229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2108 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1802  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  46.24 
 
 		 781 aa  695    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0548904  normal  0.220264 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2108  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  100 
 
 		 782 aa  1576    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424267 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2362  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  46.56 
 
 		 797 aa  706    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.768373  normal  0.836165 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1793  putative fimbriae-related protein  47.77 
 
 		 810 aa  696    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1962  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  46.17 
 
 		 765 aa  705    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120798 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3669  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  49.43 
 
 		 808 aa  711    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.218123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2677  fimbrial usher protein  48.03 
 
 		 766 aa  705    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1774  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  55.17 
 
 		 815 aa  880    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.613765  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61540  hypothetical protein  48.84 
 
 		 790 aa  712    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.675454  normal  0.215257 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1399  fimbrial usher protein  47.64 
 
 		 782 aa  695    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2671  fimbrial usher protein  54.92 
 
 		 815 aa  877    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0183033 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0477  fimbrial usher family protein  47.64 
 
 		 803 aa  695    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.468363  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1614  fimbrial usher protein  47.77 
 
 		 803 aa  693    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1636  fimbrial usher protein  47.77 
 
 		 803 aa  696    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3333  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  46.81 
 
 		 797 aa  709    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5301  hypothetical protein  48.71 
 
 		 790 aa  713    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1663  fimbrial usher protein  55.04 
 
 		 815 aa  879    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2819  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  42.26 
 
 		 788 aa  607  9.999999999999999e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1446  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  42.31 
 
 		 789 aa  608  9.999999999999999e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2459  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  40.91 
 
 		 794 aa  582  1.0000000000000001e-165  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4602  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  39.92 
 
 		 786 aa  503  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.930496 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001218  CsuD  34.92 
 
 		 804 aa  472  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03043  signal peptide protein  33.42 
 
 		 786 aa  386  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.117793  normal  0.374685 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2341  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.34 
 
 		 816 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194794 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2475  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.71 
 
 		 748 aa  362  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5759  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.71 
 
 		 785 aa  358  2.9999999999999997e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.337468 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1268  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.74 
 
 		 849 aa  348  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0271633  normal  0.105864 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4395  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.67 
 
 		 794 aa  348  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.621063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0865  fimbrial usher protein  31.31 
 
 		 842 aa  347  6e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0142606  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1831  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.19 
 
 		 834 aa  343  9e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0008  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.03 
 
 		 807 aa  331  3e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.333359  hitchhiker  0.00375796 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0007  outer membrane usher protein, putative  32.03 
 
 		 814 aa  330  6e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1220  fimbrial usher protein  31.53 
 
 		 803 aa  325  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.348737  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1062  P pilus assembly protein, porin PapC  31.53 
 
 		 766 aa  323  5e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.819207  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1069  fimbrial usher protein  31.53 
 
 		 766 aa  323  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1921  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.98 
 
 		 775 aa  322  9.999999999999999e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01136  outer membrane usher protein FasD  33.8 
 
 		 783 aa  323  9.999999999999999e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0354539  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1607  fimbrial usher protein  31.15 
 
 		 766 aa  320  7.999999999999999e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2992  fimbrial usher protein  31.15 
 
 		 984 aa  320  9e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0719  fimbrial usher protein  31.03 
 
 		 766 aa  318  3e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.308044  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2294  fimbrial usher protein  31.03 
 
 		 766 aa  318  3e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1270  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.16 
 
 		 790 aa  271  5e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.465422 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2693  putative outer membrane usher transmembrane protein  29.19 
 
 		 754 aa  252  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.513198 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0778  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.19 
 
 		 778 aa  226  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.243314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0144  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.49 
 
 		 791 aa  220  8.999999999999998e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0610  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.56 
 
 		 798 aa  206  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000874993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0342  putative outer membrane usher protein fimD  26.16 
 
 		 765 aa  179  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0304  fimbrial biogenesis protein  29.14 
 
 		 788 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2057  fimbrial biogenesis protein  26.96 
 
 		 834 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000165922  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3665  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.25 
 
 		 778 aa  107  7e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3740  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.38 
 
 		 778 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540058  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3599  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.33 
 
 		 778 aa  103  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1053  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.24 
 
 		 837 aa  99.4  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4024  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.67 
 
 		 866 aa  98.2  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.469528 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0535  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.65 
 
 		 734 aa  96.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0574  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.19 
 
 		 852 aa  89  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2399  fimbrial usher protein  23.85 
 
 		 826 aa  82  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0063  outer membrane usher protein precursor  23.9 
 
 		 901 aa  80.1  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0335545  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1788  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.19 
 
 		 870 aa  80.5  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0202884  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1677  fimbrial usher protein  24.19 
 
 		 870 aa  80.1  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0052  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.48 
 
 		 901 aa  79.7  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0117  outer membrane usher protein  24.46 
 
 		 939 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3092  fimbrial usher protein  24.62 
 
 		 826 aa  78.2  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.595563 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0934  fimbrial usher protein  25.12 
 
 		 826 aa  78.2  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1534  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.9 
 
 		 880 aa  77.8  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.155889  normal  0.781332 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0563  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.5 
 
 		 861 aa  77.8  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375359 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2874  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.23 
 
 		 840 aa  77.8  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37030  usher  24.55 
 
 		 872 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2281  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.89 
 
 		 876 aa  76.6  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0764  hypothetical protein  27.1 
 
 		 840 aa  76.3  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1365  fimbrial usher protein  26.45 
 
 		 833 aa  75.5  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.347917  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0300  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.52 
 
 		 850 aa  75.1  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1477  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.61 
 
 		 890 aa  74.7  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.432789  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2450  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.7 
 
 		 851 aa  74.7  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2970  putative fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.37 
 
 		 880 aa  74.3  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1600  outer membrane usher protein  23.91 
 
 		 913 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.68483  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0128  fimbrial usher protein  23.91 
 
 		 914 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0152  fimbrial usher protein  23.75 
 
 		 914 aa  71.6  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4155  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.45 
 
 		 836 aa  71.2  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3032  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.57 
 
 		 930 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0338  outer-membrane fimbrial usher protein  24.32 
 
 		 836 aa  70.5  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0185038 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00482  predicted outer membrane export usher protein  23.34 
 
 		 869 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00487  hypothetical protein  23.34 
 
 		 869 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1521  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.22 
 
 		 871 aa  70.1  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.911092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0577  outer membrane usher protein SfmD  23.34 
 
 		 869 aa  69.7  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.5582  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3081  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.17 
 
 		 867 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0633  outer membrane usher protein SfmD  23.34 
 
 		 869 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.770244  normal  0.392496 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2118  fimbrial usher family protein  23.35 
 
 		 740 aa  69.3  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.167309 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5935  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.84 
 
 		 1040 aa  68.6  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0331  outer-membrane fimbrial usher protein  24.32 
 
 		 836 aa  67.8  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3391  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.76 
 
 		 859 aa  67.8  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2388  fimbrial usher protein  23.29 
 
 		 828 aa  67  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0607  outer membrane usher protein fimD  23.47 
 
 		 869 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0594926  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1666  fimbrial usher family protein  22.96 
 
 		 871 aa  66.2  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504139 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4917  outer membrane usher protein SfmD  22.42 
 
 		 809 aa  66.6  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.432694  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5003  outer membrane usher protein SfmD  22.42 
 
 		 809 aa  66.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4844  outer membrane usher protein SfmD  22.26 
 
 		 809 aa  66.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0207  outer membrane usher protein FimD  22.09 
 
 		 848 aa  66.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1455  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23 
 
 		 841 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886847 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3090  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.19 
 
 		 869 aa  66.2  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.832581  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>