227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_09680 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  64.38 
 
 		 499 aa  637    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  68.32 
 
 		 580 aa  719    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  78.67 
 
 		 558 aa  806    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  67.35 
 
 		 535 aa  663    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  74.49 
 
 		 580 aa  746    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  100 
 
 		 584 aa  1162    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  46.54 
 
 		 551 aa  376  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  65.09 
 
 		 605 aa  276  8e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  52.96 
 
 		 530 aa  244  3.9999999999999997e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  56.19 
 
 		 628 aa  230  6e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  34.92 
 
 		 585 aa  196  8.000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  35.52 
 
 		 602 aa  181  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  33.41 
 
 		 566 aa  176  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  54.73 
 
 		 603 aa  145  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  46.07 
 
 		 508 aa  142  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  52.59 
 
 		 714 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  44.58 
 
 		 507 aa  134  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  43.67 
 
 		 556 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  48.84 
 
 		 568 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  47.29 
 
 		 620 aa  129  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  31.07 
 
 		 748 aa  128  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3609  HNH nuclease  48.76 
 
 		 222 aa  123  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  29.07 
 
 		 637 aa  114  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  41.1 
 
 		 485 aa  110  8.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  34.13 
 
 		 510 aa  99.8  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18410  hypothetical protein  44.14 
 
 		 521 aa  98.2  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.867748  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  37.67 
 
 		 469 aa  97.8  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  29.63 
 
 		 484 aa  97.4  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  39.53 
 
 		 426 aa  95.9  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  37.5 
 
 		 567 aa  94.7  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  39.72 
 
 		 443 aa  94.4  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  34.97 
 
 		 546 aa  93.2  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15770  HNH endonuclease  38.69 
 
 		 360 aa  92.8  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  38.3 
 
 		 443 aa  92  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  35.4 
 
 		 561 aa  90.9  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  42.31 
 
 		 516 aa  88.6  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29150  hypothetical protein  39.57 
 
 		 502 aa  87  9e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1982  hypothetical protein  43.86 
 
 		 310 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.840083 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3157  HNH endonuclease  41.8 
 
 		 441 aa  84.7  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000184807  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  39.53 
 
 		 512 aa  82.4  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0426  hypothetical protein  28.21 
 
 		 539 aa  82  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0327015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06130  HNH endonuclease  41.73 
 
 		 561 aa  81.3  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3610  hypothetical protein  36.3 
 
 		 228 aa  79.7  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0390  HNH endonuclease  34.73 
 
 		 405 aa  80.1  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4123  HNH nuclease  36.81 
 
 		 572 aa  79.7  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.621245 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31690  hypothetical protein  40.16 
 
 		 577 aa  79  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  39.39 
 
 		 442 aa  78.2  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3627  HNH endonuclease  37.6 
 
 		 743 aa  78.2  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0415546 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06770  hypothetical protein  35.44 
 
 		 523 aa  77.4  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.417774  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3644  HNH endonuclease  34.15 
 
 		 408 aa  77.4  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.499825  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14290  HNH endonuclease  25.17 
 
 		 481 aa  77.4  0.0000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000128465  normal  0.060373 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11880  HNH endonuclease  25.29 
 
 		 594 aa  77.8  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  31.64 
 
 		 432 aa  75.1  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3736  HNH nuclease  35.21 
 
 		 661 aa  75.1  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13091  hypothetical protein  35.16 
 
 		 424 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000169747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2721  hypothetical protein  36.5 
 
 		 553 aa  74.3  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  39.13 
 
 		 464 aa  73.6  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3082  HNH endonuclease  37.21 
 
 		 709 aa  73.6  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3819  HNH endonuclease  41.07 
 
 		 620 aa  73.2  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3345  HNH nuclease  32.9 
 
 		 469 aa  72  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2220  HNH endonuclease  52.11 
 
 		 535 aa  71.2  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.176223  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0807  HNH endonuclease  36.8 
 
 		 566 aa  70.9  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0538  HNH nuclease  30.73 
 
 		 404 aa  70.1  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.357071  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3341  HNH nuclease  33.53 
 
 		 408 aa  68.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0650205  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3052  HNH endonuclease  31.14 
 
 		 403 aa  69.3  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00448111  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  38.46 
 
 		 480 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1708  HNH endonuclease  34.31 
 
 		 519 aa  68.6  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0664589  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2756  HNH nuclease  25.9 
 
 		 550 aa  68.9  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  40.32 
 
 		 567 aa  68.9  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  42.86 
 
 		 480 aa  68.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  42.86 
 
 		 480 aa  68.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3127  HNH nuclease  31.28 
 
 		 474 aa  67.8  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0215087 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1140  HNH nuclease  29.94 
 
 		 405 aa  67.8  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0347  HNH endonuclease  33.96 
 
 		 627 aa  67.4  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1040  hypothetical protein  45.88 
 
 		 593 aa  67  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35797  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2855  hypothetical protein  45.88 
 
 		 581 aa  67  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1056  hypothetical protein  45.88 
 
 		 593 aa  67  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2899  hypothetical protein  45.88 
 
 		 581 aa  67  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3778  hypothetical protein  37.5 
 
 		 473 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499553 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4252  hypothetical protein  45.88 
 
 		 578 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4022  hypothetical protein  45.88 
 
 		 578 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4097  hypothetical protein  45.88 
 
 		 578 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.481016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2886  hypothetical protein  53.03 
 
 		 578 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.816212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0069  HNH nuclease  34.42 
 
 		 413 aa  65.1  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09750  HNH endonuclease  36.28 
 
 		 494 aa  65.1  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00000378313  normal  0.0136835 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5084  hypothetical protein  31.25 
 
 		 434 aa  64.7  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113034  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4699  hypothetical protein  30.47 
 
 		 434 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1741  HNH nuclease  37.14 
 
 		 414 aa  63.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.206853  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4785  hypothetical protein  30.47 
 
 		 434 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10397  13E12 repeat-containing protein  43.66 
 
 		 441 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0314  hypothetical protein  42.86 
 
 		 512 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3187  HNH nuclease  33.53 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3785  HNH endonuclease  36.36 
 
 		 498 aa  62.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0713491  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01520  HNH endonuclease  36.62 
 
 		 504 aa  62.4  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1199  hypothetical protein  31.17 
 
 		 505 aa  61.6  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4933  HNH nuclease  33.33 
 
 		 407 aa  61.6  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1606  hypothetical protein  32.87 
 
 		 430 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1463  HNH nuclease  37.23 
 
 		 414 aa  61.2  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1631  hypothetical protein  32.87 
 
 		 430 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  44.62 
 
 		 488 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>