120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0157 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0157  methyltransferase type 12  100 
 
 		 338 aa  679    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0701135  normal  0.868895 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0197  Methyltransferase type 12  64.74 
 
 		 310 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0226  Methyltransferase type 12  63.58 
 
 		 311 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0591  methyltransferase  54.35 
 
 		 326 aa  317  3e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0030  methyltransferase type 12  50 
 
 		 324 aa  258  9e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0800  hypothetical protein  37.58 
 
 		 308 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215996  normal  0.0187888 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3430  Methyltransferase type 12  39.63 
 
 		 329 aa  181  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1075  methyltransferase type 12  38.94 
 
 		 303 aa  175  8e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0749  tetratricopeptide TPR_2  36.84 
 
 		 308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.385476 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0872  Methyltransferase type 11  37.85 
 
 		 311 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0115679  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1472  methyltransferase type 12  38.36 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3693  methyltransferase type 11  38.94 
 
 		 315 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3235  methyltransferase type 12  38.32 
 
 		 331 aa  158  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.341201 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3559  Methyltransferase type 12  38.32 
 
 		 331 aa  155  8e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3256  normal  0.483567 
 
 
-
 
NC_004310  BR1063  hypothetical protein  36.19 
 
 		 276 aa  149  9e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.051758  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1028  hypothetical protein  36.19 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2147  methyltransferase type 12  36.58 
 
 		 276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  33.45 
 
 		 561 aa  145  9e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  33.45 
 
 		 561 aa  145  9e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0630  methyltransferase type 12  41.4 
 
 		 330 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0132659 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1539  Methyltransferase type 12  38.12 
 
 		 312 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  34.38 
 
 		 456 aa  133  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1594  methyltransferase type 12  37.45 
 
 		 274 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.501419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2106  methyltransferase type 12  35.96 
 
 		 436 aa  124  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0489  methyltransferase type 12  35.12 
 
 		 447 aa  122  8e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2825  Methyltransferase type 12  33 
 
 		 436 aa  120  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2059  hypothetical protein  36.51 
 
 		 241 aa  119  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  29.28 
 
 		 577 aa  118  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2061  Methyltransferase type 12  36.33 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.878422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2294  Methyltransferase type 12  35.51 
 
 		 272 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3396  methyltransferase type 12  36.04 
 
 		 439 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  29.86 
 
 		 577 aa  114  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3443  methyltransferase type 12  36.53 
 
 		 436 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605302 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0529  Methyltransferase type 11  32.24 
 
 		 444 aa  112  9e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5381  methyltransferase type 11  31.91 
 
 		 438 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554977 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43435  predicted protein  33.46 
 
 		 456 aa  96.7  5e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1472  methyltransferase type 12  27.57 
 
 		 417 aa  89.4  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.773067  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2263  Methyltransferase type 11  32.64 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0024  TPR repeat-containing protein  22.79 
 
 		 356 aa  60.5  0.00000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0048  TPR domain-containing protein  22.32 
 
 		 356 aa  55.5  0.000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.24301  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  30.66 
 
 		 284 aa  53.1  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0198  TPR domain-containing protein  20.3 
 
 		 358 aa  52.4  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.890473  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02845  hypothetical protein  25.56 
 
 		 219 aa  51.6  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  29.93 
 
 		 284 aa  50.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1601  hypothetical protein  31.33 
 
 		 209 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1392  methyltransferase type 11  34.42 
 
 		 204 aa  50.8  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0256  methyltransferase type 11  31.33 
 
 		 209 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 244 aa  50.8  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  35.14 
 
 		 290 aa  50.8  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2499  methyltransferase type 12  30.87 
 
 		 203 aa  50.4  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003041  hypothetical protein  25.37 
 
 		 210 aa  50.4  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3533  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 250 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20390  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  30.97 
 
 		 245 aa  49.7  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  30.16 
 
 		 274 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0891  biotin biosynthesis protein BioC  29.91 
 
 		 251 aa  49.3  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3351  methyltransferase type 11  33.03 
 
 		 257 aa  48.9  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0284  methyltransferase type 11  40.45 
 
 		 209 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03996  conserved hypothetical protein  33.68 
 
 		 221 aa  48.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0273649  normal  0.194457 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0497  biotin synthesis protein BioC  26.92 
 
 		 269 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4275  methyltransferase type 11  29.37 
 
 		 251 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  30.94 
 
 		 274 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06010  biotin synthesis protein BioC  29.52 
 
 		 267 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746653  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  28.88 
 
 		 236 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  29.58 
 
 		 215 aa  47.8  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  29.13 
 
 		 253 aa  47.8  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  24.66 
 
 		 309 aa  47  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  34.82 
 
 		 244 aa  47.4  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  28.16 
 
 		 253 aa  47  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  28.89 
 
 		 275 aa  46.6  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2067  biotin biosynthesis protein BioC  31.54 
 
 		 263 aa  46.6  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  29.19 
 
 		 265 aa  46.6  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  31.53 
 
 		 249 aa  46.6  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0832  biotin biosynthesis protein BioC  29.06 
 
 		 251 aa  46.2  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189171  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0923  biotin biosynthesis protein BioC  29.06 
 
 		 251 aa  46.2  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00600636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  27.03 
 
 		 251 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0221  Methyltransferase type 11  30.19 
 
 		 208 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.664721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0543  hypothetical protein  29.41 
 
 		 354 aa  45.8  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.395054  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  31.33 
 
 		 252 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  26.35 
 
 		 263 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  28.5 
 
 		 267 aa  45.8  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  26.13 
 
 		 251 aa  45.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  26.13 
 
 		 251 aa  45.4  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  35 
 
 		 271 aa  45.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0946  biotin biosynthesis protein BioC  28.44 
 
 		 251 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000915647  normal  0.885447 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07904  conserved hypothetical protein  30 
 
 		 325 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.414403  normal  0.323526 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  28.7 
 
 		 232 aa  44.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  35.19 
 
 		 260 aa  45.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  26.13 
 
 		 251 aa  45.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1932  methyltransferase type 12  27.27 
 
 		 237 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0715212  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0860  biotin biosynthesis protein BioC  28.21 
 
 		 251 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00894914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  28.15 
 
 		 239 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 1312 aa  44.3  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4266  methyltransferase type 11  30.69 
 
 		 256 aa  44.3  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.985163  normal  0.26538 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0910  methyltransferase type 11  25.97 
 
 		 226 aa  44.3  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0744  TPR repeat-containing protein  40.82 
 
 		 164 aa  44.3  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1647  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.09 
 
 		 436 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0262651  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3235  hypothetical protein  24.54 
 
 		 237 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  33.94 
 
 		 291 aa  44.3  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4142  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 		 1287 aa  43.9  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000068759 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0127  methyltransferase type 11  33.94 
 
 		 245 aa  43.5  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>