More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2341 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2341  hemin importer ATP-binding subunit  100 
 
 		 262 aa  529  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0724766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3272  hemin importer ATP-binding subunit  60.92 
 
 		 264 aa  319  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00219245 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3021  hemin importer ATP-binding subunit  62.45 
 
 		 264 aa  319  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.65849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3618  hemin importer ATP-binding subunit  56.49 
 
 		 267 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.740254  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0571  hemin importer ATP-binding subunit  56.76 
 
 		 260 aa  289  3e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.479313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2136  hemin importer ATP-binding subunit  55.38 
 
 		 270 aa  286  2.9999999999999996e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.740786  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0343  hemin importer ATP-binding subunit  55.98 
 
 		 260 aa  284  9e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1444  hemin importer ATP-binding subunit  56.65 
 
 		 263 aa  282  3.0000000000000004e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326637  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4205  hemin importer ATP-binding subunit  56.2 
 
 		 257 aa  280  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0455  hemin importer ATP-binding subunit  47.15 
 
 		 264 aa  259  3e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.341265  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4194  ABC transporter related  51.35 
 
 		 258 aa  244  9.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.089861  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2736  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (hemin)  50.19 
 
 		 262 aa  242  5e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1933  ABC transporter related  44.44 
 
 		 272 aa  209  3e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  42.19 
 
 		 255 aa  198  7e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0168  hemin importer ATP-binding subunit  45.93 
 
 		 262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  40 
 
 		 270 aa  194  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4590  ABC transporter related  41.83 
 
 		 274 aa  192  6e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.983683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2348  hemin importer ATP-binding subunit  45.96 
 
 		 261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00837343  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  40.38 
 
 		 253 aa  187  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  36.58 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0180  ABC transporter related  42.86 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425432  normal  0.0680318 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  36.96 
 
 		 266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  39.3 
 
 		 253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2409  hemin importer ATP-binding subunit  43.97 
 
 		 268 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128742  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  38.7 
 
 		 272 aa  182  7e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1967  hemin importer ATP-binding subunit  41.43 
 
 		 269 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0126  hemin importer ATP-binding subunit  42.53 
 
 		 277 aa  181  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.27999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  39.36 
 
 		 266 aa  180  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3893  hemin importer ATP-binding subunit  37.74 
 
 		 266 aa  178  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3805  hemin importer ATP-binding subunit  37.74 
 
 		 266 aa  178  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0646  hemin importer ATP-binding subunit  37.74 
 
 		 266 aa  178  7e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.370261 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0747  hemin importer ATP-binding subunit  38.67 
 
 		 255 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000209221  decreased coverage  0.000000000000929505 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  38.28 
 
 		 255 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  41.76 
 
 		 409 aa  177  2e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2322  hemin importer ATP-binding subunit  40.76 
 
 		 269 aa  176  4e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0161777  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  39.11 
 
 		 266 aa  176  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0322  hemin importer ATP-binding subunit  37.74 
 
 		 259 aa  176  5e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00006173  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0373  ABC transporter related protein  39.1 
 
 		 293 aa  176  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  38.85 
 
 		 266 aa  175  7e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3333  hemin importer ATP-binding subunit  38.28 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0180  ABC transporter related  35.14 
 
 		 258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3537  ABC transporter related  37.4 
 
 		 264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2764  hemin importer ATP-binding subunit  36.76 
 
 		 265 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0733  ABC transporter related  42.21 
 
 		 260 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  37.89 
 
 		 255 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000433574  decreased coverage  0.0000000113958 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4010  hemin importer ATP-binding subunit  36.58 
 
 		 254 aa  171  9e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.240186 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0631  ABC transporter related  40.91 
 
 		 260 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.17434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  38.31 
 
 		 264 aa  170  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0995  hemin importer ATP-binding subunit  40.23 
 
 		 255 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000453335  hitchhiker  0.0000000000000146988 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0584  ABC transporter related protein  38.68 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  38.43 
 
 		 269 aa  170  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09850  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  38.76 
 
 		 308 aa  169  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0480584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5378  hemin importer ATP-binding subunit  40 
 
 		 261 aa  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05239  hemin importer ATP-binding subunit  36.25 
 
 		 260 aa  169  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4687  hemin importer ATP-binding subunit  39.26 
 
 		 255 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.687839  hitchhiker  0.000215024 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001350  ABC-type hemin transport system ATPase component  36.25 
 
 		 260 aa  169  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000143522  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62280  hemin importer ATP-binding subunit  39.62 
 
 		 255 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000951345  normal  0.390973 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4798  hemin importer ATP-binding subunit  38.67 
 
 		 255 aa  169  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000262531  hitchhiker  0.00143182 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2397  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  38.43 
 
 		 255 aa  169  6e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0793  ABC transporter related  40.91 
 
 		 259 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1319  ABC transporter related  37.98 
 
 		 258 aa  167  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5422  hemin importer ATP-binding subunit  39.23 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0457387  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0602  ABC transporter-related protein  38.85 
 
 		 418 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.660447  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7222  ABC transporter related  37.22 
 
 		 282 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  33.85 
 
 		 268 aa  166  4e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2384  hemin importer ATP-binding subunit  39.06 
 
 		 284 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.258955  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0784  hemin importer ATP-binding subunit  39.58 
 
 		 254 aa  165  8e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0851  ABC transporter related  32.43 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.317375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0086  ABC transporter related  41.98 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.363839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0443  ABC transporter related  38.76 
 
 		 257 aa  163  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.152213 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  36.82 
 
 		 424 aa  163  3e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2462  hemin importer ATP-binding subunit  36.07 
 
 		 265 aa  163  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.902212  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1737  hemin importer ATP-binding subunit  34.52 
 
 		 259 aa  163  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2761  ABC transporter related protein  40.55 
 
 		 292 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.503989  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  37.82 
 
 		 255 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2165  hemin importer ATP-binding subunit  38.04 
 
 		 261 aa  162  6e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.203707  normal  0.489491 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0946  hemin importer ATP-binding subunit  38.13 
 
 		 288 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  35.43 
 
 		 258 aa  161  9e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3344  hemin importer ATP-binding subunit  38.13 
 
 		 290 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  37.2 
 
 		 260 aa  160  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1564  ABC transporter related protein  36.21 
 
 		 259 aa  161  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575357  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06500  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  39.52 
 
 		 283 aa  161  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2066  ABC transporter related  35.98 
 
 		 258 aa  161  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3308  ABC transporter related  39.38 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.069398  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2708  ABC transporter related  39.66 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2062  ABC transporter-related protein  37.36 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277516  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2816  ABC transporter related protein  39 
 
 		 263 aa  160  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4828  ABC transporter related  40 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.169592  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5100  ABC transporter related  34.5 
 
 		 253 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130853  normal  0.02881 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1048  hemin importer ATP-binding subunit  37.74 
 
 		 288 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  38.46 
 
 		 490 aa  160  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3149  ABC transporter related  37.11 
 
 		 271 aa  159  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0281771  hitchhiker  0.00000000506205 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1607  ABC transporter related  37.76 
 
 		 269 aa  159  6e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000477386 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3675  hemin importer ATP-binding subunit  36.51 
 
 		 272 aa  158  7e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3736  ABC transporter-related protein  35.83 
 
 		 311 aa  158  9e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.652525 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26520  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  37.02 
 
 		 625 aa  158  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4776  hemin importer ATP-binding subunit  41.34 
 
 		 273 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.666848 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  34.48 
 
 		 418 aa  157  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  35.91 
 
 		 455 aa  157  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1301  ABC transporter-related protein  36.43 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>