More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0995 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0995  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  100 
 
 
183 aa  372  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.410626  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  55.7 
 
 
164 aa  185  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  56.49 
 
 
164 aa  183  1e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2336  Holliday junction resolvase  57.24 
 
 
161 aa  179  3e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0868617  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  53.9 
 
 
171 aa  175  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  5.23238e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  55.56 
 
 
176 aa  175  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  51.97 
 
 
164 aa  172  2e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.74044e-15 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  51.97 
 
 
164 aa  172  2e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0478  Holliday junction endonuclease RuvC  53.29 
 
 
180 aa  169  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177165  normal  0.867612 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1438  Holliday junction resolvase  51.97 
 
 
173 aa  157  9e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  7.86785e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  51.32 
 
 
181 aa  155  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  51.66 
 
 
173 aa  153  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00124897  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  49.68 
 
 
173 aa  152  3e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01598  Holliday junction resolvase  50.33 
 
 
173 aa  150  7e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0061  Holliday junction resolvase  50.3 
 
 
185 aa  150  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0317029  normal  0.843846 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  46.1 
 
 
163 aa  149  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1887  Holliday junction resolvase  49.01 
 
 
173 aa  149  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  48.68 
 
 
181 aa  148  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2493  Holliday junction resolvase  50.31 
 
 
165 aa  148  4e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0060  Holliday junction resolvase  50.93 
 
 
166 aa  147  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1270  Holliday junction resolvase  50.33 
 
 
174 aa  147  1e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460583  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1885  Holliday junction resolvase  52.6 
 
 
173 aa  145  2e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.94551  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3618  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  48.77 
 
 
166 aa  146  2e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1831  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3979  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  48.73 
 
 
176 aa  145  4e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2078  Holliday junction resolvase  51.95 
 
 
173 aa  145  4e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000308371  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1900  Holliday junction resolvase  51.95 
 
 
173 aa  145  4e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  3.00533e-05  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  45.39 
 
 
181 aa  145  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  45.39 
 
 
181 aa  144  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1221  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  48.75 
 
 
165 aa  144  6e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.69785  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1247  Holliday junction resolvase  52.94 
 
 
178 aa  144  7e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1408  Holliday junction resolvase  48.41 
 
 
174 aa  142  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0741674  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1955  Holliday junction resolvase  51.95 
 
 
173 aa  143  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.873797 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4543  Holliday junction resolvase  47.13 
 
 
174 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2431  Holliday junction resolvase  50.65 
 
 
173 aa  142  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12330  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.59 
 
 
165 aa  142  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.128626  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  45.39 
 
 
181 aa  142  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3627  Holliday junction resolvase  41.4 
 
 
165 aa  142  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535771  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4409  Holliday junction resolvase  48.73 
 
 
175 aa  142  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.049138  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51800  Holliday junction resolvase  47.13 
 
 
174 aa  142  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  4.86306e-05 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1937  Holliday junction resolvase  49.67 
 
 
173 aa  141  5e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00155576  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2364  Holliday junction resolvase  51.9 
 
 
173 aa  141  5e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00103097  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1218  Holliday junction resolvase  45 
 
 
168 aa  141  5e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.806199 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2102  Holliday junction resolvase  50 
 
 
173 aa  141  6e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2305  Holliday junction resolvase  50.98 
 
 
173 aa  140  7e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00234267  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2042  Holliday junction resolvase  50.98 
 
 
173 aa  140  7e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000214475  hitchhiker  5.71856e-08 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2421  Holliday junction resolvase  50.98 
 
 
173 aa  140  7e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  5.04743e-05  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2040  Holliday junction resolvase  50.98 
 
 
173 aa  140  7e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  8.85772e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1818  Holliday junction resolvase  50 
 
 
173 aa  140  8e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.311556  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0716  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  46.36 
 
 
173 aa  140  1e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.075927  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  47.83 
 
 
180 aa  140  1e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2077  Holliday junction resolvase  49.35 
 
 
173 aa  139  2e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.414118  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1798  Holliday junction endonuclease RuvC  43.67 
 
