More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0090 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0090  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 323 aa  647    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.537273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0448  aminodeoxychorismate lyase  61.25 
 
 		 312 aa  347  1e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1341  aminodeoxychorismate lyase  57.58 
 
 		 325 aa  341  8e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2521  aminodeoxychorismate lyase  48.48 
 
 		 372 aa  282  6.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1218  aminodeoxychorismate lyase  46.27 
 
 		 348 aa  259  3e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.319435 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  44.97 
 
 		 442 aa  249  5e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3356  aminodeoxychorismate lyase  44.74 
 
 		 349 aa  242  7.999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681449 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  41.9 
 
 		 412 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  42.72 
 
 		 456 aa  241  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  41.28 
 
 		 405 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  40.32 
 
 		 403 aa  237  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  40.87 
 
 		 414 aa  236  4e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3195  aminodeoxychorismate lyase  42.81 
 
 		 454 aa  235  7e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.934507  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0501  hypothetical protein  38.77 
 
 		 369 aa  235  8e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  43.49 
 
 		 399 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1529  aminodeoxychorismate lyase  44.78 
 
 		 331 aa  231  2e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.305783  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3717  aminodeoxychorismate lyase  42.55 
 
 		 471 aa  230  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444196  normal  0.13956 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3409  aminodeoxychorismate lyase  43.71 
 
 		 339 aa  230  3e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  40.19 
 
 		 467 aa  226  3e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  40.19 
 
 		 467 aa  226  4e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2470  aminodeoxychorismate lyase  39.43 
 
 		 415 aa  226  6e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0419  aminodeoxychorismate lyase  40.94 
 
 		 328 aa  224  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.290965  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  40.5 
 
 		 464 aa  224  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0466  hypothetical protein  40.68 
 
 		 438 aa  224  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1630  aminodeoxychorismate lyase  39.72 
 
 		 385 aa  223  3e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118431  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0892  aminodeoxychorismate lyase  41.51 
 
 		 579 aa  222  8e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0855314 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1072  aminodeoxychorismate lyase  38.34 
 
 		 392 aa  221  9e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.232656  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0462  hypothetical protein  39.03 
 
 		 412 aa  221  9.999999999999999e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.218984  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  41.67 
 
 		 391 aa  221  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2296  aminodeoxychorismate lyase  40.31 
 
 		 599 aa  218  7.999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2303  aminodeoxychorismate lyase  38.49 
 
 		 422 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0207028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2976  aminodeoxychorismate lyase  38.17 
 
 		 425 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3481  aminodeoxychorismate lyase  38.29 
 
 		 418 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114938  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2179  hypothetical protein  38.58 
 
 		 384 aa  216  4e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  39.43 
 
 		 416 aa  216  5e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3821  hypothetical protein  39.12 
 
 		 406 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.133528 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  37.85 
 
 		 407 aa  207  2e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2465  hypothetical protein  52.09 
 
 		 393 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.347128  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1127  aminodeoxychorismate lyase  52.09 
 
 		 392 aa  202  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1988  aminodeoxychorismate lyase  38.39 
 
 		 345 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  38.51 
 
 		 333 aa  199  5e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0717  aminodeoxychorismate lyase  37.12 
 
 		 335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.16974  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1055  aminodeoxychorismate lyase  35.17 
 
 		 384 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.921254  normal  0.096534 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2903  aminodeoxychorismate lyase  46.64 
 
 		 392 aa  190  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.167786  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1919  aminodeoxychorismate lyase  38.69 
 
 		 363 aa  188  1e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.402452  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003000  hypothetical protein  35.84 
 
 		 338 aa  187  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0577137  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2198  aminodeoxychorismate lyase  36.45 
 
 		 331 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.955684 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02904  hypothetical protein  33.73 
 
 		 338 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2264  hypothetical protein  35.83 
 
 		 345 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188751  normal  0.305668 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1612  hypothetical protein  34.55 
 
 		 340 aa  178  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000845082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1938  aminodeoxychorismate lyase  35.5 
 
