protein  42.86 
 
 		 169 aa  81.3  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.182707  normal  0.360955 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09820  large conductance mechanosensitive channel protein  43.27 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.390629 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1956  large conductance mechanosensitive channel protein  43.41 
 
 		 127 aa  79.7  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0317  large conductance mechanosensitive channel protein  41.27 
 
 		 123 aa  79.7  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209684  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3312  large conductance mechanosensitive channel protein  42.97 
 
 		 127 aa  79.7  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1972  large conductance mechanosensitive channel protein  42.31 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1428  large conductance mechanosensitive channel protein  41.54 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2403  large-conductance mechanosensitive channel  40.8 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000520108  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3137  large conductance mechanosensitive channel protein  41.41 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  42.22 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1319  large conductance mechanosensitive channel protein  42.5 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  36.69 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23920  large conductance mechanosensitive channel protein  40.16 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.814868 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1288  large conductance mechanosensitive channel protein  38.1 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0618  large-conductance mechanosensitive channel  37.19 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2265  large conductance mechanosensitive channel protein  36.88 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0292  large-conductance mechanosensitive channel  38.06 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  38.13 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0316  large conductance mechanosensitive channel protein  39.64 
 
 		 149 aa  73.6  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000219825  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0253  large-conductance mechanosensitive channel  38.1 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  39.42 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  39.42 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2342  large conductance mechanosensitive channel protein  40.6 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.998505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0437  large-conductance mechanosensitive channel  39.06 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000628379  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0941  large conductance mechanosensitive channel protein  38.13 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.954406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2962  large-conductance mechanosensitive channel  35.42 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1428  large conductance mechanosensitive channel protein  38.58 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000461871  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0724  large-conductance mechanosensitive channel  32.64 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1409  large-conductance mechanosensitive channel  40.31 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000000924927  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1436  large-conductance mechanosensitive channel  40.31 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000693237  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2607  large conductance mechanosensitive channel protein  38.36 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.681771 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0871  large conductance mechanosensitive channel protein  39.1 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2005  large conductance mechanosensitive channel protein  36.36 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323319  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1381  large conductance mechanosensitive channel protein  37.12 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0055  large conductance mechanosensitive channel protein  38.24 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.153997 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0880  large-conductance mechanosensitive channel  35.92 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0911634  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0352  large conductance mechanosensitive channel protein  36.36 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.559193  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3652  large-conductance mechanosensitive channel  38.69 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.326365 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1626  large conductance mechanosensitive channel protein  37.12 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000392194  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03141  large-conductance mechanosensitive channel  36.57 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0423  large conductance mechanosensitive channel protein  36.57 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3774  large-conductance mechanosensitive channel  36.57 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0382022  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03092  hypothetical protein  36.57 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3586  large-conductance mechanosensitive channel  36.57 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515412  normal  0.131611 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4613  large-conductance mechanosensitive channel  36.57 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000924287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3484  large-conductance mechanosensitive channel  36.57 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.175922  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0423  large-conductance mechanosensitive channel  36.57 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465174  hitchhiker  0.0000168159 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0756  large conductance mechanosensitive channel protein  36.84 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3208  large conductance mechanosensitive channel protein  37.32 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0654251  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2379  large-conductance mechanosensitive channel  32.64 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5645  large conductance mechanosensitive channel protein  39.6 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0366128  normal  0.120344 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0992  large-conductance mechanosensitive channel  33.57 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.158656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2162  large-conductance mechanosensitive channel  34.35 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3677  large-conductance mechanosensitive channel  35.82 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2630  large conductance mechanosensitive channel protein  34.07 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425108  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2802  large conductance mechanosensitive channel protein  37.32 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2579  large conductance mechanosensitive channel protein  37.32 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0457  large-conductance mechanosensitive channel  33.33 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3512  large conductance mechanosensitive channel protein  38.85 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.178106  normal  0.287508 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0163  large-conductance mechanosensitive channel  37.19 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4515  large-conductance mechanosensitive channel  36.84 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00658327  hitchhiker  0.00000531483 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06660  large conductance mechanosensitive channel protein  39.36 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00600968  normal  0.0734515 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0312  large-conductance mechanosensitive channel  35.66 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.929299  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0611  large-conductance mechanosensitive channel  35.66 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0263138  normal  0.217178 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>