49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1673 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1673  putative phage repressor  100 
 
 		 233 aa  480  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.219867  normal  0.134588 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3352  putative phage repressor  33.75 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.140887  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3831  putative phage repressor  32.89 
 
 		 246 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2209  putative phage repressor  29.96 
 
 		 250 aa  82  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.111819 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1854  putative phage repressor  30.23 
 
 		 241 aa  81.6  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0873919 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2405  putative phage repressor  36.03 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  26.18 
 
 		 235 aa  78.2  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0258  putative phage repressor  27.12 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1918  putative phage repressor  28.88 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.514362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2321  putative phage repressor  29.15 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1626  putative phage repressor  34.29 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5792  putative phage repressor  25.74 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396613  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1729  LexA repressor  28.02 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0466  peptidase S24  27.78 
 
 		 210 aa  52  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1954  Phage repressor protein  43.66 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0757  putative phage repressor  29.69 
 
 		 208 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  0.361734 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0133  putative phage repressor  29.65 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.149707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1682  hypothetical protein  28.42 
 
 		 216 aa  50.1  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  24.71 
 
 		 216 aa  49.7  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2809  LexA repressor  27.78 
 
 		 234 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.33074  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1193  putative phage repressor  28.57 
 
 		 230 aa  48.5  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0826973  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1469  putative phage repressor  39.19 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2839  LexA repressor  27.78 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0557  putative phage repressor  27.88 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0989  S24 family peptidase  24.42 
 
 		 239 aa  46.6  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000125637 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1841  LexA repressor  27.16 
 
 		 233 aa  46.2  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.924658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  21.8 
 
 		 243 aa  45.4  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1750  putative prophage repressor  28.37 
 
 		 230 aa  45.4  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.141014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0583  bacteriophage repressor protein  33.33 
 
 		 224 aa  45.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  34.25 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  34.25 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1678  LexA repressor  26.7 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.29341 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0734  putative phage repressor  36 
 
 		 223 aa  43.9  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3256  peptidase S24/S26 domain-containing protein  32.31 
 
 		 209 aa  43.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.515672  normal  0.0963352 
 
 
-
 
NC_004310  BR1144  LexA repressor  27.6 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1104  LexA repressor  27.6 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2142  LexA repressor  31.16 
 
 		 232 aa  43.5  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0435  putative phage repressor  34.04 
 
 		 214 aa  43.1  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1339  putative prophage repressor  28 
 
 		 219 aa  43.1  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520189 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1911  putative phage repressor  25.88 
 
 		 331 aa  42.4  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0192387  normal  0.0833716 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4683  LexA repressor  31.9 
 
 		 240 aa  42.4  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5148  LexA repressor  31.9 
 
 		 240 aa  42.4  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160291  normal  0.0920185 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4241  hypothetical protein  38.16 
 
 		 351 aa  42.4  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  26.22 
 
 		 225 aa  42.4  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4030  putative phage repressor  34.12 
 
 		 217 aa  42  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2561  LexA repressor  30.77 
 
 		 239 aa  42  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.936148  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0863  putative phage repressor  30.47 
 
 		 210 aa  42  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  32.88 
 
 		 233 aa  41.6  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1808  transcriptional repressor, LexA family  30.66 
 
 		 236 aa  41.6  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.2542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>