More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3266 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_3266  methylation site containing protein  100 
 
 
167 aa  338  1e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1101  methylation site containing protein  98.2 
 
 
167 aa  333  7e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000943511 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3444  methylation site containing protein  97.01 
 
 
167 aa  330  6e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280491 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3308  methylation site containing protein  97.01 
 
 
167 aa  326  9e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1176  hypothetical protein  83.44 
 
 
163 aa  282  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0999  methylation site containing protein  83.44 
 
 
164 aa  266  1e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0926979  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1003  methylation site containing protein  83.44 
 
 
164 aa  266  1e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.102399 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2860  methylation site containing protein  84.43 
 
 
167 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1064  methylation site containing protein  84.05 
 
 
164 aa  254  4e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.691522  normal  0.0588159 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0708  methylation site containing protein  63.92 
 
 
170 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0386199  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1388  methylation site containing protein  44.83 
 
 
175 aa  144  6e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0397  methylation site containing protein  39.24 
 
 
163 aa  96.7  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.061774  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3479  methylation site containing protein  37.87 
 
 
169 aa  95.5  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000294883  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3656  methylation site containing protein  37.35 
 
 
169 aa  94.4  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00406084  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0516  methylation site containing protein  53.06 
 
 
172 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00623258  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4409  methylation site containing protein  39.35 
 
 
166 aa  89.4  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000123074  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3828  methylation site containing protein  37.79 
 
 
172 aa  87.8  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000112537  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0567  methylation site containing protein  38.55 
 
 
169 aa  85.9  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468703  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3761  MSHA pilin protein MshA  36.42 
 
 
178 aa  85.5  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000202365  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3099  methylation site containing protein  32.78 
 
 
172 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0461  MSHA pilin protein MshA  48.98 
 
 
172 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3744  methylation site containing protein  32.58 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.144711  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0551  MSHA pilin protein MshA  36.36 
 
 
173 aa  80.9  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000258454  normal  0.542221 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0515  methylation site containing protein  33.14 
 
 
168 aa  80.9  0.000000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000372661  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3760  methylation site containing protein  33.7 
 
 
176 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000143336  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3822  putative V10 pilin  32.92 
 
 
163 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0491  methylation site containing protein  31.44 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000497616  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0512  methylation site containing protein  31.55 
 
 
182 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000175657  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0476  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin A  31.13 
 
 
157 aa  76.3  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3340  methylation  33.15 
 
 
172 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000827612  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0552  MSHA pilin protein MshA  60.61 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00386307  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3983  methylation site containing protein  35.59 
 
 
165 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0364  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  30.06 
 
 
163 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0735599  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02523  hypothetical protein  38.78 
 
 
163 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0396  methylation site containing protein  34.81 
 
 
169 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0195536  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0573  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  33.33 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.200044 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4410  methylation site containing protein  56.16 
 
 
175 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000246782  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3296  methylation site containing protein  34.48 
 
 
173 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0067  hypothetical protein  48.05 
 
 
169 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4408  MSHA pilin protein MshA  34.3 
 
 
170 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00456827  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003563  type II secretory pathway pseudopilin PulG  34.27 
 
 
163 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0473  methylation site containing protein  32.77 
 
 
174 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0327  methylation site containing protein  30.49 
 
 
179 aa  70.9  0.000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0267191  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1380  methylation site containing protein  38.95 
 
 
190 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0568  methylation site containing protein  34.5 
 
 
169 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.238644  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4105  MSHA pilin protein MshA  59.65 
 
 
171 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3478  methylation site containing protein  62.5 
 
 
169 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000141512  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0898  hypothetical protein  60.34 
 
 
172 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3464  hypothetical protein  60.34 
 
 
172 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0907  hypothetical protein  60.34 
 
 
172 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0872  hypothetical protein  60.34 
 
 
172 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1141  V10 pilin  29.59 
 
 
163 aa  67.4  0.00000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0477  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin A  44.87 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3781  hypothetical protein  62.07 
 
 
172 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3821  hypothetical protein  41.77 
 
 
173 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00258  MSHA pilin protein MshA  41.41 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4569  MSHA pilin protein MshA  51.67 
 
 
187 aa  65.5  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442923  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3315  pilin, putative  41.3 
 
 
185 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.540059  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0842  hypothetical protein  52.17 
 
 
193 aa  64.3  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1956  hypothetical protein  36.81 
 
 
189 aa  63.5  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0620526  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2913  hypothetical protein  51.72 
 
 
182 aa  63.2  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2827  MSHA pilin protein MshA  46.03 
 
 
178 aa  62  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.99325  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03692  hypothetical protein  41.79 
 
 
151 aa  62  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0856  methylation site containing protein  57.14 
 
 
182 aa  62.4  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3689  pilin, putative  42.27 
 
 
186 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4255  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  32.58 
 
 
176 aa  62  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0760  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  53.7 
 
 
156 aa  62  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014468  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3989  pilin, putative  39.25 
 
 
187 aa  61.6  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.387559 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3690  methylation site containing protein  43.33 
 
 
185 aa  61.2  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3074  pilin, putative  40.7 
 
 
178 aa  60.8  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0576  hypothetical protein  46.77 
 
 
174 aa  60.8  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0726397 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1066  pilin, putative  39.8 
 
 
187 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00196226  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3758  hypothetical protein  46.77 
 
 
174 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0964  pilin, putative  39.8 
 
 
187 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0885526  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3326  pilin, putative  39.8 
 
 
187 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0266287  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1033  pilin, putative  39.8 
 
 
187 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0234716  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2521  hypothetical protein  39.13 
 
 
193 aa  59.3  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002375  MSHA pilin protein MshA  28.95 
 
 
168 aa  58.9  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0138724  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1972  prepilin-type cleavage/methylation  29.28 
 
 
177 aa  58.9  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0530  hypothetical protein  43.18 
 
 
192 aa  58.5  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0976  pilin, putative  38.38 
 
 
180 aa  58.5  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0485556  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3866  hypothetical protein  72.97 
 
 
191 aa  58.2  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0883  general secretion pathway protein H  53.85 
 
 
146 aa  57.8  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0109332  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3316  methylation site containing protein  55.36 
 
 
177 aa  57.4  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.192216  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4159  hypothetical protein  67.57 
 
 
193 aa  56.6  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3520  methylation site containing protein  74.29 
 
 
201 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0435  methylation site containing protein  74.29 
 
 
201 aa  57  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0464  hypothetical protein  70.27 
 
 
191 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1109  hypothetical protein  43.75 
 
 
166 aa  56.6  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2452  methylation site containing protein  38.61 
 
 
197 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00816638  normal  0.444869 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3698  methylation site containing protein  67.57 
 
 
192 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.452925  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0448  hypothetical protein  67.57 
 
 
191 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3217  hypothetical protein  51.72 
 
 
108 aa  55.1  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000170582 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0366  N-terminal methylation  43.28 
 
 
132 aa  54.3  0.0000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0321  hypothetical protein  53.06 
 
 
185 aa  53.1  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0183031  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1141  MSHA pilin protein MshB  43.33 
 
 
126 aa  52.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01338  hypothetical protein  39.29 
 
 
195 aa  52.4  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2828  MSHA pilin protein MshC  50.91 
 
 
162 aa  52  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4570  MSHA pilin protein MshB  42.59 
 
 
229 aa  51.6  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.527275  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0324  hypothetical protein  46 
 
 
167 aa  51.6  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00212965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>