194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1524 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  75.04 
 
 
607 aa  958  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  89.66 
 
 
609 aa  1149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  6.339e-11 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  78.51 
 
 
609 aa  999  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  100 
 
 
609 aa  1263  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  75.98 
 
 
616 aa  970  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  2.86308e-06  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  90.31 
 
 
609 aa  1147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  75.78 
 
 
610 aa  962  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  89.98 
 
 
609 aa  1144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  80.46 
 
 
611 aa  1019  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  5.55519e-06 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  74.88 
 
 
616 aa  966  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  77.55 
 
 
609 aa  956  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  89.49 
 
 
609 aa  1148  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  4.29666e-05 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  89.82 
 
 
609 aa  1140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  90.15 
 
 
609 aa  1145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  3.491e-08 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  89.71 
 
 
609 aa  1114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  89.85 
 
 
611 aa  1146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  4.85801e-09 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  42.74 
 
 
629 aa  509  1e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  43.19 
 
 
592 aa  498  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0145  hypothetical protein  40.33 
 
 
637 aa  483  1e-135  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.549685  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0128  hypothetical protein  40.46 
 
 
635 aa  481  1e-134  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.185093  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  43.17 
 
 
611 aa  460  1e-128  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3567  hypothetical protein  43.9 
 
 
621 aa  451  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.103554  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7255  protein of unknown function DUF885  39.6 
 
 
589 aa  442  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409593  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2922  protein of unknown function DUF885  37.35 
 
 
646 aa  437  1e-121  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.799276  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  39.45 
 
 
619 aa  432  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  39.12 
 
 
1283 aa  432  1e-119  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0768  protein of unknown function DUF885  37.15 
 
 
593 aa  414  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  38.39 
 
 
615 aa  393  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  37.26 
 
 
616 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  4.81618e-06  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  37.24 
 
 
616 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  5.02664e-05  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  35.1 
 
 
585 aa  380  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  36.94 
 
 
616 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  37.1 
 
 
616 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  2.23999e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  34.62 
 
 
601 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  37 
 
 
615 aa  378  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  34.62 
 
 
601 aa  377  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  34.28 
 
 
603 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  37.16 
 
 
615 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  35.56 
 
 
594 aa  378  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  36.46 
 
 
628 aa  375  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  33.61 
 
 
603 aa  373  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  36 
 
 
614 aa  375  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  34.11 
 
 
603 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  4.26014e-10 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  34.28 
 
 
601 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  34.78 
 
 
601 aa  372  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  35.75 
 
 
627 aa  373  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  37 
 
 
615 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  35.89 
 
 
617 aa  372  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  36.3 
 
 
605 aa  370  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  33.94 
 
 
603 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  35.89 
 
 
613 aa  372  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  33.78 
 
 
603 aa  369  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2185  putative lipoprotein  36.33 
 
 
617 aa  366  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0983749  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  35.66 
 
 
589 aa  368  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  37.32 
 
 
624 aa  365  1e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.99463e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  34.3 
 
 
602 aa  363  4e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  32.32 
 
 
602 aa  363  4e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  35.3 
 
 
613 aa  363  5e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  1.82029e-06  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  36.21 
 
 
619 aa  362  1e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  37.77 
 
 
611 aa  361  2e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  39.3 
 
 
614 aa  360  3e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  35.74 
 
 
591 aa  360  4e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  33.66 
 
 
599 aa  359  7e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2484  hypothetical protein  36.5 
 
 
625 aa  359  8e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129536  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  36.99 
 
 
614 aa  359  9e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  37.66 
 
 
614 aa  358  1e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  37.12 
 
 
614 aa  358  2e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  35.09 
 
 
599 aa  357  3e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  38.79 
 
 
599 aa  356  7e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0380  protein of unknown function DUF885  34.75 
 
 
588 aa  356  8e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  36.96 
 
 
617 aa  354  3e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  35.05 
 
 
587 aa  353  7e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  35.38 
 
 
618 aa  351  2e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  1.60677e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  36.69 
 
 
608 aa  351  3e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  34.66 
 
 
618 aa  350  6e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  37.75 
 
 
607 aa  350  6e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  5.15921e-05 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3959  protein of unknown function DUF885  36.26 
 
 
590 aa  350  6e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  37.75 
 
 
607 aa  349  8e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  37.75 
 
 
607 aa  349  8e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1202  hypothetical protein  36.1 
 
 
584 aa  349  1e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  35.05 
 
 
583 aa  348  2e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  34.17 
 
 
625 aa  347  4e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3489  hypothetical protein  37.67 
 
 
586 aa  344  3e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  36.11 
 
 
605 aa  343  5e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  33.39 
 
 
595 aa  340  3e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  35.91 
 
 
629 aa  338  2e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  39.48 
 
 
622 aa  337  3e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2850  hypothetical protein  31.76 
 
 
613 aa  328  2e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3854  hypothetical protein  37.86 
 
 
593 aa  327  5e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01443  hypothetical protein  34.54 
 
 
621 aa  324  3e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  34.26 
 
 
628 aa  323  6e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  32.11 
 
 
610 aa  320  7e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0166  hypothetical protein  34.46 
 
 
598 aa  317  5e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3202  putative lipoprotein  32.13 
 
 
633 aa  303  6e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0165  hypothetical protein  32.7 
 
 
608 aa  300  4e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  32.53 
 
 
608 aa  297  3e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1492  hypothetical protein  36.56 
 
 
628 aa  296  7e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  1.65722e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  33.17 
 
 
635 aa  296  1e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0095  hypothetical protein  33.17 
 
 
635 aa  295  1e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0094  hypothetical protein  33.76 
 
 
635 aa  295  2e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>