More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0066 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0066  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 
396 aa  812  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1825  recombination factor protein RarA  60.35 
 
 
394 aa  503  1e-141  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1569  recombination factor protein RarA  59.65 
 
 
396 aa  486  1e-136  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0824  recombination factor protein RarA  57.65 
 
 
392 aa  486  1e-136  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00630594  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0211  recombination factor protein RarA  58.46 
 
 
393 aa  477  1e-133  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1776  recombination factor protein RarA  57.36 
 
 
397 aa  468  1e-130  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0191  recombination factor protein RarA  59.08 
 
 
393 aa  458  1e-128  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0229  recombination factor protein RarA  58.82 
 
 
393 aa  457  1e-127  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0208  recombination factor protein RarA  58.82 
 
 
393 aa  456  1e-127  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0141  ATPase central domain-containing protein  41.1 
 
 
416 aa  308  8e-83  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  43.35 
 
 
453 aa  304  2e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  4.32966e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1125  AAA ATPase central domain protein  40.97 
 
 
408 aa  302  6e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00180693  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  40.15 
 
 
432 aa  300  3e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  40.38 
 
 
441 aa  299  5e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0815  AAA ATPase central domain protein  42.05 
 
 
395 aa  298  1e-79  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1498  AAA ATPase central domain protein  41.71 
 
 
435 aa  298  2e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  40.29 
 
 
432 aa  294  2e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0184  AAA ATPase central domain protein  45.24 
 
 
426 aa  293  4e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0165  AAA ATPase central domain protein  42.82 
 
 
419 aa  290  3e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  40.63 
 
 
434 aa  286  3e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1199  AAA ATPase central domain protein  39.32 
 
 
428 aa  285  8e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  40.39 
 
 
434 aa  285  1e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1440  recombination factor protein RarA  40.9 
 
 
426 aa  285  1e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0732  recombination factor protein RarA  41.91 
 
 
457 aa  282  6e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0452  AAA ATPase central domain protein  39.9 
 
 
443 aa  282  8e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1618  recombination factor protein RarA  42.09 
 
 
445 aa  281  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05640  putative ATPase, AAA family protein  42.09 
 
 
425 aa  281  1e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  40.55 
 
 
447 aa  280  3e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0257  recombination factor protein RarA  41.75 
 
 
439 aa  280  4e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  9.7809e-10  normal  0.0366003 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2405  recombination factor protein RarA  42.3 
 
 
420 aa  280  4e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  39.9 
 
 
446 aa  279  6e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0094  recombination factor protein RarA  40.14 
 
 
429 aa  279  7e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  40.24 
 
 
441 aa  278  1e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  5.73735e-05  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0103  recombination factor protein RarA  40.14 
 
 
429 aa  278  1e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0463  recombination factor protein RarA  38.28 
 
 
440 aa  277  2e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  2.3762e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0410  recombination factor protein RarA  41.75 
 
 
425 aa  276  4e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.108672  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2558  AAA ATPase central domain protein  38.77 
 
 
446 aa  276  6e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  41.94 
 
 
429 aa  275  1e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1974  AAA ATPase central domain protein  36.99 
 
 
456 aa  275  1e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381905  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1757  recombination factor protein RarA  40.73 
 
 
415 aa  275  1e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00211833  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  37.65 
 
 
444 aa  275  1e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  39.04 
 
 
435 aa  274  2e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  39.09 
 
 
440 aa  274  3e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  39.09 
 
 
448 aa  273  3e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  38.53 
 
 
432 aa  273  4e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07770  Recombination protein MgsA  37.92 
 
 
446 aa  272  6e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.138045 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  39.51 
 
 
441 aa  272  8e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1103  recombination factor protein RarA  41.6 
 
 
434 aa  271  2e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  38.12 
 
 
432 aa  270  3e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0832  recombination factor protein RarA  39.61 
 
 
454 aa  270  3e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  38.07 
 
 
435 aa  270  4e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0836  recombination factor protein RarA  40.58 
 
