More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0491 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0491  aminotransferase class I and II  100 
 
 
376 aa  775  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0759  hypothetical protein  63 
 
 
378 aa  456  1e-127  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0344164  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1340  succinyldiaminopimelate transaminase  39.49 
 
 
397 aa  276  3e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.313049 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0439  succinyldiaminopimelate transaminase  37.09 
 
 
412 aa  271  1e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1531  aminotransferase, classes I and II  38.92 
 
 
397 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0044  succinyldiaminopimelate transaminase  38.27 
 
 
405 aa  270  2e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1269  aminotransferase class I and II  39.74 
 
 
395 aa  270  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.58359 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1491  succinyldiaminopimelate transaminase  39.49 
 
 
398 aa  270  3e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.997861  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1143  succinyldiaminopimelate transaminase  38.17 
 
 
399 aa  269  5e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385883  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0393  succinyldiaminopimelate transaminase  37.22 
 
 
408 aa  269  6e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00205919 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1098  succinyldiaminopimelate transaminase  39.48 
 
 
399 aa  269  6e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2124  succinyldiaminopimelate transaminase  38.92 
 
 
399 aa  269  6e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1221  succinyldiaminopimelate transaminase  39.9 
 
 
398 aa  265  9e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0555  succinyldiaminopimelate transaminase  37.16 
 
 
409 aa  265  9e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147864 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4189  succinyldiaminopimelate transaminase  37.5 
 
 
398 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.199864  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3056  succinyldiaminopimelate transaminase  38.56 
 
 
398 aa  264  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.433541  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1588  succinyldiaminopimelate transaminase  37.69 
 
 
398 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.133702  normal  0.347765 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1850  succinyldiaminopimelate transaminase  39.07 
 
 
397 aa  261  1e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0598613  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2515  succinyldiaminopimelate transaminase  37.12 
 
 
407 aa  260  3e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1480  succinyldiaminopimelate transaminase  39.23 
 
 
402 aa  260  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1394  succinyldiaminopimelate transaminase  36.73 
 
 
417 aa  260  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4085  succinyldiaminopimelate transaminase  37.69 
 
 
398 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.930262 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2193  succinyldiaminopimelate transaminase  38.82 
 
 
397 aa  259  4e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39020  succinyldiaminopimelate transaminase  38.3 
 
 
398 aa  259  6e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0524021  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1267  succinyldiaminopimelate transaminase  36.99 
 
 
399 aa  259  7e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.589506  normal  0.362674 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1331  succinyldiaminopimelate transaminase  36.73 
 
 
399 aa  258  9e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.785266  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17030  succinyldiaminopimelate transaminase  38.97 
 
 
402 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1807  succinyldiaminopimelate transaminase  36.55 
 
 
400 aa  258  1e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2603  succinyldiaminopimelate transaminase  38.62 
 
 
407 aa  257  2e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0274  succinyldiaminopimelate transaminase  36.73 
 
 
409 aa  258  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2485  succinyldiaminopimelate transaminase  36.39 
 
 
400 aa  256  5e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.354726  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0252  succinyldiaminopimelate transaminase  36.55 
 
 
401 aa  255  7e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1997  succinyldiaminopimelate transaminase  35.95 
 
 
405 aa  255  9e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.356902 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2720  succinyldiaminopimelate transaminase  37.31 
 
 
403 aa  254  1e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0250139  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1386  succinyldiaminopimelate transaminase  39.16 
 
 
396 aa  254  2e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2551  aminotransferase, class I and II  38.11 
 
 
400 aa  250  3e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.138065  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1813  succinyldiaminopimelate transaminase  36.55 
 
 
402 aa  249  4e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1891  succinyldiaminopimelate transaminase  37.34 
 
 
399 aa  249  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1866  succinyldiaminopimelate transaminase  36.06 
 
 
396 aa  248  1e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402909  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1032  succinyldiaminopimelate transaminase  37.08 
 
 
397 aa  248  1e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2047  succinyldiaminopimelate transaminase  35.41 
 
 
409 aa  248  1e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1498  aminotransferase class I and II  38.36 
 
 
401 aa  247  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.632779  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1821  aminotransferase, classes I and II  38.36 
 
 
406 aa  247  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3617  succinyldiaminopimelate transaminase  35.62 
 
 
401 aa  247  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00115899  normal  0.0503817 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0560  succinyldiaminopimelate transaminase  35.11 
 
 
399 aa  246  4e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.370858  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1153  succinyldiaminopimelate transaminase  37.79 
 
 
398 aa  246  5e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1889  succinyldiaminopimelate transaminase  36.73 
 
 
404 aa  245  1e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2066  succinyldiaminopimelate transaminase  36.48 
 
