More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0443 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0347  hypothetical protein  95.81 
 
 		 454 aa  896    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166165 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0344  aconitate hydratase  95.81 
 
 		 454 aa  895    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4371  hypothetical protein  92.07 
 
 		 454 aa  859    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0337  aconitate hydratase  95.59 
 
 		 454 aa  892    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0322  hypothetical protein  70.26 
 
 		 454 aa  680    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00168086 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4599  hypothetical protein  70.7 
 
 		 454 aa  685    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000326637 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3514  hypothetical protein  68.5 
 
 		 453 aa  644    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0443  hypothetical protein  100 
 
 		 454 aa  925    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3891  hypothetical protein  68.94 
 
 		 459 aa  653    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0347  hypothetical protein  92.51 
 
 		 454 aa  865    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0339  aconitate hydratase  96.04 
 
 		 454 aa  898    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53194  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3679  hypothetical protein  92.51 
 
 		 454 aa  865    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.824748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0349  hypothetical protein  67.03 
 
 		 455 aa  648    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0338  aconitate hydratase  92.29 
 
 		 454 aa  864    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3382  hypothetical protein  67.47 
 
 		 459 aa  615  1e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004067  putative surfactin synthetase  38.53 
 
 		 466 aa  290  3e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4381  AMP-dependent synthetase and ligase  38.55 
 
 		 557 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.432872  normal  0.130495 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4765  AMP-dependent synthetase and ligase  36.71 
 
 		 557 aa  266  7e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.652066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3688  AMP-dependent synthetase and ligase  36.71 
 
 		 557 aa  266  7e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.458035 
 
 
-
 
NC_003296  RS00787  hypothetical protein  36.62 
 
 		 563 aa  265  8.999999999999999e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2100  hypothetical protein  38.44 
 
 		 457 aa  265  1e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5096  AMP-binding enzyme family protein  42.31 
 
 		 524 aa  263  4e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3060  AMP-dependent synthetase and ligase  38.93 
 
 		 568 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36768  normal  0.993674 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0694  AMP-dependent synthetase and ligase  37.7 
 
 		 562 aa  262  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0938067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1491  AMP-dependent synthetase and ligase  40 
 
 		 551 aa  255  1.0000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.969337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0436  AMP-dependent synthetase and ligase  40.67 
 
 		 559 aa  251  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0931  putative AMP-dependent synthetase and ligase  36 
 
 		 615 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0434  AMP-dependent synthetase and ligase  40.41 
 
 		 563 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4077  AMP-dependent synthetase and ligase  38.48 
 
 		 563 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0893  putative AMP-binding protein  36.77 
 
 		 457 aa  239  8e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.639204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3602  AMP-dependent synthetase and ligase  38.48 
 
 		 563 aa  239  8e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3920  AMP-dependent synthetase and ligase  38.97 
 
 		 561 aa  231  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4572  AMP-dependent synthetase and ligase  33.04 
 
 		 451 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3878  AMP-dependent synthetase and ligase  31.82 
 
 		 565 aa  209  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.680679 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3889  AMP-dependent synthetase and ligase  33.19 
 
 		 453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.329532 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2751  AMP-binding enzyme family protein  35.51 
 
 		 591 aa  193  6e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.859274  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0115  acyl-coenzyme A synthetase-related protein  34.5 
 
 		 427 aa  167  5e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0437  AMP-binding enzyme  30.23 
 
 		 448 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.219492  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0971  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  28.05 
 
 		 518 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00727606  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0350  peptide synthase  26.94 
 
 		 450 aa  104  3e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.693872  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2176  trigger factor (TF)  29.23 
 
 		 518 aa  104  3e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.437953  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0315  putative AMP-dependent synthetase and ligase family protein  27.07 
 
 		 435 aa  101  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.529021  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3932  AMP-dependent synthetase and ligase  28.07 
 
 		 570 aa  101  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.297166  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0480  AMP-dependent synthetase and ligase  28.43 
 
 		 446 aa  99.8  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.872653 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0320  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  29.44 
 
 		 565 aa  96.3  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2813  Acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like protein  28.07 
 
 		 609 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3987  hypothetical protein  26.83 
 
 		 448 aa  92  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0308  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  29.8 
 
 		 565 aa  91.3  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2671  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  30.47 
 
 		 569 aa  91.3  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1318  putative CoA ligase (AMP forming)  29.2 
 
