127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1972 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1972  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon-like protein  100 
 
 		 150 aa  308  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3541  hypothetical protein  65.31 
 
 		 156 aa  200  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0915855 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5554  hypothetical protein  65.03 
 
 		 157 aa  194  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2366  hypothetical protein  60.26 
 
 		 152 aa  189  9e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.206302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1027  hypothetical protein  53.06 
 
 		 175 aa  167  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3652  hypothetical protein  35.34 
 
 		 136 aa  82.4  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.92305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  32.52 
 
 		 133 aa  81.6  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  33.87 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  31.78 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0616  hypothetical protein  36.59 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  34.21 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  35.81 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  72  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  33.58 
 
 		 139 aa  72  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  29.17 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  25.36 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  34.45 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  29.31 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  33.64 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5644  hypothetical protein  33.65 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  27.03 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2152  hypothetical protein  28.16 
 
 		 311 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  38.89 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  31.11 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  30.17 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1903  hypothetical protein  29.57 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.539737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4054  hypothetical protein  28.57 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0163629  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  30.3 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0351  hypothetical protein  32.79 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000546433  hitchhiker  0.00000644081 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  30.66 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  30.66 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4153  hypothetical protein  30.17 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280027  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4412  hypothetical protein  31.3 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000585754  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  29.93 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  29.93 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  29.93 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1644  hypothetical protein  29.93 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.982412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0553  hypothetical protein  29.93 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0635  hypothetical protein  29.93 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  31.06 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6833  hypothetical protein  35 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  28.79 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4566  putative thiolase subunit  31.06 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00449482  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0905  hypothetical protein  30.91 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00718711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  29.23 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  29.27 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  31.3 
 
 		 321 aa  57.4  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  30.28 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4179  hypothetical protein  28.26 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  28.7 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  29.92 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2745  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  28.57 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0902  hypothetical protein  29.32 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5281  hypothetical protein  30.97 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  28.46 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3600  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0665674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  28.57 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  31.65 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  30.28 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0892  hypothetical protein  28.32 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.204366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0843  hypothetical protein  30.84 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  30.91 
 
 		 541 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2094  hypothetical protein  35.56 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4017  hypothetical protein  27.52 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  34.15 
 
 		 315 aa  53.5  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3311  hypothetical protein  28.21 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  30.28 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  27.27 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4268  hypothetical protein  27.19 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  29.7 
 
 		 140 aa  52.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2662  hypothetical protein  31.43 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4633  hypothetical protein  27.78 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1497  protein of unknown function DUF35  32.32 
 
 		 417 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  34.07 
 
 		 137 aa  52  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3214  hypothetical protein  29.33 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.907218  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3276  hypothetical protein  29.33 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3225  hypothetical protein  29.33 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2378  hypothetical protein  27.19 
 
 		 143 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.301734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2106  hypothetical protein  27.42 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.283808  normal  0.0319762 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  25.6 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2623  hypothetical protein  32.46 
 
 		 305 aa  50.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140164  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3318  hypothetical protein  31.71 
 
 		 312 aa  50.1  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206651 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  27.56 
 
 		 137 aa  50.1  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  27.78 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0042  hypothetical protein  25.22 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0051  hypothetical protein  25.22 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0173713  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0032  hypothetical protein  25.22 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662095  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  28.32 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  29.52 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2015  hypothetical protein  28.44 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  30 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3313  hypothetical protein  27.36 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2360  hypothetical protein  30.48 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.116484 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3932  protein of unknown function DUF35  28.57 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0458  hypothetical protein  27.71 
 
 		 182 aa  47.4  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2675  hypothetical protein  29.29 
 
 		 417 aa  47  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0178  hypothetical protein  29.47 
 
 		 134 aa  47.4  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5500  hypothetical protein  29.6 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0060  protein of unknown function DUF35  36.25 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3568  hypothetical protein  28.44 
 
 		 118 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>