More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3170 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  56.17 
 
 
648 aa  704  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  56.02 
 
 
648 aa  701  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1009  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  56 
 
 
648 aa  707  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351129  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0943  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  56 
 
 
648 aa  709  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483741  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2235  hypothetical protein  55.71 
 
 
654 aa  693  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1867  ABC transporter related  56.79 
 
 
655 aa  740  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  56.31 
 
 
648 aa  714  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  56.15 
 
 
648 aa  713  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2467  ABC transporter related  57.3 
 
 
650 aa  730  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.385523  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1792  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  57.73 
 
 
653 aa  730  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  56.17 
 
 
648 aa  702  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  69.89 
 
 
648 aa  927  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6202  macrolide ABC transporter ATP-binding/membrane protein  55.74 
 
 
654 aa  706  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.486155  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  84.71 
 
 
667 aa  1154  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  83.28 
 
 
682 aa  1155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  4.32999e-09 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  100 
 
 
647 aa  1318  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  57.56 
 
 
646 aa  716  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2316  ABC transporter related  59.97 
 
 
648 aa  761  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0769  ABC transporter related  61.53 
 
 
650 aa  808  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0562  ABC transporter related  57.54 
 
 
665 aa  695  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  59.64 
 
 
678 aa  802  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  3.85404e-05  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2937  ABC transporter related  53.24 
 
 
668 aa  676  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697708  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3444  ABC transporter related  53.24 
 
 
668 aa  676  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625414  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0926  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  57.43 
 
 
653 aa  719  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5332  ABC transporter related  55.21 
 
 
681 aa  742  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0305255 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0097  macrolide-specific ABC-type efflux carrier MacB  52.58 
 
 
668 aa  676  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  83.14 
 
 
682 aa  1155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  59.49 
 
 
678 aa  801  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  56.07 
 
 
648 aa  702  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  2.97537e-08  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  58.78 
 
 
652 aa  786  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2219  ABC transporter related  57.82 
 
 
652 aa  757  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1297  ABC transporter related  65.05 
 
 
652 aa  795  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  56.27 
 
 
696 aa  734  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  4.02561e-08  unclonable  1.13397e-09 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2453  ABC transporter related  60.15 
 
 
676 aa  744  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  54.77 
 
 
649 aa  714  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0835  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  57.43 
 
 
653 aa  720  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.077145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4954  ABC transporter related  55.21 
 
 
681 aa  741  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0415826  normal  0.0801144 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  83.71 
 
 
656 aa  1129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0759  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  50.23 
 
 
641 aa  638  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.043367  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0724  hypothetical protein  55.75 
 
 
687 aa  753  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798634  normal  0.150655 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  56.15 
 
 
648 aa  710  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  69.89 
 
 
648 aa  927  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  63.43 
 
 
647 aa  821  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  56.17 
 
 
648 aa  704  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  54.62 
 
 
649 aa  709  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  84.71 
 
 
667 aa  1155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  83.84 
 
 
656 aa  1129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  57.43 
 
 
653 aa  746  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0572  macrolide ABC transporter ATPase/inner membrane protein  58.31 
 
 
665 aa  717  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.412698  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  55.9 
 
 
653 aa  741  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  53.53 
 
 
642 aa  697  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2832  syringolide efflux protein SyfD  55.86 
 
 
668 aa  719  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237626  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  61.53 
 
 
649 aa  819  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  59.49 
 
 
678 aa  801  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.05037e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  56.17 
 
 
648 aa  704  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  52.09 
 
 
642 aa  694  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  52.62 
 
 
646 aa  677  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  56.17 
 
 
648 aa  704  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  56.68 
 
 
648 aa  733  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2215  hypothetical protein  55.61 
 
 
651 aa  717  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167589  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  56.17 
 
 
648 aa  704  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2185  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  57.43 
 
 
653 aa  718  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1296  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  59.22 
 
 
647 aa  742  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  49.15 
 
 
640 aa  620  1e-176  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2115  ABC transporter related  50.08 
 
 
647 aa  598  1e-170  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0918  ABC transporter, ATP-binding protein  48.02 
 
 
643 aa  592  1e-167  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0636  macrolide-specific efflux protein macB  48.01 
 
 
641 aa  587  1e-166  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00901082  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1063  macrolide-specific efflux protein macB  48.01 
 
 
641 aa  586  1e-166  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00606621  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0710  macrolide-specific efflux protein macB  47.69 
 
 
641 aa  580  1e-164  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  48.62 
 
 
652 aa  575  1e-163  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  47.2 
 
 
671 aa  569  1e-161  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  47.63 
 
 
653 aa  562  1e-159  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  46.59 
 
 
661 aa  560  1e-158  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  47.93 
 
 
651 aa  556  1e-157  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  46.6 
 
 
663 aa  539  1e-152  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  46.13 
 
 
644 aa  539  1e-152  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  45.07 
 
 
654 aa  538  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  46.37 
 
 
663 aa  535  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  45.32 
 
 
657 aa  528  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  45.4 
 
 
654 aa  525  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1684  ABC transporter related  47.09 
 
 
656 aa  525  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  45.39 
 
 
656 aa  520  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  44.71 
 
 
657 aa  512  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3283  ABC transporter related  44.41 
 
 
666 aa  513  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.477638  normal  0.90811 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3236  hypothetical protein  45.9 
 
 
650 aa  506  1e-142  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3534  ABC transporter related  44.71 
 
 
654 aa  508  1e-142  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.639834 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2041  ABC transporter, ATPase subunit  44.33 
 
 
645 aa  501  1e-140  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.568421  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6611  ABC transporter related  43.03 
 
 
660 aa  481  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.961968 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  40.85 
 
 
653 aa  473  1e-132  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  42.15 
 
 
643 aa  473  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  41.49 
 
 
658 aa  462  1e-128  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  40.81 
 
 
657 aa  457  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  40.36 
 
 
657 aa  449  1e-125  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  38.7 
 
 
656 aa  449  1e-125  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  38.87 
 
 
657 aa  431  1e-119  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3413  hypothetical protein  56.84 
 
 
373 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.779659  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  38.25 
 
 
670 aa  419  1e-115  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  36.35 
 
 
715 aa  413  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5133  ABC transporter related  42.61 
 
 
640 aa  410  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.316349  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  36.86 
 
 
707 aa  402  1e-110  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>