145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_24030 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_24030  DNA/RNA helicase, superfamily I  100 
 
 		 710 aa  1404    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3297  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  41.04 
 
 		 659 aa  353  7e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925836 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8908  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  39.29 
 
 		 672 aa  342  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2547  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.16 
 
 		 861 aa  330  6e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0101417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4092  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  38.26 
 
 		 670 aa  323  5e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.445905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4482  hypothetical protein  37.24 
 
 		 680 aa  321  3.9999999999999996e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1224  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.56 
 
 		 645 aa  320  6e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2694  hypothetical protein  38.68 
 
 		 679 aa  320  7e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2397  putative ATP/GTP binding protein  38.44 
 
 		 727 aa  319  1e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115029  normal  0.0547233 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4146  putative ATP-dependent DNA helicase  37.98 
 
 		 717 aa  318  2e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2447  putative ATP-dependent DNA helicase  36.95 
 
 		 792 aa  318  2e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.250058  normal  0.190451 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8108  ATP-dependent DNA helicase  35.3 
 
 		 719 aa  318  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4077  hypothetical protein  37.85 
 
 		 695 aa  317  3e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0451671 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4871  hypothetical protein  38.9 
 
 		 666 aa  317  4e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0489  hypothetical protein  39.62 
 
 		 692 aa  313  7.999999999999999e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0388236 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21750  DNA/RNA helicase, superfamily I  36.5 
 
 		 695 aa  310  5e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2679  Superfamily I DNA and RNA helicase  33.89 
 
 		 1048 aa  284  5.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.357877  normal  0.0252741 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0164  ATP-dependent DNA helicase  37.76 
 
 		 684 aa  282  2e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.532739 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10650  DNA/RNA helicase, superfamily I  33.62 
 
 		 747 aa  256  1.0000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.85506  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1829  ATP-dependent DNA helicase  32.57 
 
 		 706 aa  245  1.9999999999999999e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1059  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.49 
 
 		 732 aa  241  4e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.394879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3607  ATP-dependent DNA helicase  32.18 
 
 		 759 aa  238  3e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1900  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.11 
 
 		 724 aa  233  7.000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4508  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  31.95 
 
 		 693 aa  216  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3388  hypothetical protein  32.06 
 
 		 706 aa  211  5e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.667328 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09430  DNA/RNA helicase, superfamily I  33.12 
 
 		 705 aa  204  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.260549 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5784  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  30.93 
 
 		 691 aa  203  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3630  hypothetical protein  31.85 
 
 		 705 aa  195  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000100418 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14320  DNA/RNA helicase, superfamily I  29.27 
 
 		 758 aa  194  5e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00598075  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0576  DNA or RNA helicase, Superfamily I family protein  27.99 
 
 		 758 aa  190  9e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0841204 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4531  putative helicase protein  29.91 
 
 		 726 aa  189  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5266  putative helicase  29.65 
 
 		 724 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5355  putative helicase  29.65 
 
 		 724 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2615  UvrD/Rep helicase family protein  28.77 
 
 		 691 aa  189  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000204354  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5645  putative helicase  29.65 
 
 		 724 aa  188  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5052  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.16 
 
 		 733 aa  187  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.540758  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4104  AAA ATPase  29.76 
 
 		 799 aa  187  8e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133628  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16000  DNA/RNA helicase, superfamily I  37.71 
 
 		 813 aa  184  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5818  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.39 
 
 		 766 aa  181  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.814611 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0875  hypothetical protein  29.95 
 
 		 712 aa  178  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2469  UvrD/Rep helicase family protein  27.52 
 
 		 691 aa  177  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00119782  normal  0.334322 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2823  UvrD/Rep helicase family protein  27.23 
 
 		 691 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2821  uvrD/Rep helicase family protein  27.4 
 
 		 689 aa  174  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000164243 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1826  superfamily I DNA and RNA helicase  30.01 
 
 		 716 aa  173  9e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200376  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3352  superfamily I DNA and RNA helicase  29.2 
 
 		 715 aa  173  9e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2623  uvrD/Rep helicase family protein  27.86 
 
 		 689 aa  173  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000508135  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2814  uvrD/Rep helicase family protein  27.86 
 
 		 689 aa  173  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000183326  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22980  DNA/RNA helicase, superfamily I  36.18 
 
