84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A3877 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03438  conserved hypothetical protein  85.85 
 
 		 659 aa  1201    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2720  protein of unknown function DUF1680  51.85 
 
 		 640 aa  697    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03389  hypothetical protein  85.85 
 
 		 667 aa  1202    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4952  hypothetical protein  86.31 
 
 		 656 aa  1206    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4064  hypothetical protein  99.08 
 
 		 651 aa  1351    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3893  hypothetical protein  99.23 
 
 		 651 aa  1357    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3877  hypothetical protein  100 
 
 		 651 aa  1366    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4002  hypothetical protein  99.08 
 
 		 651 aa  1357    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.563325 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3957  hypothetical protein  99.08 
 
 		 651 aa  1354    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal  0.86497 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3909  hypothetical protein  86.92 
 
 		 656 aa  1211    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2907  protein of unknown function DUF1680  48.71 
 
 		 659 aa  634  1e-180  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0376366  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2242  protein of unknown function DUF1680  46.42 
 
 		 652 aa  632  1e-180  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0591  hypothetical protein  45.55 
 
 		 646 aa  597  1e-169  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000770924  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1535  hypothetical protein  42.05 
 
 		 742 aa  571  1e-161  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3619  protein of unknown function DUF1680  41.53 
 
 		 640 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3907  protein of unknown function DUF1680  41.6 
 
 		 648 aa  492  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.373018 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2143  hypothetical protein  38.59 
 
 		 648 aa  489  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.56985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4162  hypothetical protein  40.36 
 
 		 640 aa  490  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549846 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6525  protein of unknown function DUF1680  38.69 
 
 		 647 aa  480  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0294245 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4474  protein of unknown function DUF1680  40.52 
 
 		 636 aa  477  1e-133  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0254713  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2215  protein of unknown function DUF1680  40.92 
 
 		 638 aa  476  1e-133  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3930  protein of unknown function DUF1680  38.83 
 
 		 640 aa  467  9.999999999999999e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0635  protein of unknown function DUF1680  40.54 
 
 		 656 aa  467  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0502  protein of unknown function DUF1680  37.63 
 
 		 617 aa  450  1e-125  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.171957  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0668  hypothetical protein  37.8 
 
 		 620 aa  437  1e-121  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0643  hypothetical protein  37.52 
 
 		 620 aa  439  1e-121  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000119693  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4989  protein of unknown function DUF1680  37.61 
 
 		 647 aa  416  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0192762 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1126  protein of unknown function DUF1680  38.34 
 
 		 628 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4835  protein of unknown function DUF1680  35.95 
 
 		 648 aa  405  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0969  hypothetical protein  34.78 
 
 		 634 aa  405  1e-111  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00300565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4720  protein of unknown function DUF1680  35.25 
 
 		 655 aa  402  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.827878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7232  protein of unknown function DUF1680  34.13 
 
 		 666 aa  395  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00213031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4996  protein of unknown function DUF1680  33.53 
 
 		 800 aa  388  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0292235  normal  0.0722722 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0212  hypothetical protein  46.43 
 
 		 397 aa  369  1e-100  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000517482  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1696  hypothetical protein  34.82 
 
 		 634 aa  368  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.793702  normal  0.298068 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05305  DUF1680 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G08910)  32.49 
 
 		 629 aa  348  2e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2738  protein of unknown function DUF1680  31.03 
 
 		 680 aa  342  2e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0391777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2748  protein of unknown function DUF1680  31.49 
 
 		 684 aa  341  2e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0072487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4148  protein of unknown function DUF1680  35.9 
 
 		 652 aa  338  9.999999999999999e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.834889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0910  hypothetical protein  30.47 
 
 		 665 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.027132  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2133  protein of unknown function DUF1680  28.64 
 
 		 673 aa  325  1e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0401427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4097  hypothetical protein  30.55 
 
 		 672 aa  323  7e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121081  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0057  protein of unknown function DUF1680  31.74 
 
