190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2606 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  100 
 
 		 435 aa  866    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  86.87 
 
 		 435 aa  766    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  77.93 
 
 		 431 aa  660    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  77.42 
 
 		 428 aa  634    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  77 
 
 		 431 aa  654    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  77 
 
 		 431 aa  654    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  62.79 
 
 		 423 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  62.79 
 
 		 423 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  62.79 
 
 		 423 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  63.06 
 
 		 424 aa  519  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  63.02 
 
 		 423 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  62.79 
 
 		 423 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  61.32 
 
 		 436 aa  511  1e-144  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  64.41 
 
 		 407 aa  512  1e-144  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  64.65 
 
 		 423 aa  512  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  60.93 
 
 		 420 aa  509  1e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  64.19 
 
 		 423 aa  511  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  62.82 
 
 		 421 aa  509  1e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  63.83 
 
 		 415 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  64.19 
 
 		 423 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  63.15 
 
 		 421 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  62.5 
 
 		 415 aa  503  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  62.99 
 
 		 415 aa  498  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  59.67 
 
 		 424 aa  486  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  57.62 
 
 		 410 aa  461  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  54.87 
 
 		 435 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  52.81 
 
 		 389 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  52.14 
 
 		 428 aa  413  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  50.6 
 
 		 425 aa  414  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  53.04 
 
 		 428 aa  410  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  51.93 
 
 		 437 aa  394  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  51.5 
 
 		 436 aa  394  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  50.47 
 
 		 403 aa  384  1e-105  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  50.6 
 
 		 427 aa  376  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  50.71 
 
 		 413 aa  374  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  47.95 
 
 		 426 aa  369  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  51.34 
 
 		 412 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  47.23 
 
 		 426 aa  363  4e-99  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  45.62 
 
 		 440 aa  351  2e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2125  glucose/galactose transporter  42.83 
 
 		 468 aa  335  1e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.957571 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  43.78 
 
 		 412 aa  332  1e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5334  glucose/galactose transporter  44.96 
 
 		 405 aa  321  9.999999999999999e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120939  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04150  glucose/galactose transporter protein  45.5 
 
 		 429 aa  320  3e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2311  glucose/galactose transporter  42.5 
 
 		 471 aa  319  5e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0518008 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  44.39 
 
 		 428 aa  317  2e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1324  glucose/galactose transporter  41.48 
 
 		 413 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal  0.568114 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  46.13 
 
 		 408 aa  295  9e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  45.96 
 
 		 408 aa  293  5e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  36.72 
 
 		 432 aa  293  6e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1656  glucose/galactose transporter  38.69 
 
 		 458 aa  292  1e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  40.57 
 
 		 417 aa  291  2e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1395  glucose/galactose transporter  45.66 
 
 		 431 aa  276  7e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.774597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  38.8 
 
 		 431 aa  275  1.0000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  38.65 
 
 		 417 aa  274  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  37.65 
 
 		 417 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0644  L-fucose transporter  37.66 
 
 		 409 aa  264  3e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510185  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0773  fucose permease  47.91 
 
 		 485 aa  263  4e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380581 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1486  glucose/galactose transporter  39.36 
 
 		 439 aa  260  4e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  38.4 
 
 		 431 aa  246  8e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3606  fucose permease  33.03 
 
 		 425 aa  239  6.999999999999999e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02756  L-fucose:H+ symporter permease  36.52 
 
 		 411 aa  238  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1551  L-fucose transporter  37.65 
 
 		 434 aa  234  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3120  L-fucose transporter  35.21 
 
 		 438 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.38497  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3300  L-fucose transporter  35.21 
 
 		 438 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3137  L-fucose transporter  35.21 
 
 		 438 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3185  L-fucose transporter  35.21 
 
 		 438 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3200  L-fucose transporter  35.21 
 
 		 438 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0887  L-fucose transporter  35.06 
 
 		 438 aa  232  9e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0911  L-fucose transporter  35.06 
 
 		 438 aa  232  9e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2945  L-fucose transporter  35.06 
 
 		 438 aa  232  9e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3106  L-fucose transporter  35.06 
 
 		 438 aa  232  9e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101933  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2428  L-fucose permease  35.09 
 
 		 433 aa  231  1e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2942  L-fucose transporter  35.06 
 
 		 438 aa  231  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4065  L-fucose transporter  34.82 
 
 		 438 aa  230  4e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6949  L-fucose transporter  35.06 
 
 		 457 aa  229  8e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1540  L-fucose permease  35.37 
 
 		 457 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6289  L-fucose transporter  35.37 
 
 		 457 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.642767 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6905  L-fucose permease  35.37 
 
 		 457 aa  225  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17660  fucose permease  34.87 
 
 		 425 aa  223  4.9999999999999996e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.634966  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4488  L-fucose permease  32.61 
 
 		 443 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.530054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0872  major facilitator transporter  36.49 
 
 		 426 aa  221  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224242  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3397  glucose/galactose transporter  35.47 
 
 		 419 aa  218  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0960  fucose permease  35.22 
 
 		 421 aa  219  1e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.608891  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0536  L-fucose permease  31.55 
 
 		 418 aa  218  2e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.186143  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1612  L-fucose transporter  32.2 
 
 		 434 aa  216  5e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0487027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1448  L-fucose permease  31.31 
 
 		 418 aa  216  7e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1066  L-fucose:H+ symporter permease  31.39 
 
 		 399 aa  213  4.9999999999999996e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0827702  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1002  glucose/galactose transporter  33.17 
 
 		 406 aa  210  5e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00935633  normal  0.690968 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5715  L-fucose transporter  31.86 
 
 		 417 aa  209  8e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.988636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1494  L-fucose transporter  30.31 
 
 		 414 aa  208  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.289824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4044  L-fucose transporter  30.17 
 
 		 420 aa  207  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01060  conserved hypothetical protein  33.02 
 
 		 468 aa  205  2e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1447  L-fucose permease  30.19 
 
 		 430 aa  205  2e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0300963  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1420  major facilitator transporter  36.28 
 
 		 467 aa  203  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0875  glucose/galactose transporter  33.18 
 
 		 429 aa  203  6e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742352  hitchhiker  0.000720356 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1104  glucose/galactose transporter  34.08 
 
 		 437 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0045785  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3437  L-fucose transporter  29.72 
 
 		 412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0364  L-fucose permease  31.34 
 
 		 448 aa  200  5e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3368  L-fucose transporter  29.71 
 
 		 413 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6560  glucose/galactose transporter  31.78 
 
 		 438 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13532  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>