194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2870 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2870  protein of unknown function YGGT  100 
 
 		 101 aa  194  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388606 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3096  protein of unknown function YGGT  52.48 
 
 		 102 aa  110  8.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.669144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3568  protein of unknown function YGGT  65 
 
 		 96 aa  85.5  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2879  protein of unknown function YGGT  56.41 
 
 		 96 aa  83.6  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147865 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0508  protein of unknown function YGGT  48.81 
 
 		 96 aa  81.6  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.842199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3527  hypothetical protein  46.43 
 
 		 99 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12787  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0057  protein of unknown function YGGT  46.43 
 
 		 96 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0478  hypothetical protein  50 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4761  protein of unknown function YGGT  48.19 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.211635 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3299  protein of unknown function YGGT  47.06 
 
 		 99 aa  75.9  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0607  protein of unknown function YGGT  50 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4152  hypothetical protein  52.7 
 
 		 96 aa  74.7  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2973  protein of unknown function YGGT  56.25 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3706  protein of unknown function YGGT  56.14 
 
 		 103 aa  73.6  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.535312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0989  protein of unknown function YGGT  55.38 
 
 		 114 aa  72.8  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4027  protein of unknown function YGGT  48.57 
 
 		 96 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1918  YGGT family protein  55.17 
 
 		 194 aa  70.9  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0053  protein of unknown function YGGT  46.25 
 
 		 99 aa  70.9  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.941254 
 
 
-
 
NC_004310  BR1992  YGGT family protein  55.17 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0271  hypothetical protein  50 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1370  protein of unknown function YGGT  58 
 
 		 100 aa  67.4  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0341  protein of unknown function YGGT  43.59 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3938  protein of unknown function YGGT  50.85 
 
 		 95 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0110  hypothetical protein  50 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0365579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1917  protein of unknown function YGGT  50 
 
 		 102 aa  64.3  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.951257  normal  0.340645 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4076  protein of unknown function YGGT  50.88 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3782  protein of unknown function YGGT  50.88 
 
 		 103 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.402098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3335  protein of unknown function YGGT  41.33 
 
 		 95 aa  63.2  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.982716 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  39.78 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4038  protein of unknown function YGGT  50.88 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.5468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0692  protein of unknown function YGGT  50.77 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3372  protein of unknown function YGGT  53.62 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0419  protein of unknown function YGGT  50.77 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0018  protein of unknown function YGGT  40.26 
 
 		 95 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1360  hypothetical protein  40.26 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4464  protein of unknown function YGGT  51.85 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0028  protein of unknown function YGGT  40.26 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.242413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2660  hypothetical protein  43.64 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0327  yggt family protein  37.04 
 
 		 97 aa  57.4  0.00000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  39.36 
 
 		 196 aa  57  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_002978  WD0121  YGGT family protein  36.36 
 
 		 92 aa  55.1  0.0000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1838  hypothetical protein  41.57 
 
 		 189 aa  53.1  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000231673  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0261  YGGT family protein  39.53 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.634053  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0438  protein of unknown function YGGT  39.53 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  32.26 
 
 		 197 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3629  protein of unknown function YGGT  50.85 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0534  protein of unknown function YGGT  46 
 
 		 194 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2655  protein of unknown function YGGT  35.71 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0666885  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3665  YGGT family protein  40.48 
 
 		 181 aa  52  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688821  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  33.71 
 
 		 197 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.762639 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3655  protein of unknown function YGGT  30.49 
 
 		 199 aa  51.6  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  40.22 
 
 		 105 aa  51.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3720  protein of unknown function YGGT  40.96 
 
 		 180 aa  50.8  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0933  protein of unknown function YGGT  35.96 
 
 		 85 aa  50.8  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0945487  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02073  hypothetical protein  36.49 
 
 		 183 aa  50.4  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.616502 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0541  membrane protein, related to K+ transport  37.68 
 
 		 184 aa  50.4  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.182958  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  35.11 
 
 		 196 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  35.11 
 
 		 196 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5573  hypothetical protein  34.09 
 
 		 187 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364539  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1230  protein of unknown function YGGT  44.78 
 
 		 182 aa  49.7  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000825612  normal  0.409234 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3609  protein of unknown function YGGT  37.5 
 
 		 189 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0956  protein of unknown function YGGT  34.12 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00321355  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05130  hypothetical protein  31.91 
 
 		 197 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.409368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3042  hypothetical protein  38.27 
 
 		 180 aa  49.3  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.390306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  37.8 
 
 		 196 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  36.59 
 
 		 196 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3001  hypothetical protein  37.78 
 
 		 187 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1125  protein of unknown function YGGT  43.28 
 
 		 182 aa  48.5  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000165213  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  36.59 
 
 		 196 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0947  protein of unknown function YGGT  41.79 
 
 		 192 aa  48.5  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  36.59 
 
 		 196 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002454  membrane protein  40.28 
 
 		 185 aa  48.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4032  protein of unknown function YGGT  42.19 
 
 		 184 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886825 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0492  hypothetical protein  30.85 
 
 		 197 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4199  protein of unknown function YGGT  33.73 
 
 		 186 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2479  protein of unknown function YGGT  39.71 
 
 		 182 aa  48.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.619107  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0773  protein of unknown function YGGT  41.33 
 
 		 184 aa  48.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.148544  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4087  protein of unknown function YGGT  33.73 
 
 		 186 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03300  hypothetical protein  38.96 
 
 		 178 aa  47.8  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0818  protein of unknown function YGGT  31.58 
 
 		 187 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2862  protein of unknown function YGGT  36.71 
 
 		 182 aa  47.4  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0177844  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0807  protein of unknown function YGGT  31.58 
 
 		 187 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.968375  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0758  protein of unknown function YGGT  35.29 
 
 		 184 aa  47.8  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2158  hypothetical protein  34.52 
 
 		 187 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.101701  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3185  protein of unknown function YGGT  35.71 
 
 		 182 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000491839  normal  0.0847291 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3042  protein of unknown function YGGT  35.71 
 
 		 182 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245532  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1336  protein of unknown function YGGT  35.71 
 
 		 182 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000680586  hitchhiker  0.0000219253 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0751  YGGT family membrane protein  34.52 
 
 		 187 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3027  protein of unknown function YGGT  35.71 
 
 		 182 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000050243  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2028  YGGT family membrane protein  34.52 
 
 		 187 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3358  protein of unknown function YGGT  34.33 
 
 		 188 aa  47.4  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0016989 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03580  hypothetical protein  38.89 
 
 		 182 aa  47.4  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3111  hypothetical protein  34.52 
 
 		 213 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2585  hypothetical protein  34.52 
 
 		 213 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3028  YGGT family membrane protein  34.52 
 
 		 213 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.952589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3083  YGGT family membrane protein  34.52 
 
 		 213 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2689  protein of unknown function YGGT  35.44 
 
 		 182 aa  47  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.885228  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1901  protein of unknown function YGGT  36.17 
 
 		 100 aa  47  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3657  hypothetical protein  34.78 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.516535  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1191  protein of unknown function YGGT  35.71 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0253033  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>