 		 643 aa  314  2.9999999999999996e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0839925 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5347  protein of unknown function DUF1680  31.45 
 
 		 686 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611947  normal  0.22403 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01840  hypothetical protein  32.06 
 
 		 643 aa  298  2e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02820  hypothetical protein  30.7 
 
 		 643 aa  293  5e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.491149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0407  protein of unknown function DUF1680  30.77 
 
 		 633 aa  291  3e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1151  protein of unknown function DUF1680  35.78 
 
 		 679 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3839  hypothetical protein  34.21 
 
 		 654 aa  278  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254825  normal  0.0525361 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2831  protein of unknown function DUF1680  31.62 
 
 		 629 aa  275  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0164  hypothetical protein  30.22 
 
 		 602 aa  115  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.935603  normal  0.0626406 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0320  hypothetical protein  24.13 
 
 		 607 aa  112  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.280201  normal  0.603461 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1938  protein of unknown function DUF1680  28.27 
 
 		 711 aa  103  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0478  protein of unknown function DUF1680  23.32 
 
 		 641 aa  100  6e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.216473  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  27.8 
 
 		 955 aa  97.1  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2967  protein of unknown function DUF1680  26.93 
 
 		 838 aa  96.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000186086  hitchhiker  0.000639223 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01470  hypothetical protein  24.83 
 
 		 783 aa  95.5  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1254  protein of unknown function DUF1680  24.7 
 
 		 684 aa  91.7  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.831647  normal  0.201869 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3214  hypothetical protein  24.58 
 
 		 844 aa  87.8  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.77483  normal  0.454399 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1422  protein of unknown function DUF1680  23.59 
 
 		 760 aa  86.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428296  normal  0.497833 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2080  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  26.22 
 
 		 795 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.254608  hitchhiker  0.00000268125 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1982  hypothetical protein  25.52 
 
 		 795 aa  84  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0591519  hitchhiker  0.000518937 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1993  hypothetical protein  25.52 
 
 		 795 aa  84  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0573537  hitchhiker  0.00434895 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0778  Acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  23.47 
 
 		 803 aa  82.4  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.163489 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1728  protein of unknown function DUF1680  27.06 
 
 		 675 aa  80.9  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.670849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2153  protein of unknown function DUF1680  23.66 
 
 		 792 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.299284  normal  0.0915146 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3876  hypothetical protein  19.58 
 
 		 765 aa  80.1  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3545  hypothetical protein  22.31 
 
 		 663 aa  79.3  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.550366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0089  protein of unknown function DUF1680  23.08 
 
 		 677 aa  79.7  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  24.9 
 
 		 963 aa  79.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4617  protein of unknown function DUF1680  21.39 
 
 		 1025 aa  78.2  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0602011  normal  0.370298 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1342  hypothetical protein  22.63 
 
 		 669 aa  78.2  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2836  protein of unknown function DUF1680  26.92 
 
 		 614 aa  77.8  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2035  protein of unknown function DUF1680  22.53 
 
 		 678 aa  77  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337709 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0636  protein of unknown function DUF1680  22.27 
 
 		 667 aa  74.7  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.788531 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  24.54 
 
 		 846 aa  68.2  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1480  protein of unknown function DUF1680  24.12 
 
 		 632 aa  66.6  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  23.27 
 
 		 771 aa  66.6  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1194  protein of unknown function DUF1680  26.27 
 
 		 749 aa  66.2  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.113974  normal  0.159601 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0062  protein of unknown function DUF1680  21.69 
 
 		 596 aa  63.2  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.560227 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11690  hypothetical protein  22.74 
 
 		 752 aa  53.5  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0997  protein of unknown function DUF1680  18.47 
 
 		 597 aa  52.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0363  protein of unknown function DUF1680  23.83 
 
 		 744 aa  52  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4712  protein of unknown function DUF1680  24.9 
 
 		 881 aa  47  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>