183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2510 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2510  cytochrome B561  100 
 
 		 248 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00451745  hitchhiker  0.00000518904 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2317  cytochrome B561  92.74 
 
 		 248 aa  476  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0816161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2387  cytochrome B561  92.74 
 
 		 248 aa  476  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.549561  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2726  cytochrome b, putative  85.89 
 
 		 248 aa  447  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1831  cytochrome B561  81.85 
 
 		 248 aa  424  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2491  cytochrome B561  81.85 
 
 		 248 aa  424  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.114996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1795  cytochrome B561  81.85 
 
 		 248 aa  424  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1787  cytochrome B561  81.85 
 
 		 248 aa  424  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2214  cytochrome B561  56.68 
 
 		 247 aa  299  3e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.312058  hitchhiker  0.00138122 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2692  cytochrome B561  57.79 
 
 		 261 aa  293  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000585757  normal  0.182683 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2388  cytochrome b561  56.85 
 
 		 255 aa  277  9e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2729  cytochrome B561  53.41 
 
 		 246 aa  270  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1941  cytochrome b561 family protein  38.84 
 
 		 239 aa  168  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00760577  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2494  cytochrome b561  32.3 
 
 		 214 aa  91.7  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1764  cytochrome B561  26.69 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.432878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3134  cytochrome B561  28.8 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2911  cytochrome B561  29.83 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6192  cytochrome B561  26.09 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1341  cytochrome B561  34.27 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000605388 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0113  cytochrome B561  29.44 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.224549 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0744  cytochrome B561  26.84 
 
 		 387 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0597147  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1074  cytochrome B561  33.73 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0236841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0473  cytochrome B561  28.03 
 
 		 226 aa  78.6  0.00000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.323429  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1061  cytochrome B561  28.94 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.114177  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1784  cytochrome B561  27.31 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144913 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2422  cytochrome B561  32.68 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308564  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3424  cytochrome B561  28.57 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1243  cytochrome B561  27.68 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.822746  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5579  cytochrome b561 family protein  25.51 
 
 		 184 aa  74.7  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.851973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0574  cytochrome B561  25.43 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.599646  normal  0.211296 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3204  cytochrome B561  27.83 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0109  cytochrome B561  27.47 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3770  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  25 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2054  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  24.26 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3658  cytochrome B561  33.11 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.76446 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0245  cytochrome B561  28.1 
 
 		 198 aa  72  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6037  cytochrome B561  26.32 
 
 		 181 aa  71.6  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151215  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1164  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  23.27 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.210413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2219  cytochrome B561  25.33 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1265  cytochrome B561  25 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348769 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3716  cytochrome B561  25.32 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6225  cytochrome B561  28.67 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.414079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0502  cytochrome B561  24.07 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.677446  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0244  cytochrome B561  27.35 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000989788 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3146  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  23.36 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0114554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0268  cytochrome B561  31.37 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0361  cytochrome B561  32.43 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.471527  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0543  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  20.76 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0475  cytochrome b  24.9 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2127  cytochrome B561  24.9 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0874  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  23.55 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4483  cytochrome b, putative  25.41 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2075  putative nickel-dependent hydrogenase cytochrome b-type subunit  24.79 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00002288  normal  0.934611 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3777  cytochrome B561  28.16 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1324  cytochrome B561  27.59 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1222  cytochrome B561  28.76 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000994109  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0691  cytochrome B561  23.67 
 
 		 202 aa  68.6  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.731454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1266  cytochrome B561  28.76 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000046168  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0121  nickel-iron hydrogenase, b-type cytochrome subunit  22.41 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.347229  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1133  cytochrome B561  32.03 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000490304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1134  cytochrome B561  32.03 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000156363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1170  cytochrome b561  25.64 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1156  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  22.04 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.190258  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1299  cytochrome B561  32.05 
 
 		 230 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000118155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0067  CybP  31.33 
 
 		 349 aa  67  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1204  cytochrome B561  32.03 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000144641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2397  cytochrome B561  25.71 
 
 		 198 aa  67  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0117421  normal  0.865597 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1211  cytochrome B561  26.37 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0526  cytochrome B561  25.33 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.815272  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3091  cytochrome B561  28.57 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000179659  normal  0.0155451 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2175  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  23.29 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000847396  normal  0.136379 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2321  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  22.82 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2354  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B- type subunit  26.79 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.678128 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3330  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  24.89 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3906  cytochrome B561  25.76 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2042  cytochrome B561  33.08 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0005809  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0173  cytochrome B561  25.88 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.551563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0461  cytochrome b561  25.75 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2058  cytochrome B561  25.88 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2130  cytochrome B561  23.14 
 
 		 390 aa  65.5  0.0000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.578698  normal  0.698297 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5867  cytochrome B561  27.34 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4935  cytochrome B561  27.19 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.43888 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0249  cytochrome B561  30.41 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000458311 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0246  cytochrome B561  33.33 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0215  cytochrome B561  27.12 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0243  cytochrome B561  30.41 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0243  cytochrome B561  30.41 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7263  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  22.86 
 
 		 236 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73881  normal  0.356245 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3282  cytochrome B561  27.8 
 
 		 231 aa  65.1  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00209273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3987  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  25.51 
 
 		 234 aa  65.1  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3286  cytochrome B561  24.45 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0957495 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0900  b-type cytochrome, putative  27.51 
 
 		 222 aa  65.1  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.983268  normal  0.508758 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2545  cytochrome B561  32.68 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0835  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  23.51 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2739  cytochrome B561  30.77 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00196146  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3536  cytochrome B561  24.67 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0164152 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1295  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  24.59 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00118042  normal  0.526274 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02246  cytochrome b561 family protein  24.37 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.516708  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1972  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  25.3 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.184335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1860  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  22.36 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>