 		 345 aa  176  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110627  normal  0.289211 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2254  aminodeoxychorismate lyase  36.2 
 
 		 323 aa  176  6e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  34.44 
 
 		 334 aa  175  7e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02713  hypothetical protein  38.74 
 
 		 357 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.117678  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1042  aminodeoxychorismate lyase  32.93 
 
 		 336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0148163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1077  aminodeoxychorismate lyase  36.52 
 
 		 315 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.578473  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1783  hypothetical protein  35.08 
 
 		 377 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0308564  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1641  hypothetical protein  35.76 
 
 		 350 aa  172  7.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.667934  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1584  aminodeoxychorismate lyase  35.76 
 
 		 364 aa  172  7.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0339039  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  33.94 
 
 		 332 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1380  aminodeoxychorismate lyase  34.84 
 
 		 339 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2244  aminodeoxychorismate lyase  36.7 
 
 		 336 aa  170  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00467758  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1877  aminodeoxychorismate lyase  37.17 
 
 		 328 aa  170  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.10744 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1275  hypothetical protein  36.68 
 
 		 340 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310439  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1578  aminodeoxychorismate lyase  33.44 
 
 		 335 aa  169  6e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1313  hypothetical protein  37.45 
 
 		 340 aa  169  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000010184 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2170  hypothetical protein  37.45 
 
 		 340 aa  169  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.7368  hitchhiker  0.0000000000000363112 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1987  hypothetical protein  37.45 
 
 		 340 aa  169  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000318105  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1298  hypothetical protein  37.45 
 
 		 340 aa  169  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166048  hitchhiker  0.00000000000000101215 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1544  aminodeoxychorismate lyase  36.6 
 
 		 333 aa  169  7e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0483176  normal  0.0781021 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5194  aminodeoxychorismate lyase  33.55 
 
 		 339 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.374187 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2504  aminodeoxychorismate lyase  37.7 
 
 		 337 aa  167  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.917927  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0125  aminodeoxychorismate lyase  37.41 
 
 		 393 aa  167  2e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000881139  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01093  predicted aminodeoxychorismate lyase  36.68 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000123905  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1997  hypothetical protein  34.93 
 
 		 331 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01101  hypothetical protein  36.68 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000104993  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1830  aminodeoxychorismate lyase  37.46 
 
 		 342 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1219  hypothetical protein  36.68 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000544785  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2227  hypothetical protein  36.68 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000358206  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  36.03 
 
 		 339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1218  hypothetical protein  36.68 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000109839  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1831  aminodeoxychorismate lyase  33.23 
 
 		 339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2504  hypothetical protein  36.68 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000670285  unclonable  0.0000000117832 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2030  hypothetical protein  36.68 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000821549  hitchhiker  0.00000424543 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3387  aminodeoxychorismate lyase  35.8 
 
 		 329 aa  167  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.107935  normal  0.0743499 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2550  aminodeoxychorismate lyase  36.68 
 
 		 340 aa  166  4e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202204  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  33.33 
 
 		 370 aa  166  4e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1476  hypothetical protein  36.29 
 
 		 340 aa  166  4e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000304616  hitchhiker  0.00000000000128745 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  34.22 
 
 		 338 aa  166  4e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1426  aminodeoxychorismate lyase  34.1 
 
 		 332 aa  166  5e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219736  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1633  hypothetical protein  34.29 
 
 		 355 aa  166  6.9999999999999995e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  33.54 
 
 		 324 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1803  aminodeoxychorismate lyase  32.9 
 
 		 339 aa  165  8e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  33.78 
 
 		 343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0154  aminodeoxychorismate lyase  32.68 
 
 		 427 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1488  hypothetical protein  32 
 
 		 346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0806646  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0967  aminodeoxychorismate lyase  35.86 
 
 		 357 aa  163  3e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829028  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1871  aminodeoxychorismate lyase  36.93 
 
 		 336 aa  163  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1863  aminodeoxychorismate lyase  34.42 
 
 		 356 aa  163  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.322444  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1910  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 		 341 aa  163  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000953369  decreased coverage  0.000000738863 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>