More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0397 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0397  carbohydrate ABC transporter  100 
 
 		 626 aa  1233    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7737  carbohydrate ABC transporter  56.5 
 
 		 619 aa  607  9.999999999999999e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2561  ABC transporter related protein  56.04 
 
 		 616 aa  596  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4186  ABC transporter related  51.58 
 
 		 611 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.938404  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3756  ABC transporter related  51.19 
 
 		 595 aa  491  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5831  ABC transporter related  49.49 
 
 		 633 aa  482  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2031  ABC transporter related  51.45 
 
 		 500 aa  364  2e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2541  ABC transporter related  36.5 
 
 		 613 aa  338  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684037 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3260  ABC transporter related  35.89 
 
 		 623 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0661  ABC transporter related  37.57 
 
 		 625 aa  325  2e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1719  ABC transporter related  35.58 
 
 		 631 aa  311  2e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.737168  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1982  ABC transporter-related protein  36.19 
 
 		 621 aa  304  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186428  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2067  ABC transporter related  36.39 
 
 		 621 aa  303  8.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.351689  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1897  ABC transporter, ATPase subunit  35.7 
 
 		 621 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.423681  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0530  ABC transporter related  37.91 
 
 		 625 aa  296  1e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3357  ABC transporter related  31.67 
 
 		 592 aa  292  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0894  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.08 
 
 		 600 aa  290  4e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.652846  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0404  ABC transporter related protein  33.78 
 
 		 609 aa  290  6e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3698  ABC transporter related  33.07 
 
 		 611 aa  288  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.736817 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0061  ABC transporter related  34.82 
 
 		 606 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4332  ABC transporter related  34.79 
 
 		 614 aa  283  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.754277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2538  ABC transporter related  31.84 
 
 		 619 aa  277  4e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2224  ABC transporter-like  33.17 
 
 		 604 aa  273  6e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.5 
 
 		 603 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1915  ABC transporter related  33.28 
 
 		 613 aa  266  5.999999999999999e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1963  ABC transporter related  36.01 
 
 		 625 aa  266  1e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0472516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2295  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  34.09 
 
 		 603 aa  266  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000465139 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4501  ABC transporter related  34.63 
 
 		 621 aa  265  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1927  ABC transporter related  34.62 
 
 		 615 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0429  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  33.28 
 
 		 618 aa  263  6e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2022  ABC transporter related  29.79 
 
 		 605 aa  263  6.999999999999999e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029505 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0389  ABC transporter related protein  32.5 
 
 		 616 aa  262  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2085  ABC transporter related  33.11 
 
 		 618 aa  262  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.836292 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2353  ABC transporter related  33.17 
 
 		 618 aa  262  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0478  ABC transporter related  30.91 
 
 		 611 aa  261  3e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0961856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0086  ABC transporter related  32.76 
 
 		 618 aa  254  4.0000000000000004e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0117635  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2389  ABC transporter related  34.42 
 
 		 615 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.168027 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00656  ABC transporter ATP-binding protein  36.84 
 
 		 626 aa  251  2e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2701  ABC transporter related  33.73 
 
 		 605 aa  251  3e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1868  ABC transporter related  34.86 
 
 		 638 aa  251  4e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133041  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2658  ABC transporter related  34.1 
 
 		 623 aa  248  3e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0555578 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2183  ABC transporter related protein  33.72 
 
 		 608 aa  247  4e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5807  ABC transporter related  35.18 
 
 		 627 aa  247  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1807  ABC transporter related protein  34.16 
 
 		 662 aa  247  4.9999999999999997e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0965737  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3591  ABC transporter related protein  35.3 
 
 		 623 aa  242  2e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.727827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0971  ABC transporter related protein  33.63 
 
 		 626 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3487  ABC transporter related protein  33.6 
 
 		 616 aa  239  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908956  normal  0.590401 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1838  ABC transporter related protein  33.78 
 
 		 611 aa  238  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.263806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7945  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.83 
 
 		 633 aa  235  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0603  ABC transporter-like protein  35.73 
 
 		 599 aa  234  3e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1832  ABC transporter related  31.81 
 
 		 608 aa  226  1e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1278  ABC transporter related protein  33.39 
 
 		 617 aa  226  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2000  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  26.21 
 
 		 566 aa  225  2e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0533598  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2944  subtilin ABC transporter  27.96 
 
 		 597 aa  225  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000010922  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2447  ABC transporter related  35.22 
 
 		 647 aa  225  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.12281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0411  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  25.71 
 
 		 587 aa  225  2e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0829  ABC transporter, ATP-binding protein  27.1 
 
 		 603 aa  223  9e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.588647  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0315  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  25.99 
 
 		 594 aa  222  9.999999999999999e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0817  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  26.82 
 
 		 603 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4410  ABC transporter related  37.59 
 
 		 631 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3877  ABC transporter related  37.27 
 
 		 673 aa  221  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0212257 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2876  ABC transporter related  33.91 
 
 		 619 aa  212  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.39915  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4885  ABC transporter related  34.03 
 
 		 626 aa  211  5e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0323  ABC transporter-related protein  27.69 
 
 		 608 aa  209  8e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1248  ABC transporter related  27.32 
 
 		 604 aa  209  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0261442  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5809  ABC transporter related  35.28 
 
 		 578 aa  209  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  38.48 
 
 		 720 aa  208  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3590  ABC transporter related protein  43.46 
 
 		 604 aa  208  2e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.657817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0479  ABC transporter related protein  29.87 
 
 		 596 aa  207  4e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  47.66 
 
 		 585 aa  207  4e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1247  ABC transporter related  27.37 
 
 		 611 aa  206  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  29.76 
 
 		 700 aa  206  1e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08270  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.9 
 
 		 596 aa  204  3e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00203006  normal  0.441586 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  34.88 
 
 		 699 aa  204  3e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6772  type I secretion system ATPase  29.73 
 
 		 712 aa  204  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 600 aa  204  4e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0777  ABC transporter related  35.21 
 
 		 635 aa  203  8e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193136  normal  0.304338 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2586  ABC transporter related  33.7 
 
 		 619 aa  203  9e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000702067 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  31.53 
 
 		 587 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  31.09 
 
 		 611 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  28.81 
 
 		 594 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  36.81 
 
 		 598 aa  201  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2201  ABC transporter related  28.71 
 
 		 618 aa  201  3.9999999999999996e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0878043  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2769  ABC transporter related  38.78 
 
 		 618 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  33.7 
 
 		 598 aa  200  7e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4440  ABC transporter related  43.91 
 
 		 665 aa  200  7.999999999999999e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.25933  normal  0.204471 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  34.28 
 
 		 597 aa  199  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  32.14 
 
 		 636 aa  197  3e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  28.02 
 
 		 580 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0282  ABC transporter related protein  32.08 
 
 		 600 aa  196  9e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  34.05 
 
 		 636 aa  195  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  29.72 
 
 		 556 aa  195  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  30.81 
 
 		 741 aa  195  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  28.72 
 
 		 617 aa  195  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3226  ABC transporter related  35.06 
 
 		 589 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  33.91 
 
 		 582 aa  194  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0807  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.27 
 
 		 605 aa  194  3e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0191  ABC transporter related  40.36 
 
 		 579 aa  194  4e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.059505  normal  0.523004 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0888  ABC transporter related  27.67 
 
 		 593 aa  194  5e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.315462  hitchhiker  0.00000912514 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  29.81 
 
 		 728 aa  194  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.819615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>