 
404 aa  244  2e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.595829 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1727  succinyldiaminopimelate transaminase  37.69 
 
 
396 aa  243  3e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.963211  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1671  succinyldiaminopimelate transaminase  35.7 
 
 
405 aa  240  3e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0235103 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2466  succinyldiaminopimelate transaminase  35.44 
 
 
405 aa  240  3e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138526 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5338  succinyldiaminopimelate transaminase  34.68 
 
 
410 aa  235  9e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1348  succinyldiaminopimelate transaminase  35.86 
 
 
434 aa  234  2e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.248718 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1469  aminotransferase, class I and II  35.62 
 
 
399 aa  233  5e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2048  succinyldiaminopimelate transaminase  34.43 
 
 
410 aa  232  7e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2029  succinyldiaminopimelate transaminase  34.43 
 
 
410 aa  232  7e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6048  succinyldiaminopimelate transaminase  34.43 
 
 
410 aa  232  7e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1248  succinyldiaminopimelate transaminase  34.68 
 
 
410 aa  232  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4601  aminotransferase class I and II  34.38 
 
 
398 aa  228  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1424  succinyldiaminopimelate transaminase  35.79 
 
 
410 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000365494  normal  0.0284066 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2017  succinyldiaminopimelate transaminase  33.58 
 
 
420 aa  226  5e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1930  succinyldiaminopimelate transaminase  33.41 
 
 
420 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1565  succinyldiaminopimelate transaminase  34.25 
 
 
415 aa  219  4e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.155441  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1340  succinyldiaminopimelate transaminase  34.25 
 
 
410 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3244  succinyldiaminopimelate transaminase  34.25 
 
 
410 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667849  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2504  succinyldiaminopimelate transaminase  34.25 
 
 
410 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181196  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2068  succinyldiaminopimelate transaminase  34.25 
 
 
410 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.854431  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2448  succinyldiaminopimelate transaminase  34 
 
 
410 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.805274  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1301  aminotransferase class I and II  32.41 
 
 
413 aa  217  3e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.54822 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0059  aminotransferase  34.47 
 
 
392 aa  211  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.419945  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2061  succinyldiaminopimelate transaminase  33.25 
 
 
387 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3706  aminotransferase  32.22 
 
 
460 aa  206  4e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0089  aminotransferase, class I and II  32.64 
 
 
423 aa  202  7e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.789487  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0427  aminotransferase  32.55 
 
 
393 aa  200  4e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2899  aminotransferase, class I and II  32.89 
 
 
392 aa  199  7e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.24547  normal  0.890178 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0060  aminotransferase class I and II  32.01 
 
 
393 aa  197  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.119317  hitchhiker  3.2787e-06 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0144  aminotransferase, class I and II  32.89 
 
 
392 aa  197  4e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.680923  normal  0.141638 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0082  aminotransferase, class I and II  32.38 
 
 
423 aa  196  4e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0909898 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0281  aminotransferase class I and II  32.65 
 
 
408 aa  196  5e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0769639  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0132  aminotransferase  30.33 
 
 
404 aa  196  6e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.926406  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1494  aminotransferase  32.62 
 
 
392 aa  196  7e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0109617  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0376  aminotransferase, class I and II  31.77 
 
 
420 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0445  aminotransferase, class I and II  32.32 
 
 
412 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.335861 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0275  aminotransferase, class I and II  32.48 
 
 
438 aa  193  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.224598 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2672  aminotransferase, class I and II  33.33 
 
 
397 aa  189  5e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0074  aminotransferase  33.33 
 
 
405 aa  188  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1842  aminotransferase class I and II  30.23 
 
 
416 aa  168  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.134959  normal  0.168146 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3971  aminotransferase class I and II  31.05 
 
 
396 aa  164  2e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.661843  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3893  aminotransferase class I and II  30.48 
 
 
396 aa  162  8e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3830  succinyldiaminopimelate aminotransferase  30.2 
 
 
383 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1002  aminotransferase class I and II  28.23 
 
 
386 aa  158  1e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3944  aminotransferase class I and II  28.16 
 
 
388 aa  148  1e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.082916 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  28.61 
 
 
382 aa  149  1e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0771  aminotransferase class I and II  30.38 
 
 
363 aa  148  1e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157611  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  29.21 
 
 
382 aa  147  4e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1272  aminotransferase class I and II  29.64 
 
 
386 aa  144  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  28.88 
 
 
388 aa  143  5e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0492  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  27.01 
 
 
370 aa  142  6e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.711349  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8434  aminotransferase class I and II  27.54 
 
 
359 aa  142  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1916  aminotransferase  29.01 
 
 
407 aa  142  9e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>