More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_23320 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  100 
 
 		 181 aa  361  3e-99  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  72.47 
 
 		 179 aa  267  5.9999999999999995e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  66.11 
 
 		 180 aa  251  4.0000000000000004e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1355  ribosomal protein L6  68.36 
 
 		 177 aa  229  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  65.91 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  62.92 
 
 		 178 aa  226  1e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  64.61 
 
 		 178 aa  225  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  64.04 
 
 		 178 aa  222  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  60.34 
 
 		 179 aa  221  4e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  62.92 
 
 		 178 aa  221  6e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1059  50S ribosomal protein L6  58.89 
 
 		 179 aa  220  7e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.000000526273  normal  0.385866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1030  50S ribosomal protein L6  58.89 
 
 		 179 aa  220  7e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1047  50S ribosomal protein L6  58.89 
 
 		 179 aa  220  7e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000313329  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  59.55 
 
 		 178 aa  219  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  61.24 
 
 		 178 aa  219  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0602  ribosomal protein L6  62.01 
 
 		 179 aa  218  5e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.273648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  60.89 
 
 		 179 aa  217  7.999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  59.55 
 
 		 177 aa  216  1e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  61.45 
 
 		 179 aa  216  2e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1146  ribosomal protein L6  62.92 
 
 		 178 aa  215  2.9999999999999998e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000104709  hitchhiker  0.00466337 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3890  50S ribosomal protein L6  61.67 
 
 		 179 aa  214  5e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  59.22 
 
 		 179 aa  214  8e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20720  LSU ribosomal protein L6P  59.22 
 
 		 179 aa  213  9.999999999999999e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  59.78 
 
 		 179 aa  213  9.999999999999999e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2445  50S ribosomal protein L6  60.82 
 
 		 183 aa  213  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5032  50S ribosomal protein L6  57.54 
 
 		 179 aa  212  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000333726  normal  0.564685 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  58.43 
 
 		 178 aa  211  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2644  ribosomal protein L6  58.1 
 
 		 179 aa  210  7e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3402  ribosomal protein L6  58.33 
 
 		 179 aa  210  7e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0996  50S ribosomal protein L6  56.42 
 
 		 180 aa  209  1e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.156125  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3128  ribosomal protein L6  59.78 
 
 		 179 aa  209  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  57.87 
 
 		 178 aa  209  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1337  50S ribosomal protein L6  56.42 
 
 		 179 aa  209  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000514634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  59.78 
 
 		 179 aa  208  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  59.65 
 
 		 182 aa  208  4e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  56 
 
 		 177 aa  207  5e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  59.22 
 
 		 179 aa  207  7e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  57.87 
 
 		 178 aa  207  8e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0437  50S ribosomal protein L6  61.4 
 
 		 184 aa  206  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140454  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0577  50S ribosomal protein L6  59.67 
 
 		 180 aa  206  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  57.87 
 
 		 178 aa  206  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  57.14 
 
 		 182 aa  205  3e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1892  50S ribosomal protein L6  58.43 
 
 		 178 aa  205  3e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0452279  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  58.1 
 
 		 179 aa  205  3e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1101  50S ribosomal protein L6  60 
 
 		 180 aa  204  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0609  50S ribosomal protein L6P  56.74 
 
 		 178 aa  204  5e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00338994  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4300  50S ribosomal protein L6  58.66 
 
 		 180 aa  203  9e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3908  50S ribosomal protein L6  58.33 
 
 		 180 aa  203  9e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.383455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  61.18 
 
 		 182 aa  203  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  57.3 
 
 		 178 aa  203  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  54.49 
 
 		 178 aa  202  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  57.54 
 
 		 179 aa  202  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  57.54 
 
 		 179 aa  202  2e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0946  50S ribosomal protein L6  57.22 
 
 		 180 aa  202  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.183711  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0125  50S ribosomal protein L6  58.1 
 
 		 179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315024  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0616  ribosomal protein L6  57.14 
 
 		 177 aa  199  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0125  50S ribosomal protein L6  58.1 
 
 		 179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0121  50S ribosomal protein L6  58.1 
 
 		 179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0119  50S ribosomal protein L6  58.1 
 
 		 179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000265093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0137  50S ribosomal protein L6  58.1 
 
 		 179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23650  LSU ribosomal protein L6P  57.22 
 
 		 180 aa  199  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.291924  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0125  50S ribosomal protein L6  58.1 
 
 		 179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00622633  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0156  50S ribosomal protein L6  58.1 
 
 		 179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162457  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  58.1 
 
 		 179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0120  50S ribosomal protein L6  58.1 
 
 		 179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  54.75 
 
 		 180 aa  199  3e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4306  ribosomal protein L6  60 
 
 		 185 aa  198  3.9999999999999996e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  58.1 
 
 		 179 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000519907  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23171  50S ribosomal protein L6  55.62 
 
 		 179 aa  198  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0705  50S ribosomal protein L6  56.73 
 
 		 182 aa  197  7.999999999999999e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000289089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0716  50S ribosomal protein L6  56.18 
 
 		 179 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00767728  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  55.31 
 
 		 179 aa  196  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01320  ribosomal protein L6  56.18 
 
 		 179 aa  196  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.299584  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1115  50S ribosomal protein L6  56.74 
 
 		 179 aa  195  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19891  50S ribosomal protein L6  56.74 
 
 		 179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  55.68 
 
 		 179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1722  50S ribosomal protein L6  56.5 
 
 		 179 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0239785  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1338  50S ribosomal protein L6  53.71 
 
 		 177 aa  195  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2140  50S ribosomal protein L6P  56.82 
 
 		 177 aa  195  3e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105025  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16641  50S ribosomal protein L6  56.18 
 
 		 179 aa  194  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0073  50S ribosomal protein L6  56.18 
 
 		 178 aa  194  4.0000000000000005e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0362  50S ribosomal protein L6  55 
 
 		 181 aa  195  4.0000000000000005e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.08503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2386  50S ribosomal protein L6  57.87 
 
 		 178 aa  194  4.0000000000000005e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00107371  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0862  50S ribosomal protein L6P  56 
 
 		 177 aa  194  4.0000000000000005e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0120235  hitchhiker  0.00179777 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2573  50S ribosomal protein L6  57.31 
 
 		 182 aa  194  5.000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0210  50S ribosomal protein L6  56.74 
 
 		 178 aa  194  8.000000000000001e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  55.62 
 
 		 179 aa  193  9e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2918  50S ribosomal protein L6P  58.14 
 
 		 183 aa  193  9e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000181969  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0119  50S ribosomal protein L6  55.87 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000205529  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 181 aa  192  3e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1969  50S ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 179 aa  191  4e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2303  50S ribosomal protein L6  54.49 
 
 		 178 aa  191  5e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0125142  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2262  50S ribosomal protein L6  54.49 
 
 		 178 aa  191  5e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00376277  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  52.57 
 
 		 177 aa  191  6e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  55.62 
 
 		 179 aa  191  6e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0235  50S ribosomal protein L6  53.37 
 
 		 179 aa  190  7e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0238  50S ribosomal protein L6  53.37 
 
 		 179 aa  190  7e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0773  ribosomal protein L6 signature 1  58.14 
 
 		 183 aa  190  9e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000853841  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0492  ribosomal protein L6  52.27 
 
 		 178 aa  190  1e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187085  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2408  50S ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 179 aa  189  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000952005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>