 
161 aa  139  2e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582609 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2032  Holliday junction resolvase  50.65 
 
 
173 aa  139  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00302461  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1480  Holliday junction resolvase  43.29 
 
 
182 aa  138  4e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.303273  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2573  Holliday junction resolvase  48.73 
 
 
173 aa  138  4e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00104649  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1706  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  50.96 
 
 
175 aa  137  6e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0826466  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2968  Holliday junction resolvase  45.51 
 
 
186 aa  137  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  48.37 
 
 
180 aa  137  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3776  Holliday junction resolvase  48.03 
 
 
180 aa  136  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518042  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  47.13 
 
 
183 aa  137  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3658  Holliday junction resolvase  44.91 
 
 
186 aa  136  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0609  Holliday junction resolvase  47.44 
 
 
183 aa  136  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  42.38 
 
 
162 aa  136  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0583  Holliday junction resolvase  47.44 
 
 
183 aa  136  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1130  Holliday junction resolvase  45.45 
 
 
275 aa  135  3e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0268  Holliday junction resolvase  45.45 
 
 
284 aa  135  3e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3364  Holliday junction resolvase  47.71 
 
 
180 aa  135  3e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3417  Holliday junction resolvase  44.51 
 
 
182 aa  135  3e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.124566  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2534  Holliday junction resolvase  47.71 
 
 
180 aa  135  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2355  Holliday junction resolvase  47.71 
 
 
180 aa  135  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3399  Holliday junction resolvase  47.71 
 
 
180 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3405  Holliday junction resolvase  47.71 
 
 
180 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0207  Holliday junction resolvase  46.71 
 
 
180 aa  134  6e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0690  Holliday junction resolvase  46.71 
 
 
180 aa  134  6e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2157  Holliday junction resolvase  48.91 
 
 
173 aa  134  6e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0903  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.75 
 
 
164 aa  134  6e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2259  Holliday junction resolvase  47.8 
 
 
173 aa  134  6e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  48.2 
 
 
184 aa  134  7e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.805464  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0482  Holliday junction resolvase  47.74 
 
 
184 aa  134  7e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0464061 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1346  Holliday junction resolvase  41.72 
 
 
166 aa  134  8e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  7.95843e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1349  Holliday junction resolvase  48.08 
 
 
173 aa  134  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00353939 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2057  Holliday junction resolvase  48.08 
 
 
173 aa  134  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0681914 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2236  Crossover junction endodeoxyribonuclease  48.08 
 
 
179 aa  134  9e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1225  Holliday junction resolvase  48.08 
 
 
173 aa  134  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.177509  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2052  Holliday junction resolvase  48.08 
 
 
173 aa  134  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2112  Holliday junction resolvase  48.08 
 
 
173 aa  134  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0214105 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0658  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.9 
 
 
191 aa  134  1e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.545827  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1109  Holliday junction resolvase  45.39 
 
 
159 aa  134  1e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.83978e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1323  Holliday junction resolvase  48.08 
 
 
173 aa  133  2e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2423  Holliday junction resolvase  49.65 
 
 
173 aa  133  2e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0385722  normal  0.655907 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2145  Holliday junction resolvase  49.65 
 
 
173 aa  133  2e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.25841  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2599  Holliday junction resolvase  48.08 
 
 
173 aa  133  2e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109079  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1777  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  48.08 
 
 
173 aa  133  2e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00202932  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1769  Holliday junction resolvase  48.08 
 
 
173 aa  133  2e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0125353  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2535  Holliday junction resolvase  49.69 
 
 
173 aa  133  2e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.278528 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0671  Holliday junction resolvase  46.06 
 
 
194 aa  133  2e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.674635  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2694  Holliday junction resolvase  46.05 
 
 
180 aa  133  2e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218252  normal  0.976349 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1109  Holliday junction resolvase  48.08 
 
 
173 aa  133  2e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1878  Holliday junction resolvase  47.44 
 
 
172 aa  132  2e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00784729  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01834  Holliday junction resolvase  48.08 
 
 
173 aa  133  2e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.837934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>