More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0356 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0356  histidine kinase  100 
 
 
359 aa  736  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.143013  decreased coverage  1.13905e-08 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0346  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  98.61 
 
 
359 aa  728  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.35429  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  98.05 
 
 
359 aa  724  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0353  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  97.77 
 
 
359 aa  723  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0352  sensor histidine kinase, putative  75.42 
 
 
359 aa  553  1e-156  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0323  putative signal transduction histidine kinase  73.26 
 
 
359 aa  551  1e-156  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3817  putative signal transduction histidine kinase  73.54 
 
 
359 aa  552  1e-156  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3620  putative signal transduction histidine kinase  72.98 
 
 
359 aa  548  1e-155  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  57.76 
 
 
367 aa  404  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  2.14794e-08 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  57.14 
 
 
363 aa  387  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3474  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  54.12 
 
 
354 aa  363  2e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0358  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  46.82 
 
 
364 aa  317  3e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3821  sensor histidine kinase, putative  33.8 
 
 
380 aa  188  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03364  sensor histidine kinase, putative  36.96 
 
 
422 aa  181  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1265  histidine kinase  34.25 
 
 
386 aa  165  1e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.99067 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 
404 aa  149  5e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.5208 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3872  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 
376 aa  144  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0238476  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0289  putative two-component system sensor kinase  34.31 
 
 
423 aa  144  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.159302  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0184  putative signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 
390 aa  143  5e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709555  normal  0.941469 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02210  signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 
372 aa  142  1e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3005  histidine kinase  36.18 
 
 
386 aa  138  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00188406  hitchhiker  4.57887e-05 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4752  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 
393 aa  135  1e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5201  sensor histidine kinase  26.42 
 
 
376 aa  134  4e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5598  sensor histidine kinase  26.42 
 
 
376 aa  134  4e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0310  hypothetical protein  27.46 
 
 
361 aa  131  2e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.720618  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5151  histidine kinase  29.14 
 
 
376 aa  131  2e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5051  sensor histidine kinase  26.63 
 
 
376 aa  130  2e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5476  sensor histidine kinase  26.63 
 
 
376 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.324928  hitchhiker  3.47721e-11 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5445  sensor histidine kinase  26.63 
 
 
376 aa  129  8e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5035  sensor histidine kinase  26.63 
 
 
376 aa  128  1e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 
368 aa  127  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.254929 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5476  sensor histidine kinase  26.63 
 
 
376 aa  127  4e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412372  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01000  signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 
372 aa  126  7e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5532  sensor histidine kinase  27.27 
 
 
376 aa  125  8e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5483  sensor histidine kinase  27.2 
 
 
376 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1623  histidine kinase  28.43 
 
 
383 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244207  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0888  sensor histidine kinase, putative  27.55 
 
 
364 aa  124  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000307966  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1721  histidine kinase  33.18 
 
 
399 aa  123  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1291  sensor histidine kinase  27.12 
 
 
364 aa  122  1e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  2.27861e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0762  histidine kinase  26.2 
 
 
437 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.332583 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0504  histidine kinase  35.82 
 
 
407 aa  117  2e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.991268 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0654  histidine kinase  26.48 
 
 
385 aa  117  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4837  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 
420 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.264093  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2064  histidine kinase  33.17 
 
 
400 aa  117  4e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0117  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  28.2 
 
 
382 aa  116  5e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0493339  normal  0.135679 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2958  histidine kinase  34.74 
 
 
405 aa  115  1e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00418093  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1938  histidine kinase  33.9 
 
 
363 aa  112  7e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1640  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
369 aa  110  4e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4573  histidine kinase  32.99 
 
 
396 aa  110  4e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159455  normal  0.0817819 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06610  signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 
404 aa  109  8e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5480  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 
404 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.500623  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1587  histidine kinase  25.9 
 
 
439 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.230024  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2544  putative signal transduction histidine kinase  30 
 
 
363 aa  107  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.424204  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0906  histidine kinase  33.33 
 
 
381 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 
412 aa  103  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03850  signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 
418 aa  103  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147645  normal  0.231181 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06330  signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 
399 aa  103  6e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03390  signal transduction histidine kinase  39.05 
 
 
388 aa  103  7e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1809  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 
389 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.13648 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 
382 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.935263  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02860  signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 
408 aa  100  4e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11520  Histidine kinase  34.66 
 
 
364 aa  100  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.10079  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0287  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  34.52 
 
 
370 aa  99.8  7e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.144944 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04460  two-component system sensor protein  28.08 
 
 
378 aa  98.6  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5264  histidine kinase  28.95 
 
 
376 aa  97.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5479  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 
434 aa  97.8  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.4 
 
 
403 aa  97.4  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0623  sensor protein UhpB  32.38 
 
 
527 aa  96.7  6e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 
394 aa  96.3  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.61 
 
 
370 aa  96.3  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1679  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.14 
 
 
426 aa  95.9  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484765  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 
397 aa  95.9  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3655  histidine kinase  32.4 
 
 
611 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00917925 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.25 
 
 
363 aa  94.7  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000104287  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1409  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  26.25 
 
 
363 aa  94.7  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00593294  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.4 
 
 
398 aa  95.1  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3039  histidine kinase  28.07 
 
 
376 aa  94.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0758324  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3023  response regulator  24.01 
 
 
597 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  1.1368e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  28.21 
 
 
433 aa  94  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3288  histidine kinase  32.5 
 
 
375 aa  93.2  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.345987  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  33.66 
 
 
462 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 
464 aa  91.3  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 
441 aa  91.3  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2769  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  29.28 
 
 
786 aa  91.3  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3054  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  26.83 
 
 
382 aa  90.9  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.6 
 
 
440 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.33 
 
 
386 aa  90.5  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4056  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.82 
 
 
351 aa  90.5  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.022218 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.84 
 
 
425 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944202  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0092  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.48 
 
 
726 aa  90.1  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  32.34 
 
 
401 aa  89.4  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.32 
 
 
407 aa  89  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  30.39 
 
 
402 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0194  putative signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 
398 aa  88.2  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.141704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1896  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  31.63 
 
 
391 aa  87.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  28.77 
 
 
442 aa  87  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5402  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.29 
 
 
408 aa  87  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  0.894433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  30.91 
 
 
367 aa  86.7  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1510  histidine kinase  30.3 
 
 
378 aa  86.3  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0382398 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1683  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.94 
 
 
385 aa  86.3  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.884966 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>