273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0490 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3461  ABC-2 type transporter  99.74 
 
 
383 aa  763  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3637  hypothetical protein  99.22 
 
 
383 aa  756  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0533  ABC-2 type transporter  91.25 
 
 
379 aa  703  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0490  hypothetical protein  100 
 
 
383 aa  764  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4087  hypothetical protein  95.21 
 
 
378 aa  719  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0585  ABC-2 type transporter  92.31 
 
 
382 aa  705  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0508  ABC-2 type transporter  92.61 
 
 
381 aa  716  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3811  ABC-2 type transporter  91.34 
 
 
383 aa  712  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0529  ABC-2 type transporter  91.82 
 
 
381 aa  709  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4391  ABC-2 type transporter  82.67 
 
 
384 aa  614  1e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.567246  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3727  hypothetical protein  70.87 
 
 
381 aa  563  1e-159  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3743  ABC-2 type transporter  71.01 
 
 
384 aa  540  1e-152  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0569  ABC-2 type transporter  71.28 
 
 
382 aa  532  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.101548 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0480  hypothetical protein  70.25 
 
 
386 aa  492  1e-138  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.292724 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0414  ABC-2 type transporter  66.95 
 
 
381 aa  467  1e-130  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003315  ABC-type multidrug transport system permease component  41.78 
 
 
383 aa  306  4e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0394  ABC-2 type transporter  44.21 
 
 
397 aa  301  9e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0475  ABC-2 type transporter  44.21 
 
 
392 aa  299  5e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1214  hypothetical protein  41.47 
 
 
382 aa  296  6e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0247305  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02437  hypothetical protein  40.94 
 
 
383 aa  283  5e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1842  hypothetical protein  39.95 
 
 
395 aa  263  5e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0620  ABC-2 type transporter  36.91 
 
 
378 aa  248  9e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0596  ABC-2 type transporter  29.22 
 
 
395 aa  175  1e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4806  ABC-2 type transporter  33.52 
 
 
367 aa  169  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.271694  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2702  ABC-2 type transporter  30.95 
 
 
780 aa  168  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0091  transporter, putative  28.8 
 
 
405 aa  159  8e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.060558 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1037  hypothetical protein  30.27 
 
 
397 aa  158  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1171  hypothetical protein  32.1 
 
 
375 aa  151  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0651  ABC-2 type transporter  30.49 
 
 
496 aa  149  8e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4569  ABC-2 type transporter  28.49 
 
 
377 aa  124  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1024  hypothetical protein  27.93 
 
 
293 aa  123  7e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3062  ABC-2 type transporter  29.75 
 
 
376 aa  120  5e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20110  hypothetical protein  27.54 
 
 
377 aa  118  2e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.918672 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1730  hypothetical protein  27.54 
 
 
377 aa  115  9e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.151004  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0182  ABC-type multidrug transport system permease component  25.4 
 
 
415 aa  106  6e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0501  ABC-2 type transporter  26.79 
 
 
379 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2330  hypothetical protein  24.17 
 
 
379 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3063  ABC-2 type transporter  25.39 
 
 
397 aa  94.7  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0378038  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  25.19 
 
 
370 aa  89.7  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0479  hypothetical protein  27.71 
 
 
375 aa  88.6  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.168605 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  24.65 
 
 
376 aa  85.5  2e-15  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1927  ABC-2 type transporter  26.05 
 
 
390 aa  85.1  2e-15  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.751197  normal  0.0397267 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  27.89 
 
 
376 aa  84  4e-15  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2331  hypothetical protein  22.93 
 
 
399 aa  84  4e-15  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  24.71 
 
 
379 aa  83.6  5e-15  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1187  hypothetical protein  24.74 
 
 
407 aa  83.2  6e-15  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.152361  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0992  ABC-2 type transporter  24.47 
 
 
391 aa  82.8  9e-15  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1926  ABC-2 type transporter  24.92 
 
 
389 aa  80.1  5e-14  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0215511 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2779  ABC-2 type transporter  23.58 
 
 
405 aa  79.3  1e-13  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  23.15 
 
 
373 aa  78.2  2e-13  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  23.96 
 
