257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3845 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 174 aa  354  2.9999999999999997e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3472  transcriptional regulator, PadR-like family  77.01 
 
 		 174 aa  284  5e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6781  transcriptional regulator, PadR-like family  76.3 
 
 		 174 aa  276  8e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2234  PadR-like family transcriptional regulator  75.29 
 
 		 174 aa  275  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156481  decreased coverage  0.00573263 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0301  transcriptional regulator, PadR-like family  74.14 
 
 		 176 aa  271  3e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  72.41 
 
 		 174 aa  263  8.999999999999999e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  70.41 
 
 		 179 aa  249  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0811  PadR family transcriptional regulator  56.55 
 
 		 170 aa  193  8.000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7926  transcriptional regulator, PadR-like family  56.9 
 
 		 178 aa  188  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4387  transcriptional regulator  55.23 
 
 		 175 aa  187  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0527  PadR family transcriptional regulator  50.57 
 
 		 175 aa  178  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1343  transcriptional regulator PadR family protein  53.85 
 
 		 186 aa  172  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0379  transcriptional regulator, PadR-like family  49.11 
 
 		 177 aa  157  9e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4159  transcriptional regulator, PadR-like family  47.85 
 
 		 176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4637  transcriptional regulator, PadR-like family  42.42 
 
 		 183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0904166  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0680  PadR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 179 aa  114  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  40.62 
 
 		 168 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 168 aa  105  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0828  transcriptional regulator, PadR-like family  35.26 
 
 		 202 aa  105  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.845057 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1415  transcriptional regulator, PadR-like family  36.2 
 
 		 194 aa  97.4  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0975835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3551  transcriptional regulator, PadR-like family  35.71 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0701  transcriptional regulator, PadR-like family  34.29 
 
 		 242 aa  94.7  6e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8052  transcriptional regulator protein-like protein  33.54 
 
 		 175 aa  94  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4160  transcriptional regulator, PadR-like family  33.14 
 
 		 222 aa  94  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354182  normal  0.0431624 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3177  transcriptional regulator, PadR-like family  31.36 
 
 		 204 aa  91.7  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.556918  normal  0.03966 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4806  transcriptional regulator, PadR-like family  33.14 
 
 		 200 aa  90.1  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06230  predicted transcriptional regulator  28.73 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.946193  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1076  PadR-like family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 182 aa  72  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3692  transcriptional regulator, PadR-like family  31.79 
 
 		 176 aa  70.9  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.466556 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0079  PadR-like family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1923  transcriptional regulator, PadR-like family  34.88 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.870316 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0838  transcriptional regulator, PadR-like family  25.99 
 
 		 305 aa  68.9  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4576  PadR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 181 aa  67.4  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0010  PadR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 216 aa  67  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.341135  normal  0.976075 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0144  transcriptional regulator, PadR-like family  25 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0154267  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11201  hypothetical protein  29.73 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.705014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0225  transcriptional regulator, PadR-like family  31.11 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2546  PadR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2076  transcriptional regulator, PadR-like family  39.08 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.668384  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1999  transcriptional regulator, PadR-like family  38.1 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.893773  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2204  PadR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5461  PadR-like family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4870  PadR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 173 aa  57.4  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4959  PadR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 173 aa  57.4  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5238  PadR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 173 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1331  PadR-like family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 187 aa  57  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2017  Transcriptional regulator PadR-like protein  31.2 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00625751  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1318  transcriptional regulator, PadR-like family  24.86 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4689  transcriptional regulator  30.64 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284032  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  41.54 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1942  transcriptional regulator, PadR-like family  29.81 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.649518  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1345  transcriptional regulator, PadR-like family  32.95 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5568  transcriptional regulator, PadR-like family  33.06 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.630063  normal  0.41654 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5734  transcriptional regulator, PadR-like family  38.64 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00046  transcriptional regulator  31.4 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1892  PadR-like family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.481903  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5624  transcriptional regulator, PadR-like family  28.66 
 
 		 191 aa  53.9  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  32 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002309  predicted transcriptional regulator  31.4 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  42.03 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3110  transcriptional regulator, PadR-like family  24.52 
 
 		 325 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000271029  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2496  transcriptional regulator, PadR-like family  28.7 
 
 		 177 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0617263  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2223  hypothetical protein  31.4 
 
 		 179 aa  52.4  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000756416  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06690  predicted transcriptional regulator  30.34 
 
 		 191 aa  51.6  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000111873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3585  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 203 aa  51.6  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.785047  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13740  predicted transcriptional regulator  29.67 
 
 		 196 aa  51.2  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1309  PadR-like family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 189 aa  51.2  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.123604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  37.04 
 
 		 178 aa  50.8  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0095  PadR-like family regulatory protein  31.48 
 
 		 196 aa  50.8  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0862  PadR-like family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 202 aa  50.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0474  transcriptional regulator, PadR-like family  37.33 
 
 		 113 aa  50.8  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1343  PadR-like family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 202 aa  50.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1600  PadR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 185 aa  50.8  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797294  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1517  PadR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 196 aa  50.8  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.178756  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2928  transcriptional regulator, PadR-like family  39.19 
 
 		 106 aa  50.8  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.425588  hitchhiker  0.00045831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3780  transcriptional regulator, PadR family  37.8 
 
 		 108 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0742647  normal  0.491586 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3302  PadR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 190 aa  50.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0865  hypothetical protein  35.8 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1272  transcriptional regulator  31.48 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.546135  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2933  PadR-like family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 190 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.568859  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1322  PadR-like family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 183 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.704884 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0122  PadR-like family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 190 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166129  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0136  PadR-like family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 190 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26090  predicted transcriptional regulator  30.43 
 
 		 194 aa  50.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2248  PadR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 183 aa  49.7  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0137325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1786  transcriptional regulator, PadR-like family  29.81 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4818  transcriptional regulator, PadR-like family  27.34 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0529  PadR-like family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 215 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85519  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0121  PadR-like family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 190 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39320  transcriptional regulator, PadR family  40.32 
 
 		 184 aa  49.7  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.700238 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2655  hypothetical protein  25.47 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3741  transcriptional regulator, PadR-like family  27.34 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2658  hypothetical protein  31.46 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287076  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2669  hypothetical protein  31.46 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.010535 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5591  transcriptional regulator, PadR-like family  27.37 
 
 		 210 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1121  transcriptional regulator, PadR-like family  40.7 
 
 		 129 aa  49.3  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000122824  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7317  PadR-like family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 229 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0503  transcriptional regulator, PadR-like family  35.62 
 
 		 179 aa  49.3  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100232  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4083  PadR-like family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 136 aa  48.5  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3441  PadR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 204 aa  48.5  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.690369  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>