 		 741 aa  172  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51647  normal  0.435822 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2861  uvrD/Rep helicase family protein  27.1 
 
 		 689 aa  172  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000106246  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2539  UvrD/Rep helicase family protein  27.41 
 
 		 689 aa  171  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000078955  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2150  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.25 
 
 		 746 aa  171  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1438  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37 
 
 		 767 aa  171  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0481652  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5180  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  29.11 
 
 		 715 aa  171  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292486 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2839  uvrD/Rep helicase family protein  27.33 
 
 		 689 aa  169  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000185117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2572  UvrD/Rep helicase family protein  28.12 
 
 		 689 aa  169  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000433537  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2598  putative helicase  34.08 
 
 		 734 aa  163  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75582 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0895  superfamily I DNA helicase  23.1 
 
 		 755 aa  162  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.531504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1262  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.73 
 
 		 757 aa  161  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1311  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.92 
 
 		 748 aa  161  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1511  ATP-dependent DNA helicase  33.76 
 
 		 742 aa  158  4e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3817  hypothetical protein  39.22 
 
 		 765 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0171  superfamily I DNA and RNA helicase  34.77 
 
 		 759 aa  157  6e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2857  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.49 
 
 		 788 aa  156  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2428  ATP-dependent DNA helicase  34.92 
 
 		 726 aa  155  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523427  normal  0.292743 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0108  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.92 
 
 		 804 aa  155  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7576  hypothetical protein  35.06 
 
 		 795 aa  154  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5043  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.84 
 
 		 685 aa  154  7e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1552  hypothetical protein  36.04 
 
 		 754 aa  153  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457555  normal  0.0469841 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05760  DNA/RNA helicase, superfamily I  29.42 
 
 		 755 aa  152  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.594948 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0952  putative helicase  33.26 
 
 		 829 aa  151  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.249866 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1510  ATP-dependent DNA helicase  33.42 
 
 		 742 aa  150  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1872  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.93 
 
 		 763 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1592  hypothetical protein  35.79 
 
 		 776 aa  147  6e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.430325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5583  putative helicase  33.03 
 
 		 874 aa  147  6e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1575  UvrD/REP helicase  34.95 
 
 		 750 aa  146  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0191582 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4189  hypothetical protein  39.35 
 
 		 902 aa  145  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.060673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0032  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.28 
 
 		 786 aa  144  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2425  hypothetical protein  32.78 
 
 		 771 aa  143  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0765  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.42 
 
 		 832 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.360581  normal  0.192195 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1591  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.01 
 
 		 763 aa  142  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.68447  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3796  putative helicase  33.83 
 
 		 735 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0213  superfamily I DNA and RNA helicases  29.32 
 
 		 717 aa  140  8.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1110  hypothetical protein  26.34 
 
 		 702 aa  138  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924141 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1632  ATP-dependent DNA helicase rep  24 
 
 		 703 aa  132  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7542  hypothetical protein  33.98 
 
 		 761 aa  132  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.322202 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1050  hypothetical protein  24.53 
 
 		 702 aa  127  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4154  superfamily I DNA and RNA helicase  30.92 
 
 		 742 aa  127  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13570  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.42 
 
 		 764 aa  125  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.176836 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0580  putative helicase  24.14 
 
 		 706 aa  123  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.937698  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2903  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.01 
 
 		 732 aa  122  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0195315  hitchhiker  0.0000337224 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0566  helicase, putative  23.08 
 
 		 706 aa  120  6e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.712813  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1963  helicase  23.39 
 
 		 748 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0457  superfamily I DNA and RNA helicase  41.71 
 
 		 710 aa  109  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3495  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.36 
 
 		 728 aa  107  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.471615  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0083  hypothetical protein  26.5 
 
 		 785 aa  107  8e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2268  ATP-dependent DNA helicase replicase  31.4 
 
 		 753 aa  94.7  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472116  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1440  superfamily I DNA/RNA helicase  23.61 
 
 		 762 aa  94.7  6e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0962  hypothetical protein  32.28 
 
 		 703 aa  93.6  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916066  normal  0.251911 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0025  UvrD/Rep helicase family protein  26.12 
 
 		 852 aa  92.8  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0201  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  29.84 
 
 		 772 aa  91.7  4e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>