More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2840 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2840  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 415 aa  810    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4757  major facilitator superfamily MFS_1  73.28 
 
 		 413 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0254907 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3237  major facilitator superfamily MFS_1  56.73 
 
 		 418 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1640  major facilitator transporter  57.6 
 
 		 412 aa  462  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000762127  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0514  major facilitator transporter  59.66 
 
 		 412 aa  455  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.21353  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0429  major facilitator superfamily MFS_1  60.88 
 
 		 413 aa  451  1.0000000000000001e-126  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2478  major facilitator superfamily MFS_1  57.97 
 
 		 415 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.496418  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0627  major facilitator superfamily MFS_1  59.21 
 
 		 417 aa  435  1e-121  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000123626  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2161  major facilitator superfamily MFS_1  55.58 
 
 		 407 aa  436  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  0.722113 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0150  hypothetical protein  58.44 
 
 		 413 aa  435  1e-121  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00771241  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1741  major facilitator superfamily MFS_1  58.21 
 
 		 415 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2949  major facilitator superfamily MFS_1  52.08 
 
 		 413 aa  394  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4615  major facilitator superfamily MFS_1  51.57 
 
 		 413 aa  388  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1654  major facilitator superfamily MFS_1  54.46 
 
 		 412 aa  389  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3636  major facilitator superfamily MFS_1  54.55 
 
 		 411 aa  385  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.138317  normal  0.90769 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4712  major facilitator superfamily MFS_1  52.81 
 
 		 420 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3632  major facilitator superfamily MFS_1  52.37 
 
 		 422 aa  388  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.361546 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3633  major facilitator superfamily MFS_1  50.98 
 
 		 415 aa  382  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0221  major facilitator transporter  52.98 
 
 		 419 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.255633 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0219  major facilitator superfamily MFS_1  54.37 
 
 		 415 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2725  major facilitator superfamily permease  49.3 
 
 		 425 aa  370  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.649014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0230  major facilitator superfamily MFS_1  54.13 
 
 		 415 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0206  major facilitator superfamily transporter  54.13 
 
 		 415 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  29.25 
 
 		 425 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  28.38 
 
 		 425 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 429 aa  95.1  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 433 aa  93.6  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  27.4 
 
 		 432 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 432 aa  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  27.27 
 
 		 433 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  27.12 
 
 		 398 aa  92  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  27.12 
 
 		 432 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  28.22 
 
 		 432 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 432 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  26.21 
 
 		 398 aa  90.9  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 399 aa  90.9  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  28.22 
 
 		 433 aa  90.9  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  28.22 
 
 		 433 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  27.05 
 
 		 399 aa  89  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  27.05 
 
 		 399 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  27.65 
 
 		 418 aa  89.7  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  27.05 
 
 		 399 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  27.35 
 
 		 399 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  27.35 
 
 		 399 aa  87.4  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  27.35 
 
 		 399 aa  87.4  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  27.35 
 
 		 399 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  27.35 
 
 		 399 aa  87.4  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0452  major facilitator transporter  29.18 
 
 		 467 aa  87.4  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 425 aa  87.4  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  27.35 
 
 		 399 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  31.77 
 
 		 446 aa  87  6e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2477  major facilitator superfamily MFS_1  28.86 
 
 		 416 aa  86.3  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655762  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0319  major facilitator superfamily MFS_1  31.82 
 
 		 474 aa  86.3  9e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.230741  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1543  major facilitator transporter  27.22 
 
 		 382 aa  85.9  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0259552 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  28.01 
 
 		 423 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2187  major facilitator superfamily MFS_1  27.52 
 
 		 416 aa  86.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0329536  normal  0.242906 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2559  major facilitator transporter  26.78 
 
 		 407 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7074  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 436 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.884668 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1076  major facilitator transporter  28.4 
 
 		 382 aa  85.1  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.197988  normal  0.0589295 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  26.21 
 
 		 399 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 409 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4100  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  25.5 
 
 		 427 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.41549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  27.71 
 
 		 411 aa  82.8  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  32.66 
 
 		 477 aa  82.8  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2632  major facilitator transporter  27.76 
 
 		 402 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3660  putative sialic acid transporter  28.64 
 
 		 495 aa  82.4  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.723795  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3636  putative sialic acid transporter  28.18 
 
 		 496 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3601  putative sialic acid transporter  28.18 
 
 		 496 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3698  putative sialic acid transporter  28.18 
 
 		 496 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3531  putative sialic acid transporter  28.18 
 
 		 496 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6215  major facilitator superfamily MFS_1  25.5 
 
 		 427 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  27.22 
 
 		 381 aa  80.9  0.00000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  28.26 
 
 		 409 aa  80.1  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3529  putative sialic acid transporter  28.18 
 
 		 496 aa  80.1  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  26.99 
 
 		 447 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 404 aa  79.7  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1197  putative sialic acid transporter  28.52 
 
 		 426 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  35.33 
 
 		 438 aa  79  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 409 aa  79.3  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  30.09 
 
 		 462 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  32.83 
 
 		 526 aa  78.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1242  putative sialic acid transporter  28.52 
 
 		 426 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.364649 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1227  putative sialic acid transporter  28.52 
 
 		 426 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  24.94 
 
 		 429 aa  77.8  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 428 aa  77.4  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04490  sugar phosphate permease  29.32 
 
 		 469 aa  77.4  0.0000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2876  alpha-ketoglutarate permease  24.44 
 
 		 440 aa  77  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201678  normal  0.0424251 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1972  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 372 aa  77  0.0000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.106436  hitchhiker  0.000000141049 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 415 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4276  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 492 aa  76.6  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  27.06 
 
 		 430 aa  76.3  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4643  major facilitator superfamily MFS_1  29.53 
 
 		 492 aa  76.3  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2711  major facilitator transporter  28.28 
 
 		 480 aa  75.9  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0257064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  34.69 
 
 		 438 aa  76.3  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2770  putative sialic acid transporter  27.27 
 
 		 510 aa  75.5  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00045382 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  31.34 
 
 		 485 aa  76.3  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1298  putative sialic acid transporter  27.27 
 
 		 510 aa  75.5  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4541  putative sialic acid transporter  27.27 
 
 		 496 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.315393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0482  putative sialic acid transporter  27.27 
 
 		 496 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.624928 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2998  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  26.46 
 
 		 442 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793355  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>