 		 466 aa  88.6  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2147  acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like  27.16 
 
 		 590 aa  87.8  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2761  acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like protein  27.16 
 
 		 590 aa  87.8  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.054979  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0432  hypothetical protein  30.09 
 
 		 580 aa  87.4  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744258  normal  0.621474 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2746  CoA ligase (AMP forming)  31.43 
 
 		 443 aa  87  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.913246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6091  Acyl-coenzyme A synthetase/AMP-(fatty) acid ligase-like  28.02 
 
 		 584 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.316945  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2680  acyl-coenzyme A synthetase/AMP-(fatty) acid ligase-like protein  27.83 
 
 		 609 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2105  aconitate hydratase  30.17 
 
 		 393 aa  84.3  0.000000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0802  AMP-binding protein  27.8 
 
 		 453 aa  81.6  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03741  AMP-ligase  26.7 
 
 		 501 aa  79  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4173  AMP-dependent synthetase and ligase  26.5 
 
 		 458 aa  77  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0065  AMP-dependent synthetase and ligase  26.24 
 
 		 593 aa  74.7  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4723  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  27.03 
 
 		 370 aa  73.2  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  25.63 
 
 		 650 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2704  AMP-dependent synthetase and ligase  24.32 
 
 		 466 aa  68.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2687  putative long-chain-fatty-acid CoA ligase  23.76 
 
 		 503 aa  67  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.714201 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2940  acyl-CoA synthetase  24.83 
 
 		 469 aa  65.9  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000118125  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1273  AMP-dependent synthetase and ligase  24.65 
 
 		 472 aa  64.3  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2789  AMP-dependent synthetase and ligase  28.17 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4775  AMP-dependent synthetase and ligase  23.08 
 
 		 468 aa  62.4  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  24.51 
 
 		 650 aa  60.5  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2648  acyl-CoA synthetases (AMP-forming)/AMP-acid ligases II  24.37 
 
 		 403 aa  60.1  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4602  AMP-dependent synthetase and ligase  25.27 
 
 		 506 aa  59.7  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.666881  normal  0.617182 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0103  4-coumarate--CoA ligase  28.02 
 
 		 367 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1819  4-coumarate--CoA ligase  24.53 
 
 		 394 aa  58.2  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.0064272  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21680  acyl-CoA synthetase  24.11 
 
 		 480 aa  57.8  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.656623 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  24.8 
 
 		 667 aa  57.4  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1847  amino acid adenylation  23.97 
 
 		 1070 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3146  acyl-CoA synthetase  24.59 
 
 		 469 aa  57.8  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.22204  normal  0.0747213 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5886  acetyl-CoA synthetase  22.65 
 
 		 660 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2191  acetyl-CoA synthetase  22.65 
 
 		 660 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6754  AMP-dependent synthetase and ligase  21.69 
 
 		 517 aa  57  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3454  amino acid adenylation domain protein  25.21 
 
 		 1339 aa  56.6  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0624608  decreased coverage  0.0000000205264 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1000  acetate--CoA ligase  23.61 
 
 		 653 aa  56.6  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0778524  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2216  acetyl-CoA synthetase  22.65 
 
 		 660 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  23.85 
 
 		 666 aa  56.6  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3238  acetyl-CoA synthetase  22.65 
 
 		 664 aa  56.6  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5151  acetyl-CoA synthetase  22.65 
 
 		 664 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5130  acetyl-CoA synthetase  22.65 
 
 		 664 aa  56.6  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  23.78 
 
 		 657 aa  55.8  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1677  amino acid adenylation domain-containing protein  24.86 
 
 		 1058 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0679  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  24.05 
 
 		 1131 aa  55.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3671  4-coumarate--CoA ligase  23.47 
 
 		 411 aa  54.3  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.180666  normal  0.0402717 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  21.73 
 
 		 649 aa  54.3  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0782  acetate--CoA ligase  22.68 
 
 		 649 aa  53.9  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.429538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  24.16 
 
 		 657 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  23.53 
 
 		 664 aa  54.3  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2685  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like protein  24.44 
 
 		 328 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4498  amino acid adenylation domain protein  23.34 
 
 		 1892 aa  53.9  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.693218  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1578  AMP-dependent synthetase and ligase  26.38 
 
 		 528 aa  53.9  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.24195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2017  acetyl-CoA synthetase  21.77 
 
 		 660 aa  53.5  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0682887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>