More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1747 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1747  transcription antitermination factor NusB  100 
 
 		 136 aa  274  3e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0403  transcription antitermination protein NusB  61.07 
 
 		 132 aa  172  9.999999999999999e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0431  transcription antitermination protein NusB  56.15 
 
 		 132 aa  153  9e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.232136  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0405  transcription antitermination protein NusB  56.15 
 
 		 132 aa  153  9e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1576  transcription antitermination protein NusB  55.38 
 
 		 132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1333  transcription antitermination protein NusB  56.92 
 
 		 131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0030  transcription antitermination protein NusB  53.85 
 
 		 131 aa  149  2e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0541  transcription antitermination protein NusB  54.2 
 
 		 132 aa  145  3e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0784  transcription antitermination protein NusB  52.34 
 
 		 131 aa  128  3e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1180  transcription antitermination protein NusB  50 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  34.11 
 
 		 155 aa  89.7  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1328  NusB antitermination factor  34.92 
 
 		 138 aa  88.6  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.732904  normal  0.808756 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  35.25 
 
 		 142 aa  88.6  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  36.43 
 
 		 142 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  36.43 
 
 		 142 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0083  transcription termination factor  33.07 
 
 		 190 aa  88.2  4e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1534  transcription antitermination protein NusB  36.43 
 
 		 140 aa  87.8  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276167  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  36.43 
 
 		 142 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  35.77 
 
 		 143 aa  87.4  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3147  NusB antitermination factor  36.72 
 
 		 135 aa  87  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.511001  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  40 
 
 		 140 aa  86.7  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5248  NusB antitermination factor  35.34 
 
 		 139 aa  86.3  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1850  transcription antitermination factor NusB  33.33 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.975567 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3601  transcription antitermination factor NusB  34.06 
 
 		 163 aa  85.5  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397135  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2727  NusB antitermination factor  37.01 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12640  NusB antitermination factor  33.59 
 
 		 137 aa  85.5  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0537288 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1843  NusB antitermination factor  32.58 
 
 		 136 aa  85.1  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12553  transcription antitermination protein NusB  34.13 
 
 		 156 aa  84.7  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0342122 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0847  transcription antitermination protein NusB  36.09 
 
 		 141 aa  85.1  3e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2652  transcription antitermination protein NusB  37.01 
 
 		 163 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1988  NusB antitermination factor  41.67 
 
 		 164 aa  84  6e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0096  transcription antitermination protein NusB  36.5 
 
 		 141 aa  83.2  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1616  transcription antitermination protein NusB  45.98 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000103725  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1583  transcription antitermination protein NusB  45.98 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00456723  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4282  NusB antitermination factor  33.58 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.683816 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0564  hypothetical protein  36.92 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000187667  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1628  NusB antitermination factor  36.64 
 
 		 138 aa  80.5  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1059  transcription antitermination protein NusB  38.39 
 
 		 142 aa  80.5  0.000000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  35.61 
 
 		 138 aa  80.1  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1085  transcription antitermination protein NusB  43.53 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.770091  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1424  NusB antitermination factor  36.15 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132746  normal  0.0757739 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1521  NusB antitermination factor  35.66 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000719098  normal  0.286205 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2400  transcription antitermination protein NusB  34.13 
 
 		 162 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2359  transcription antitermination protein NusB  34.13 
 
 		 162 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.600142  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0030  NusB antitermination factor  35.11 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2406  transcription antitermination protein NusB  34.13 
 
 		 162 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798177  normal  0.0506261 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  35.61 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0505  NusB antitermination factor  39.53 
 
 		 171 aa  79.3  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1053  transcription antitermination protein NusB  37.5 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1905  NusB antitermination factor  32.81 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1713  transcription antitermination protein NusB  37.78 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0502  NusB antitermination factor  39.26 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1061  transcription antitermination factor NusB  31.54 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000379385  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1780  NusB antitermination factor  37.5 
 
 		 166 aa  79.3  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97176  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2394  NusB antitermination factor  31.16 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1089  NusB antitermination factor  31.54 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.441067  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1278  N utilization substance protein B  30.77 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.279513  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  40.94 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  38.93 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  38.93 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  38.93 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  38.93 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  38.93 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1215  NusB antitermination factor  29.85 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.291418 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  38.93 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3751  transcription antitermination protein NusB  33.58 
 
 		 164 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.110762 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  38.93 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  32.61 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1069  NusB antitermination factor  35.77 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269454  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  38.17 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1839  NusB antitermination factor  30.16 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156187  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  38.17 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08000  transcription antitermination factor NusB  33.33 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0164  NusB antitermination factor  31.5 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2418  transcription antitermination factor NusB  29.77 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.136308  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  35.29 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3020  NusB antitermination factor  34.53 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.532849  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17920  NusB antitermination factor  29.77 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.552235  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1706  NusB antitermination factor  29.77 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188231  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1043  NusB antitermination factor  33.59 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310425  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2589  NusB antitermination factor  32.82 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1304  NusB antitermination factor  35.11 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.592114  normal  0.0232631 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2942  NusB antitermination factor  31.34 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000122519  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3008  NusB antitermination factor  31.93 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1230  NusB antitermination factor  34.53 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0417  NusB antitermination factor  38.76 
 
 		 169 aa  74.3  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2075  NusB antitermination factor  31.85 
 
 		 154 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248305  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3146  NusB antitermination factor  32.33 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121302 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0496  NusB antitermination factor  36.22 
 
 		 168 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4342  transcription antitermination protein NusB  36.11 
 
 		 209 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  32.56 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1703  NusB antitermination factor  38.89 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.747293  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1693  transcription antitermination protein NusB  36.92 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3044  transcription antitermination protein NusB  30.99 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.102552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1642  NusB antitermination factor  34.65 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2539  NusB antitermination factor  35.21 
 
 		 195 aa  72  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2032  NusB antitermination factor  34.83 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0272583 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1679  NusB antitermination factor  38.52 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2438  transcription antitermination factor NusB  42.86 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.841246  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0283  NusB antitermination factor  28.24 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.102265  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>