34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4209 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4209  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  100 
 
 		 168 aa  347  5e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000149258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0097  type IV conjugative transfer system signal peptidase  26.79 
 
 		 176 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.120482 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1091  conjugation signal peptidase TraF, putative  32.84 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.832748  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0373  putative pilus assembly protein, TrhF  33.78 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.340521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4176  hypothetical protein  30.97 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0912221 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2531  conjugal transfer protein TraF  31.65 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400646  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2015  conjugal transfer protein TraF  26.67 
 
 		 173 aa  47.4  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.494735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2493  conjugal transfer protein traF  29.34 
 
 		 196 aa  47  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.955009 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6803  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  26.9 
 
 		 169 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1767  signal peptidase I  32.11 
 
 		 226 aa  46.6  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000654084  normal  0.0637155 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2658  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  27.54 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.1862 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0628  putative conjugal transfer protein TraF  26.32 
 
 		 220 aa  46.2  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3535  conjugal transfer protein precursor  29.11 
 
 		 181 aa  45.1  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1200  conjugal transfer protein precursor  29.11 
 
 		 181 aa  45.1  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6223  hypothetical protein  25.47 
 
 		 175 aa  44.7  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0454  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  26.95 
 
 		 195 aa  44.3  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0184  signal peptidase I  29.45 
 
 		 208 aa  43.9  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782476 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  27.62 
 
 		 199 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47370  putative signal peptidase  32.41 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.627585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2622  conjugal transfer protein traF  25 
 
 		 199 aa  43.9  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3727  conjugal transfer protein  31.31 
 
 		 203 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0362  conjugal transfer protein precursor  34.44 
 
 		 192 aa  43.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4088  signal peptidase I  30.56 
 
 		 187 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0684  conjugal transfer protein precursor  25.75 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  30.91 
 
 		 197 aa  42.4  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00350  signal peptidase I  29.06 
 
 		 191 aa  42.4  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0652665  hitchhiker  0.0000000236329 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2491  signal peptidase I  33.33 
 
 		 183 aa  42  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2090  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  25.45 
 
 		 177 aa  42  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  30.58 
 
 		 216 aa  41.6  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  30.7 
 
 		 222 aa  42  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0182  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  25.33 
 
 		 147 aa  40.8  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3662  signal peptidase I  30.93 
 
 		 183 aa  40.8  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000188983  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1721  putative conjugal transfer protein  23.53 
 
 		 168 aa  40.8  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000828032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0276  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  23.94 
 
 		 196 aa  40.8  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>