 
449 aa  270  5e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0420  AAA ATPase central domain protein  40.16 
 
 
423 aa  269  6e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2081  recombination factor protein RarA  40.34 
 
 
441 aa  267  2e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0792  AAA ATPase central domain protein  39.3 
 
 
431 aa  266  5e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0016  recombination factor protein RarA  39.12 
 
 
441 aa  266  5e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.901386  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3766  recombination factor protein RarA  38.1 
 
 
446 aa  265  7e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2050  AAA ATPase central domain-containing protein  40.19 
 
 
436 aa  265  8e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05070  Recombination protein MgsA  37.31 
 
 
435 aa  265  1e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.395442  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  38.33 
 
 
447 aa  264  2e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  39.29 
 
 
458 aa  265  2e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2635  recombination factor protein RarA  37.47 
 
 
429 aa  264  3e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00871  recombination factor protein RarA  36.76 
 
 
455 aa  263  6e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0752794  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3035  recombination factor protein RarA  37.38 
 
 
456 aa  262  1e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25425  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0082  recombination factor protein RarA  39.85 
 
 
419 aa  261  2e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0144  recombination factor protein RarA  40.44 
 
 
378 aa  261  2e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3309  AAA ATPase central domain protein  36.98 
 
 
494 aa  261  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000347883  normal  0.0560035 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0154  recombination factor protein RarA  38 
 
 
410 aa  261  2e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  39.56 
 
 
447 aa  261  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  36.34 
 
 
731 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1685  recombination factor protein RarA  39.24 
 
 
424 aa  260  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  4.66548e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1718  recombination factor protein RarA  39.24 
 
 
424 aa  260  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  7.35591e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1935  recombination factor protein RarA  37.47 
 
 
422 aa  260  3e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0363606  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2421  recombination factor protein RarA  37.44 
 
 
436 aa  259  7e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.234269  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  38.18 
 
 
435 aa  259  7e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00891  recombination factor protein RarA  37.25 
 
 
429 aa  258  9e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0938  recombination factor protein RarA  37.86 
 
 
436 aa  259  9e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347987  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  37.17 
 
 
450 aa  258  9e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16380  Recombination protein MgsA  38.78 
 
 
461 aa  258  1e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.8867  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5733  AAA ATPase central domain protein  40.79 
 
 
423 aa  258  1e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855875  normal  0.0926038 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0112  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  36.54 
 
 
739 aa  258  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0977  recombination factor protein RarA  37.62 
 
 
436 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0498  recombination factor protein RarA  37.62 
 
 
436 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1190  recombination factor protein RarA  38.27 
 
 
423 aa  258  2e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0120628  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  37.5 
 
 
437 aa  258  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.74356e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1650  recombination factor protein RarA  36.88 
 
 
440 aa  256  3e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2484  recombination factor protein RarA  35.97 
 
 
435 aa  257  3e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  37.78 
 
 
447 aa  256  3e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0041  recombination factor protein RarA  36.95 
 
 
459 aa  256  4e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.481618  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1169  recombination factor protein RarA  36.54 
 
 
437 aa  256  4e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0725259  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0429  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  37 
 
 
599 aa  256  5e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000753896  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3217  recombination factor protein RarA  34.99 
 
 
519 aa  256  5e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0809903  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  37.91 
 
 
438 aa  256  6e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2132  AAA ATPase central domain protein  38.1 
 
 
463 aa  256  6e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000588224  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12760  recombination factor protein RarA  36.64 
 
 
465 aa  256  7e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.294411  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0837  recombination factor protein RarA  37.71 
 
 
436 aa  255  7e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0954108  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1691  recombination factor protein RarA  35.98 
 
 
465 aa  256  7e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1983  recombination factor protein RarA  37.53 
 
 
438 aa  255  7e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0414  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  36.75 
 
 
599 aa  255  9e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  1.74137e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2372  recombination factor protein RarA  36.84 
 
 
445 aa  255  9e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>