 
376 aa  78.2  2e-13  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0181  ABC-type multidrug transport system permease component  24.4 
 
 
382 aa  77  5e-13  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0315878  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2684  ABC-2 type transporter  23.5 
 
 
405 aa  76.3  8e-13  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.020702  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3308  ABC-2 type transporter  26.55 
 
 
380 aa  74.7  2e-12  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4807  putative permease component of ABC transporter  24.76 
 
 
402 aa  74.3  3e-12  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459012  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3223  ABC-2 type transporter  26.55 
 
 
380 aa  73.9  4e-12  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0649112  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0112  ABC-2 type transporter  24.4 
 
 
372 aa  73.6  6e-12  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0225544  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  23.68 
 
 
384 aa  72.8  1e-11  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3744  ABC-2 type transporter  21.32 
 
 
387 aa  72.4  1e-11  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  25.07 
 
 
377 aa  72.8  1e-11  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0619  membrane protein  28.76 
 
 
378 aa  72.4  1e-11  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3273  ABC-2 type transporter  27.49 
 
 
377 aa  72.4  1e-11  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0976  ABC-2 type transporter  27.15 
 
 
377 aa  72.4  1e-11  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  22.74 
 
 
376 aa  71.6  2e-11  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0895  ABC-2 type transporter  26.35 
 
 
378 aa  71.6  2e-11  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3114  ABC transporter, inner membrane subunit  26.25 
 
 
380 aa  71.6  2e-11  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4063  ABC-2 type transporter  23.03 
 
 
375 aa  70.9  3e-11  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  26.83 
 
 
381 aa  71.2  3e-11  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  24.57 
 
 
369 aa  70.9  4e-11  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  22.74 
 
 
381 aa  70.1  5e-11  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  22.42 
 
 
388 aa  70.5  5e-11  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  23.69 
 
 
384 aa  70.5  5e-11  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  23.68 
 
 
384 aa  70.1  6e-11  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  22.73 
 
 
387 aa  70.1  6e-11  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.3 
 
 
384 aa  70.1  7e-11  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1248  ABC transporter, permease protein  22.71 
 
 
382 aa  70.1  7e-11  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0413  ABC-2 type transporter  22.27 
 
 
390 aa  70.1  7e-11  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.425702  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0597  hypothetical protein  22.69 
 
 
383 aa  69.7  8e-11  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1135  hypothetical protein  22.42 
 
 
384 aa  69.3  9e-11  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  21.95 
 
 
380 aa  68.9  1e-10  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0739  hypothetical protein  24.23 
 
 
378 aa  68.2  2e-10  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0719  hypothetical protein  23.6 
 
 
385 aa  68.2  2e-10  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.348943  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1213  hypothetical protein  25 
 
 
387 aa  68.6  2e-10  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0148967  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  24.62 
 
 
375 aa  68.9  2e-10  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0720  hypothetical protein  23.31 
 
 
378 aa  67.8  3e-10  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  22.28 
 
 
380 aa  67.8  3e-10  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1079  putative ABC transporter ATP-binding protein or permease protein  24.47 
 
 
375 aa  67.4  4e-10  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  23.67 
 
 
366 aa  67.4  4e-10  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0919  ABC-2 type transporter  23.91 
 
 
405 aa  67.4  4e-10  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  24.63 
 
 
390 aa  67  5e-10  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  23.68 
 
 
368 aa  67  5e-10  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  24.83 
 
 
378 aa  66.2  8e-10  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0568  ABC-2 type transporter  20.87 
 
 
387 aa  66.2  9e-10  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.094665 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  22.55 
 
 
367 aa  65.9  1e-09  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1082  ABC-2 type transport system permease protein  23.45 
 
 
378 aa  64.3  3e-09  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_002950  PG0092  transporter, putative  28.21 
 
 
379 aa  64.3  3e-09  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0602598 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  23.22 
 
 
382 aa  64.7  3e-09  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1025  ABC-2 type transporter  20.12 
 
 
391 aa  64.7  3e-09  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1841  hypothetical protein  26.92 
 
 
395 aa  63.9  4e-09  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1794  hypothetical protein  23.22 
 
 
390 aa  63.5  6e-09  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  1.52274e-05  normal  0.41124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>